RNA id: TCONS_00007223



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00007223
length 120
RNA type rRNA
GC content 0.59
exon number 1
gene id XLOC_003747
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007122.7
NCBI id CM002895.2
chromosome length 45484837
location 44851474 ~ 44851593 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GCCACAGCCAGATCACCCTGCAGCCCGAGAGCGGTTACTCactcactgaagctgagcagggctgaggCTGGTCAGTGTCTGGATGTGAGagcacatgggaacactaggctgctgttggca

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000120775

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00008712 lncRNA upstream 48169 44792503 ~ 44803305 (+) True XLOC_003745
TCONS_00008709 lncRNA upstream 98817 44676506 ~ 44752657 (+) False XLOC_003743
TCONS_00008710 lncRNA upstream 98817 44676533 ~ 44752657 (+) False XLOC_003743
TCONS_00008711 lncRNA upstream 157436 44676560 ~ 44694038 (+) True XLOC_003743
TCONS_00008435 lncRNA upstream 249536 44601299 ~ 44601938 (+) True XLOC_003741
TCONS_00008713 lncRNA downstream 56376 44907969 ~ 44911219 (+) False XLOC_003748
TCONS_00008714 lncRNA downstream 56401 44907994 ~ 44911219 (+) False XLOC_003748
TCONS_00008715 lncRNA downstream 56413 44908006 ~ 44911219 (+) True XLOC_003748
TCONS_00008716 lncRNA downstream 284422 45136015 ~ 45143838 (+) False XLOC_003752
TCONS_00007227 lncRNA downstream 284459 45136052 ~ 45143840 (+) True XLOC_003752
TCONS_00007221 mRNA upstream 125186 44723019 ~ 44726288 (+) True XLOC_003744
TCONS_00007217 mRNA upstream 213632 44622019 ~ 44637842 (+) False XLOC_003742
TCONS_00007220 mRNA upstream 216413 44622483 ~ 44635061 (+) True XLOC_003742
TCONS_00007216 mRNA upstream 216414 44617021 ~ 44635060 (+) False XLOC_003742
TCONS_00007219 mRNA upstream 218173 44622476 ~ 44633301 (+) False XLOC_003742
TCONS_00007224 mRNA downstream 81259 44932852 ~ 44936320 (+) True XLOC_003749
TCONS_00007225 mRNA downstream 241273 45092866 ~ 45107913 (+) True XLOC_003750
TCONS_00007226 mRNA downstream 259272 45110865 ~ 45126501 (+) True XLOC_003751
TCONS_00007228 mRNA downstream 301511 45153104 ~ 45158055 (+) False XLOC_003753
TCONS_00007229 mRNA downstream 301533 45153126 ~ 45158056 (+) True XLOC_003753
TCONS_00007206 other upstream 515694 44335666 ~ 44335780 (+) True XLOC_003733
TCONS_00007205 other upstream 516152 44328774 ~ 44335322 (+) True XLOC_003732
TCONS_00007204 other upstream 516563 44324761 ~ 44334911 (+) False XLOC_003732
TCONS_00007203 other upstream 525182 44324761 ~ 44326292 (+) False XLOC_003732
TCONS_00007198 other upstream 826596 44024762 ~ 44024878 (+) True XLOC_003725
TCONS_00007247 other downstream 536605 45388198 ~ 45393530 (+) False XLOC_003764
TCONS_00007249 other downstream 536617 45388210 ~ 45392663 (+) False XLOC_003764
TCONS_00007251 other downstream 540618 45392211 ~ 45394780 (+) False XLOC_003764