RNA id: TCONS_00075395



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00075395
length 252
lncRNA type sense_over
GC content 0.44
exon number 3
gene id XLOC_037971
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 33115926 ~ 33121673 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


tcagccaatcaaacgttATTACGTCATCATTATGAGCCTCCTGCAGAGTCCGCCAAAAACgcaaattcaaaaaagaaaacacacacacacacacacccacgcgcAGGCAACTGCCATTTTCACCAGTGAAGAGGACAAGTGAAGAGGACAAGTGAAGAGgtgtTTTATGGTTGAAAAAGACCAGGCTGAAATCAATGCCTTCCGTAAGGTGTTTAACGAGTCAGACATTCTCCTTTGTTGGTACCATGTAAC

Function


GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00075393 lncRNA downstream 177996 32937829 ~ 32941228 (-) True XLOC_037966
TCONS_00074505 lncRNA downstream 271740 32846154 ~ 32847484 (-) True XLOC_037963
TCONS_00074504 lncRNA downstream 274337 32844013 ~ 32844887 (-) False XLOC_037963
TCONS_00074500 lncRNA downstream 314316 32801738 ~ 32804908 (-) True XLOC_037960
TCONS_00075000 lncRNA downstream 323340 32772475 ~ 32795884 (-) True XLOC_037958
TCONS_00075396 lncRNA upstream 55975 33177648 ~ 33179016 (-) True XLOC_037973
TCONS_00075397 lncRNA upstream 79842 33201515 ~ 33202904 (-) False XLOC_037974
TCONS_00075398 lncRNA upstream 234978 33356651 ~ 33359044 (-) True XLOC_037977
TCONS_00074529 lncRNA upstream 260047 33381720 ~ 33394953 (-) False XLOC_037978
TCONS_00074535 lncRNA upstream 637047 33758720 ~ 33781851 (-) True XLOC_037981
TCONS_00074512 mRNA downstream 11987 33097289 ~ 33107237 (-) True XLOC_037969
TCONS_00074510 mRNA downstream 37246 33080438 ~ 33081978 (-) False XLOC_037968
TCONS_00074511 mRNA downstream 37443 33080440 ~ 33081781 (-) True XLOC_037968
TCONS_00074508 mRNA downstream 56141 33061564 ~ 33063083 (-) False XLOC_037967
TCONS_00074516 mRNA upstream 13209 33134882 ~ 33136990 (-) True XLOC_037972
TCONS_00074517 mRNA upstream 80233 33201906 ~ 33202239 (-) True XLOC_037974
TCONS_00074522 mRNA upstream 201431 33323104 ~ 33329787 (-) False XLOC_037976
TCONS_00074523 mRNA upstream 201437 33323110 ~ 33328948 (-) False XLOC_037976
TCONS_00074525 mRNA upstream 203539 33325212 ~ 33329700 (-) True XLOC_037976
TCONS_00074506 other downstream 234043 32883291 ~ 32885181 (-) True XLOC_037964
TCONS_00074498 other downstream 333687 32785417 ~ 32785537 (-) True XLOC_037959
TCONS_00074494 other downstream 371430 32745088 ~ 32747794 (-) False XLOC_037956
TCONS_00074518 other upstream 125529 33247202 ~ 33249282 (-) False XLOC_037975
TCONS_00074519 other upstream 125690 33247363 ~ 33250079 (-) False XLOC_037975
TCONS_00074520 other upstream 125693 33247366 ~ 33251006 (-) False XLOC_037975
TCONS_00074521 other upstream 127605 33249278 ~ 33250994 (-) True XLOC_037975
TCONS_00074524 other upstream 203199 33324872 ~ 33328944 (-) False XLOC_037976

Expression Profile


//