RNA id: TCONS_00074232



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00074232
length 234
RNA type processed_transcript
GC content 0.50
exon number 3
gene id XLOC_037813
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 23383414 ~ 23388075 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


ACATATAACGGTCCGCTCTCCAGACACTGACCGCATCTGACAAAAAaggctgcatcctccagAGGGTGCTTGAAGTGTGCTGCATCATCGTGGCGCGATGAAGgctgtctcatttaaaaaaaaactctaaggCTCCTTCAAATGCAGCCCCCATATGTGTCCTTCGTTTCCCAGTTGGTGTATGGTAAGCGCACTaacgctgttgtcctgtggctgccatcgcatcatcctaGT

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000141524

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00074231 lncRNA downstream 10685 23369422 ~ 23372729 (-) True XLOC_037812
TCONS_00075346 lncRNA downstream 202566 23175871 ~ 23180848 (-) True XLOC_037807
TCONS_00074215 lncRNA downstream 349596 23030108 ~ 23033818 (-) True XLOC_037805
TCONS_00075345 lncRNA downstream 554668 22811800 ~ 22828746 (-) False XLOC_037802
TCONS_00075344 lncRNA downstream 554970 22811800 ~ 22828444 (-) False XLOC_037802
TCONS_00075347 lncRNA upstream 303183 23691258 ~ 23694572 (-) True XLOC_037814
TCONS_00075348 lncRNA upstream 308989 23697064 ~ 23700455 (-) False XLOC_037815
TCONS_00075349 lncRNA upstream 308989 23697064 ~ 23700635 (-) True XLOC_037815
TCONS_00074238 lncRNA upstream 416128 23804203 ~ 23806652 (-) True XLOC_037818
TCONS_00074240 lncRNA upstream 425957 23814032 ~ 23816939 (-) True XLOC_037819
TCONS_00074230 mRNA downstream 283 23369294 ~ 23383131 (-) False XLOC_037812
TCONS_00074229 mRNA downstream 24817 23356774 ~ 23358597 (-) True XLOC_037811
TCONS_00074227 mRNA downstream 129544 23244292 ~ 23253870 (-) False XLOC_037810
TCONS_00074228 mRNA downstream 129544 23244294 ~ 23253870 (-) True XLOC_037810
TCONS_00074226 mRNA downstream 140730 23234233 ~ 23242684 (-) False XLOC_037809
TCONS_00074233 mRNA upstream 352431 23740506 ~ 23747264 (-) False XLOC_037816
TCONS_00074234 mRNA upstream 352534 23740609 ~ 23747409 (-) True XLOC_037816
TCONS_00074235 mRNA upstream 366200 23754275 ~ 23761087 (-) False XLOC_037817
TCONS_00074236 mRNA upstream 372141 23760216 ~ 23765480 (-) True XLOC_037817
TCONS_00074237 mRNA upstream 395781 23783856 ~ 23807032 (-) False XLOC_037818
TCONS_00074223 other downstream 231707 23145210 ~ 23151707 (-) False XLOC_037807
TCONS_00074211 other downstream 554668 22824201 ~ 22828746 (-) True XLOC_037802
TCONS_00074210 other downstream 554970 22821860 ~ 22828444 (-) False XLOC_037802
TCONS_00074155 other downstream 1413347 21938278 ~ 21970067 (-) True XLOC_037773
TCONS_00074151 other downstream 1431399 21920494 ~ 21952015 (-) False XLOC_037773
TCONS_00074248 other upstream 523816 23911891 ~ 23912005 (-) True XLOC_037824
TCONS_00074262 other upstream 728832 24116907 ~ 24120656 (-) False XLOC_037829
TCONS_00074272 other upstream 947088 24335163 ~ 24335279 (-) True XLOC_037835
TCONS_00074273 other upstream 1002812 24390887 ~ 24394382 (-) True XLOC_037836
TCONS_00074274 other upstream 1159804 24547879 ~ 24547996 (-) True XLOC_037837

Expression Profile


//