RNA id: TCONS_00074598


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00074598
length 201
RNA type processed_transcript
GC content 0.49
exon number 2
gene id XLOC_038025
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 36770357 ~ 36770663 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

CTGTTAGGAAACGGACGGACAAACAGGTATGGATGATGATATAGATGCTGACCGAATACACACACCAGATGAGTAGGGGATGGGACAGAACGATGGAGCACCCACCAGATGAGTTACGGAGACGACAACGAGGAAACACACACCTCCAACTGGAACACGgggctgactggacaaactggagaCAAAACAGAGATTAGGTAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000141923

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00075006 lncRNA downstream 23538 36745535 ~ 36746819 (-) True XLOC_038022
TCONS_00075421 lncRNA downstream 357107 36399911 ~ 36413250 (-) True XLOC_038021
TCONS_00075005 lncRNA downstream 774965 35990664 ~ 35995392 (-) True XLOC_038019
TCONS_00075420 lncRNA downstream 937603 35680968 ~ 35832754 (-) True XLOC_038016
TCONS_00074592 lncRNA downstream 1136700 35632293 ~ 35633657 (-) True XLOC_038015
TCONS_00075422 lncRNA upstream 156163 36926826 ~ 36930979 (-) False XLOC_038028
TCONS_00075423 lncRNA upstream 156163 36926826 ~ 36940479 (-) False XLOC_038028
TCONS_00075424 lncRNA upstream 166783 36937446 ~ 36940750 (-) False XLOC_038028
TCONS_00074601 lncRNA upstream 167031 36937694 ~ 36938506 (-) True XLOC_038028
TCONS_00075425 lncRNA upstream 186330 36956993 ~ 36959661 (-) True XLOC_038029
TCONS_00074594 mRNA downstream 895306 35872698 ~ 35875051 (-) True XLOC_038018
TCONS_00074591 mRNA downstream 1136530 35631440 ~ 35633827 (-) False XLOC_038015
TCONS_00074589 mRNA downstream 1212960 35170335 ~ 35557397 (-) False XLOC_038014
TCONS_00074590 mRNA downstream 1435715 35170768 ~ 35334642 (-) True XLOC_038014
TCONS_00074588 mRNA downstream 1615268 35028297 ~ 35155089 (-) False XLOC_038013
TCONS_00074600 mRNA upstream 125594 36896257 ~ 36924388 (-) True XLOC_038027
TCONS_00074602 mRNA upstream 570577 37341240 ~ 37366881 (-) False XLOC_038032
TCONS_00074604 mRNA upstream 570764 37341427 ~ 37367477 (-) False XLOC_038032
TCONS_00074603 mRNA upstream 570764 37341427 ~ 37367477 (-) True XLOC_038032
TCONS_00074605 mRNA upstream 710771 37481434 ~ 37613792 (-) False XLOC_038033
TCONS_00074597 other downstream 4329 36765623 ~ 36766028 (-) True XLOC_038024
TCONS_00074596 other downstream 9063 36760889 ~ 36761294 (-) True XLOC_038023
TCONS_00074595 other downstream 649831 36118960 ~ 36120526 (-) True XLOC_038020
TCONS_00074593 other downstream 1068585 35701655 ~ 35701772 (-) True XLOC_038017
TCONS_00074567 other downstream 1918553 34848860 ~ 34851804 (-) True XLOC_038004
TCONS_00074599 other upstream 11884 36782547 ~ 36782665 (-) True XLOC_038026
TCONS_00074610 other upstream 866294 37636957 ~ 37749919 (-) False XLOC_038033
TCONS_00074611 other upstream 976924 37747587 ~ 37749919 (-) True XLOC_038033
TCONS_00074619 other upstream 1433744 38204407 ~ 38204528 (-) True XLOC_038039
TCONS_00074623 other upstream 1698783 38469446 ~ 38469566 (-) True XLOC_038043

Expression Profile

//