RNA id: TCONS_00000618



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00000618
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.49
exon number 1
gene id XLOC_000361
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007112.7
NCBI id CM002885.2
chromosome length 59578282
location 30227391 ~ 30227505 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


agccacagccatatcaccctgcagcccaacacCGTttttactgaagctaagcagggttgagcctggtcagtacctgaatgggaaaccacatggaaaatttaggttgctgttggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000189156

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00003081 lncRNA upstream 147862 30074635 ~ 30079529 (+) False XLOC_000358
TCONS_00002844 lncRNA upstream 147862 30074710 ~ 30079529 (+) False XLOC_000358
TCONS_00002843 lncRNA upstream 147862 30074734 ~ 30079529 (+) True XLOC_000358
TCONS_00000607 lncRNA upstream 417895 29806494 ~ 29809496 (+) True XLOC_000355
TCONS_00000598 lncRNA upstream 718918 29507647 ~ 29508473 (+) True XLOC_000350
TCONS_00000621 lncRNA downstream 495875 30723380 ~ 30727619 (+) False XLOC_000364
TCONS_00000626 lncRNA downstream 626464 30853969 ~ 30857925 (+) False XLOC_000365
TCONS_00002845 lncRNA downstream 627885 30855390 ~ 30859524 (+) True XLOC_000365
TCONS_00000630 lncRNA downstream 826910 31054415 ~ 31055182 (+) False XLOC_000367
TCONS_00003082 lncRNA downstream 913614 31141119 ~ 31144527 (+) False XLOC_000369
TCONS_00000616 mRNA upstream 70393 30103297 ~ 30156998 (+) True XLOC_000359
TCONS_00000610 mRNA upstream 273645 29862074 ~ 29953746 (+) False XLOC_000357
TCONS_00000612 mRNA upstream 350747 29862133 ~ 29876644 (+) True XLOC_000357
TCONS_00000611 mRNA upstream 351367 29862082 ~ 29876024 (+) False XLOC_000357
TCONS_00000609 mRNA upstream 366496 29858032 ~ 29860895 (+) True XLOC_000356
TCONS_00000619 mRNA downstream 194638 30422143 ~ 30438036 (+) True XLOC_000362
TCONS_00000620 mRNA downstream 324272 30551777 ~ 30554973 (+) True XLOC_000363
TCONS_00000622 mRNA downstream 495875 30723380 ~ 30728007 (+) False XLOC_000364
TCONS_00000623 mRNA downstream 495953 30723458 ~ 30734796 (+) False XLOC_000364
TCONS_00000624 mRNA downstream 495956 30723461 ~ 30734363 (+) False XLOC_000364
TCONS_00000617 other upstream 61326 30165953 ~ 30166065 (+) True XLOC_000360
TCONS_00000608 other upstream 367018 29831759 ~ 29860373 (+) False XLOC_000356
TCONS_00000579 other upstream 1147055 29068662 ~ 29080336 (+) False XLOC_000337
TCONS_00000565 other upstream 2225454 27977370 ~ 28001937 (+) False XLOC_000332
TCONS_00000567 other upstream 2231780 27984393 ~ 27995611 (+) True XLOC_000332
TCONS_00000628 other downstream 728420 30955925 ~ 30965004 (+) True XLOC_000366
TCONS_00000632 other downstream 829735 31057240 ~ 31063850 (+) True XLOC_000367
TCONS_00000645 other downstream 1479164 31706669 ~ 31722875 (+) True XLOC_000376
TCONS_00000653 other downstream 1824108 32051613 ~ 32065030 (+) False XLOC_000384
TCONS_00000657 other downstream 2286484 32513989 ~ 32514104 (+) True XLOC_000386