RNA id: TCONS_00074437



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00074437
length 116
RNA type rRNA
GC content 0.44
exon number 1
gene id XLOC_037916
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 30707839 ~ 30707954 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TCTATCGATTCACCTGTTCTtaacacaatacaatacaacacaatagATCTatgcagggctgtgcccggtcagtatctggatgggaaaccacatgggaaacTAGGTTGTTGCTGGAA

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000179523

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00074435 lncRNA downstream 139311 30565834 ~ 30568528 (-) True XLOC_037914
TCONS_00074987 lncRNA downstream 182560 30517917 ~ 30525279 (-) True XLOC_037912
TCONS_00074431 lncRNA downstream 204461 30490505 ~ 30503378 (-) False XLOC_037911
TCONS_00075381 lncRNA downstream 233361 30458704 ~ 30474478 (-) True XLOC_037910
TCONS_00074422 lncRNA downstream 435989 30271025 ~ 30271850 (-) True XLOC_037904
TCONS_00075382 lncRNA upstream 157699 30865653 ~ 30890495 (-) False XLOC_037918
TCONS_00075383 lncRNA upstream 168689 30876643 ~ 30878216 (-) True XLOC_037919
TCONS_00075384 lncRNA upstream 171766 30879720 ~ 30890396 (-) False XLOC_037918
TCONS_00075385 lncRNA upstream 171766 30879720 ~ 30890441 (-) True XLOC_037918
TCONS_00075386 lncRNA upstream 556458 31264412 ~ 31271608 (-) False XLOC_037924
TCONS_00074434 mRNA downstream 131317 30558508 ~ 30576522 (-) False XLOC_037914
TCONS_00074433 mRNA downstream 152114 30543139 ~ 30555725 (-) True XLOC_037913
TCONS_00074432 mRNA downstream 213112 30490807 ~ 30494727 (-) True XLOC_037911
TCONS_00074430 mRNA downstream 275061 30430188 ~ 30432778 (-) True XLOC_037909
TCONS_00074429 mRNA downstream 322780 30374889 ~ 30385059 (-) True XLOC_037908
TCONS_00074438 mRNA upstream 92922 30800876 ~ 30808073 (-) True XLOC_037917
TCONS_00074439 mRNA upstream 381695 31089649 ~ 31090593 (-) True XLOC_037920
TCONS_00074440 mRNA upstream 397435 31105389 ~ 31108285 (-) True XLOC_037921
TCONS_00074441 mRNA upstream 426953 31134907 ~ 31136008 (-) True XLOC_037922
TCONS_00074445 mRNA upstream 566154 31274108 ~ 31278048 (-) False XLOC_037925
TCONS_00074436 other downstream 27821 30677470 ~ 30680018 (-) True XLOC_037915
TCONS_00074423 other downstream 411048 30296675 ~ 30296791 (-) True XLOC_037905
TCONS_00074401 other downstream 599879 30104920 ~ 30107960 (-) False XLOC_037898
TCONS_00074403 other downstream 599906 30106070 ~ 30107933 (-) True XLOC_037898
TCONS_00074402 other downstream 599925 30105442 ~ 30107914 (-) False XLOC_037898
TCONS_00074442 other upstream 479784 31187738 ~ 31187859 (-) True XLOC_037923
TCONS_00074446 other upstream 566154 31274108 ~ 31314324 (-) True XLOC_037925
TCONS_00074451 other upstream 810800 31518754 ~ 31525029 (-) False XLOC_037926
TCONS_00074461 other upstream 1051552 31759506 ~ 31761529 (-) False XLOC_037929
TCONS_00074471 other upstream 1492696 32200650 ~ 32205543 (-) False XLOC_037937