RNA id: TCONS_00000661



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00000661
length 119
RNA type rRNA
GC content 0.48
exon number 1
gene id XLOC_000388
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007112.7
NCBI id CM002885.2
chromosome length 59578282
location 32706109 ~ 32706227 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TGCCACAGCTATattaccctgcagcccaagaccggttactcactgaagctaagcagggctgagcctatcagtacctggatgagaaACCACATGGGAATACGCTACAATTACTGAAGTAA

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000125782

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00000651 lncRNA upstream 687994 32017437 ~ 32018115 (+) True XLOC_000383
TCONS_00002849 lncRNA upstream 693731 32011880 ~ 32012378 (+) True XLOC_000381
TCONS_00003083 lncRNA upstream 694315 32010262 ~ 32011794 (+) True XLOC_000380
TCONS_00000637 lncRNA upstream 1185137 31519239 ~ 31520972 (+) True XLOC_000371
TCONS_00002848 lncRNA upstream 1346790 31356349 ~ 31359319 (+) True XLOC_000370
TCONS_00002850 lncRNA downstream 811575 33517802 ~ 33518823 (+) True XLOC_000394
TCONS_00000683 lncRNA downstream 991114 33697341 ~ 33701916 (+) True XLOC_000399
TCONS_00003084 lncRNA downstream 1525376 34231603 ~ 34234056 (+) False XLOC_000404
TCONS_00002851 lncRNA downstream 1525511 34231738 ~ 34232127 (+) True XLOC_000404
TCONS_00003085 lncRNA downstream 1744432 34450659 ~ 34454447 (+) True XLOC_000408
TCONS_00000658 mRNA upstream 12159 32521469 ~ 32693950 (+) False XLOC_000387
TCONS_00000659 mRNA upstream 12754 32521579 ~ 32693355 (+) False XLOC_000387
TCONS_00000660 mRNA upstream 14403 32528097 ~ 32691706 (+) True XLOC_000387
TCONS_00000655 mRNA upstream 320444 32341484 ~ 32385665 (+) False XLOC_000385
TCONS_00000656 mRNA upstream 363158 32341734 ~ 32342951 (+) True XLOC_000385
TCONS_00000662 mRNA downstream 85693 32791920 ~ 32793644 (+) True XLOC_000389
TCONS_00000665 mRNA downstream 511684 33217911 ~ 33283689 (+) True XLOC_000391
TCONS_00000666 mRNA downstream 615947 33322174 ~ 33324476 (+) False XLOC_000392
TCONS_00000667 mRNA downstream 616328 33322555 ~ 33334732 (+) False XLOC_000392
TCONS_00000668 mRNA downstream 622630 33328857 ~ 33332061 (+) True XLOC_000392
TCONS_00000657 other upstream 192005 32513989 ~ 32514104 (+) True XLOC_000386
TCONS_00000653 other upstream 641079 32051613 ~ 32065030 (+) False XLOC_000384
TCONS_00000645 other upstream 983234 31706669 ~ 31722875 (+) True XLOC_000376
TCONS_00000632 other upstream 1642259 31057240 ~ 31063850 (+) True XLOC_000367
TCONS_00000628 other upstream 1741105 30955925 ~ 30965004 (+) True XLOC_000366
TCONS_00000663 other downstream 509014 33215241 ~ 33216718 (+) False XLOC_000390
TCONS_00000664 other downstream 509016 33215243 ~ 33216083 (+) True XLOC_000390
TCONS_00000675 other downstream 695631 33401858 ~ 33455232 (+) True XLOC_000393
TCONS_00000681 other downstream 977004 33683231 ~ 33693904 (+) True XLOC_000398
TCONS_00000684 other downstream 1028791 33735018 ~ 33735134 (+) True XLOC_000400