RNA id: TU247001


Basic Information

Item Value
RNA id TU247001
length 12720
lncRNA type intronic
GC content 0.36
exon number 2
gene id G208507
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047607.1
NCBI id CM018553.1
chromosome length 26458119
location 9846084 ~ 9858882 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome
species striped catfish
(Pangasianodon hypophthalmus)

Sequence

CAActtctgaatatatatatatatgtatgtgtgtttggatgGCTTGTGCGTTTCCCTTAAAGTCATAATGCTGAcagttgaattttatttttattctgactTGATTATAACCATCATGCAAAAATCTGAActtggagaaaagaaaaaaaaaaaaaacaatagggaAGAAAATGGCATATTAGTGCATGACTTTATACTTGGATAATTATAGAATTGATAATATTTGGATAAGTATAGAAAACCTTTGTGAAAGTACGTCTGCAATGCCTGTAGAAGAAAAAAGTAATCATTGAATGATGCTTTAAAAGTTAGCGAGTGCAGGAATGTGGAATTTGGTACATGTTAGTTCAGAGAAGTTTCACCATTGCTGTGTGTTGGGTAGTGCAGTACTGGTGGGGGTTTTCTTTGCTGTATGTTTTGTTAAGGTCACTCCCTTGCCAATAGTCACATTAATTATACAGTAATTGGGTGTTTTGTAAAGCTATTTTTGTACTAAATAGAAGCTGTTTTGTGACCATTTAATTCCTAGGTCTCCATTATGAGTGACCTGTCTTTCAGCATTTGTAGAAGTGCTAGACTGCCCTTTATGATGGCGAGTAGAATGGAAGGTGTTGTTTTTGGGGCGGAAACTATTTTTTTAAGACTGTGATTGATCTGTTGTCTTTATAGaggaatttaatatttaagtgaCAGTTTTGGTACAGTAAAAAGAAGCTCATATCAAAGGGGTAACTATGGTTATTTTGGACTATCTTGTCTCTGCATGTCGTTgcattagaaagagtgcatgaAAAGAAGCAATGACTGGTGTGACTTTATAAGAGGAAACATGTAAACAAATTAGTTGCATATTATActcatattatatttttctctgtattgcataatattttgtattttgtgtgatTAGCTGAAAAATGTGCAGTGAAAATGTATAATGGGAGTCTTAAGCCATAGCAGTTGCCTGCTTGCTCcccctccctctttttctctcttctcttctcacttGATCAccctcctttctctccatctccattcGTGATCATAGTACTACAGAAGGCAAAGGGAGGAGCTAAAGCAAGAGGGGGAGCGACCAATCAGGAACCACGAACACCTGTGTGCACATTCTGAGAAACAGTTGACTGTGTTGCATGAGAGGCCACCTCTCTCtcccagaaacacacacacacacacacacacacacacacatatgtacatatatatatatatatatatgggtgtgtgtgtgcactcttcCTTTCTTCCCCTGGTTCTCTTCCTCTCATACAATCAAGCTAGAACACCGGGCGCACACACCCACAAAAGAAGTGCAATTCTAGCATTTAATTGTATTCCATATGGTAGTTACCTGCTACCAGGCTAGTAGAATGTACATGTAGGCGTGCTTTCAGCTTGGTCACTTGACCAGCGTGACTCTCAGTGGGCTTGCTTGTTCAGGAGAGGAGAAGAACTGCGAGAACAAGGGAAGAGGAGCGGCGAGGGGGAGGGGGATAGGGATTGTAGGGGCGTTGTACAATGACACTTCCTCCAGGGCTTCCCTTCTCCGCCATTGTGGATTGTCTCAAAATGAGGACTGGAGCTTTGGGTGTGGATAAGAAAAGCAATTAAAGATTGGAAGCGAGAAAGACACGTCTGCTCCATGCTTGTTTGTAGATGCTGGCGGTGTGGTAGGGTTAAAATATGTGCTGCTGTCTGTTTAAGAAGGTTCCTCCCTGTTAACCCCTTCCCCATTTTTAACCATCTGTCCTGTTTTTTAAGTGGGATGAATCCCTATATGCTGTGGGTGCTGTTGTGTGTAAGCAGCCTTAACATAGCACCAGCATGTAGCCTACAAACAAGCAGgccttttggaaaaaaaaatgcatgaaacaaggtaaaaatgaaatgaagtaatATGTAGAGAATGAGTGTGTAGAAGGATTGATGATGAAACAATAAATAGTGTGGTGGTTGCATTTCAGGCATTTGTTCATGTCCATACATCAAGGAAGCAGTGATGAAAAGgcaaagaacttttttttttcgcttcCCTAAATCGTTGGATTGTACGCAAGTGCCTACTTATACATACATTGCACATACGCAAGCACTAAAATAATATCTGTAGTCCTTAACTAGAGCTTCAAGTCATGTGAACTAGAGCACTAGAGGTGGTATATAATgaggtcagagctgttgttgTGAAATAAAATTTCCAGCTTCGCTTCTCCACCTACTAAGAGGAATGTCAGGCTGGTGAAGAATGACCAAAGAGAATTTTTTTGCAGAGAAGAACACGTCCAACAGGTggtcctgggaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagatatattttcaTGACTCGGAAATGAGCAAACagcaaacattcagcttttGTGTGTAGGTTTTATTAAATAGCCATAAATGGCCATTTGTGAAAAAGTTCATACAAACATTTCACCAGTTAAATTACTGTTACTTTGTGCATTTTGTCCTAAATGTGTCCATCTCCTTCAGTATTTGTAAACTGTGGGTAAGCACATAGACAAAGCTTTGTGAAAGAAAAAGCACATTTCAAGTTTCAGAAAAGGCTTGTTGAAAATCCCAATggaacttattttaaaaaatttgtttttgggtgggggggtgttttttttttttttttttcttcttatgtttaatatgtaaattaatggagttaaaatatcaaaaaaaaatgtttttgttctacTGTTAAGCTAAATGATAAAGCTTTGagtgattacactttttttatatttactatattttgcTGCAGGTAGGAAATTGgtgaaatacattttacaacTCAAAACACTGCTAAGTGTTCagaaatttcaaaaataaaaaatgtatggaaattttaaaaacttgCTTTTAGTTAGGTTTGTGTAGCTATTACATTTCATAATTGATTTTGATTTGGTGTAATTTTGCACATAGCAAATACATGGTCAGAGGGGATGATTCCccaaaagaccaaaaaaatcctgttgattttttttcccctctgatgTAAGGACCTCTGCGTCTTGCTGCCACCCCCCCTGTAGCTCTCTTTGTGTTGCTGCTGAACGGGGCTCTCTGAAAGCATAGGCGCACCATAAATACTTGCCAAGGAGGGGGAGGGAAAACTCTGAACTTAAAATTCGTTAACTTCTATCTCTCAAACTGAGAGGCTGACAGTTTTACCATGTACCTATAGGCGAGAGAAAAGATGAAAGTGGCAGGAAGTCCCTGAAGAGTACAGCAACAGGGTAGAAGcgtcagatttatttatttatttttaattcttaccAGACAACATTGGTTTGAAAAGTTCTAcctattttaatattcaaattttaTGTCCTAGCATGTTCTACTATTCAAATGTCTTACCTATATATGCATGCATTAGTTAGCAAAGGCCCTCCTCGCATCTGAGAATGCAAGCTTGGCATTCTGGATAACAAATCAAAGCACCTACCATCCCAACATACAGCAAAGAAACATTTGGCTGTGCAGATTGTGAAACTAAAAGGAAGTGACGTTTTAAAGCAGAGCACAACTAAATGTGACCATAGACTCTTGGCAGCTTTTACAGGAAGATATGgttaaaatcatataaaatataaacccaACATGATTTCTTGGTTAATTTGTTTGGCTTGGAGCGAACATGTAATGTTAGACTAGTAATGTAGATAGCATAACATGCGCTCTCAGCTCCTACAGGTTTATCAGTGCCACATTGTCCtcaatgttttacatttaactGATTAATCAAATGGATTTAAACATTGCCATCTCTATTATTTAGAAAGGGTGTGTGACCTTGGTGGTTGTGATTATTGAATAGACACAGAGTTTTGTCGAATACTTAGTCTGAGCAGGCTGTTTGTCCTATCATAGACAAAGTTTAGTGATCTGCACTTAGGTGGAAATTGGGGGTGTCGTTGCATTGACATCACATTGCTAAACATTAATTCTCATGTTTTTGGAACCCATTAGCTAATAGTTGGACCACTTAGAGTACCCTCACATGGGTTTGTCCTGAAGATGTACTCCAATTTAGTTGATAGTAAACTATATGTCTTGAGCATTTCAAAATGCAACTCGCATATGACTCTTAACAGGTAATTAAAATTATGCATTTGATGCTGACATAAGATTAGTGAAGCAGACTGCATTCTGAAACTGGAACTGGAGCTTTTGTTCCCAGACAAAGCCATTCAGGAGGAAAGTTTGCAAACAGTCCAGTTTGAACACACCTCAGGTGTCTTTGTGGTACATGATGGCTGATATCGAGACTACAGttcaaatgacatttttagTTTGCTTTTACTTTCTGAATACTCACTCTTCTGTTACGTTTCTAAATTTCTGCTtcacttattttctttttccgcATTGTGTTTTAATTGAGGAAGCATGAAGTCATATATTACAGTTACAACATTTGTCTAAAAAGCCACAGTGtacttaatatatttttttaggaTGCAGAATACATTGTGTTGAGCATGAACAGTACATCAGTCAAGCCAGGCGTGGCTATAACCATGCTTTTCACGTAAATACAAGCAAATATTTGCTGTGACCAATAATGGCAATCTTGATGTGTATGACATGAACATTCGAAGTCAGCCATGTAGCCATACAAATATATTGTCACAGTCTGACAGCCTTATTGTTACCGGTGAATTGCTATGCGTTTTGTTATACCCTGATTGCAATAAATAGAAGTAGAATTCAAATAAATATCAGTTACGTGCTATGCATGCATAATTTCATCAACAGTGCAATTACATACAGTTTGTGTTCCCTATAACGTTCACTTGTAACATCAGGTGAAGGTTGTGCATTTAATTGTGGAgtgtacaggtttttttttgtttttttttaaaccattttatatCTCCTACACCTCTGATTGAAATGTATGTGCAACTGCAAAATATATCTATTTTGCCTGAGACAGGATATAATAGAAAAACATGGAGTTAAATCAGCACATGTAGTCAAACTGTGGCAGCATAAGATGGTGGACTGATCGCCAGAAATGAACTGAATCACAGAAGATGGATGCTAATGCAAAGCGTGTCTCTATTCACACTGAGAAAATATAGCTCCAAGcagattttgtttttgcattgtgTGCGTGCTGTTGACTCTTGATGAAACTAAGTGTGAGGGGAAGTGTTCAGGAAAAGAAGACGGTTTTCCAGACATAGTTTGAGCATTCATGATGGACACATGAAAGGTAGAAGggctaattaattatttaatcttGACTGAGACTTGCTTTTTCGCCTACTTTGACATGTGGACTACACATTCAGGGAAAAAGGTAATAGGCTGTACATTTTCAGATGTTAATGCGAGCACCCTCAAGGCTATTTGTTTTACCTTTAGTTAGGTGCTTTTGAAAATATAGTGCACCTATAAAATCCACTTATGCtccataattggaccttaagagATCTTTTTTTGGGGTCATACCTTTTTATATACATTGTTTGTATCTTGGGGAACAAAACGTGTAACTGTACAGTACCTTCTCGCTATATTTGTTAGATTTTTTAATTGTGCGAGATGGGAAGTTTGTTGATTTCATTTCAAgtgagtttttattgtcattcctctactTAACTCCTATatattggaatgaaatgtttcttcagggccatggtgcaacacatagcAATACAGTAGCTcagtacacaggactacataaagtgcagataCATGAGTGTGAAATAAGTGcaaaatatacaatacacaGGACTGTGCATGCTAACTAGACAAGCCAACAGAACAGTATTGGATGGAAGACAACAGTGCAAACTATTGTCTACAAAACTGTAAATTCTATCCTGTCATGCAtttggatagaaaaaaaaagatggagaaatgTGTAACAATTCTTACTGTAAATCCAGGCTGATTTGTACATTTGATGGAAGATATAAGGCAAACATAACCGTTAAAACTTGTGTACGTATGTATTAGACTTGCTAGACTTGTTTGTTCATGCCAGATGTCGAACCATTTTGGCAGAAAAGGGAAATTGGTGAAGTAGAAGCCCAAAGTTGTTGTTCTAAATagttttcttcttatttttaattacttttttcatttctttttttttttttttcatttaaattgatctggtattatttctttttttatatcatttactGCTATGAAGTATATGAAGCTATGAAGTAGCTTAGTGTTTGtatttaattgctgttttttatataaactttttttttgtgcaaggCCAGTTTATAATTAGTTTGAGAAGTGTTTAATTCAcctacatatattttattggcCAGAGAAAGGACAAAGATTGTATAAAAATAGGCCTTGGTGCCTTATCCATAAAATGTAGTGTAATTCTGTGCTACAGGGTCAGTTTAAAGGACAACATTCAACCTATTCCAGGTATAATGGAGGGGAGACTAAATGTGAATTGGTGTTTTTGGATTAGAGATTAGTGTACAAAGATCAGTCTGTAAAGTGTATGATCTGCTTTTTGTGCCAAGAAAATATTAAGCTCAATCAACTGATGGCTGTTAAACTATAAGAAATTGTaagggtttttttgtcttgtttgtgtttgtgccacGGCTCTTAAAAGCCTGACTGAGAATAAATTTCTCCAAGTTGTGTTCGATCATCAGTGTTATGTGGAATGCTTTCGTGTTCTTTAGCAAAACCTGAGTACTAGTATGTTACTACAGACCCTACCGTAGCATTGAAAGCTTTAATCTCATGGTTCAGtaatttattagttattaaatattttttaaatatgtatggtggtttaaaaaataaatattgttttagCTCAGATATATTGTGTTCTCTTACACTTTGTTAACAATGTTACTGTTTACATATGCAGTAACACTTTCATAGCACACCATAGGACCATATAACACCAACGGAAAGCGGGTACTTTTCTTCCTTCTGCAATTCTTCTCTTTGCCTTTACATCTTTGCAGCACCCTCCCACTCAACCTCAATCAGTTAAAATGGAGCCCTTGTGTCACATGGCTTCCAAACAGGCATGTGCTGGTCTGATCATGCTATGTCCTccttctgcacacacactcgaTCATGCTAAAGccacagagagagggggaagGGCCAGCGAACCTCCACCCTTGCTGCAACTCTCCCTCCTCCTTAGCCAAACCTATATGAAATGAGGAGTTTCCCTCACATGATCACTGCATGAGCTGAAAACATGGCGCCTGCTAAGTTGTAGGACCATTTTGTATGTGCACAGGAATGTGATGCCCATACTGTGAAATAATAGTGCTTGGAGAATAGAATTGAGAAGTATTTTGCTACCTACGAAATGGAAATTTTATGacttttaaatatacacagtttaaaaaaaaaatttagtctgtattaataaataaataaatagctctCAAATTTGTAGACAGTTGTAGGGAAAAtgagactttaaaaaaaattttttgtcaTCTGCTTTTTTTACATTCTCAGATTCTCAAGTTGACGAATGGATGATTTAAGTAATATACCAGGTTAATATCACCCTGTGATGTGAAGCCCctgatttttgcagtgtggttgtttttttttttttttttttttttaaccagaccTAGGTTCACTTTCCCTACCAACATTTTCAccataatatttaatacacacaTCAACCCTGTTCCCAGACCTGGTTTAACCAGCGTATTCTGAGTAGACACATTGCCAGACAGTGCTAGACAATGAGCTTTAACATGGGGGAATGAGCTGTAATATGAgcattaaaaaagagagaagttGTCAGAGTGCTGTAGGGGAAGATGGGTTGGTGTTCCCTGGCAGTCAGCTACATATACCATGGAAGATCCCCATGTTCTCAGTATTTACTGATTCAAAAGAATGGGGGTTTACGTCACACTGTTAGAAAGACTGTTTTACCTCCCTTGAAATACACACTGAGAGGAAGCAGAGCAGACTTAAAGATTTCAGAGAtttgcatggtgtgtgtgtgtgtgtatgtatgtatgtatatatatatataagtttcTTAAACAAACAGATGTATGTATATCTTTtgaaattttgtgtatttaaagtgAACATGGGAAATACAGGTACTTGTTATACCTTAATAGTtgcagaaaatgtgttttaccCCCACTGATTAGTttctctataaaaaaaaaagtttaaaggtTTGTCATGCTCAAAGaggctgtgcttttttttaatctaagtaAATCTGTGCTATTTATGTTTGGCAGGAATTATTAAGGATCTGTTATTTCTAAAATTTacttgagacaaaaaaaaatgctatacaaagTGCACAGAGGTGTTTTAAGACTCAAATAGTTCTTTTCCATGTTACCTTTATTGTAAACAGAATGTAGTGATATAATTAAAGATTATCAAGCAGTGATATAGagatgttttacatttttgtcatttgtttttttttttttttaaatggcaagTTTTGTGGCTTGAAAATATCCATTCTCgtttataatttaatgattATCACTACATGGAGTTTCATATATTCTTAAACTTTATTCAGAAgggaaaaatatgtaaaatattgaaAGTATGTGGAAGAGTCTGAATTTAATCCTTGTAATTTCTGCTATCTAAAATATTTCAACTGAATAAATCCATCTATTCCAAGAATATTTTGTTGGTTTAATCACTTAGTATCGGTAAGTTTTGTTcttacatttctttgttttgttttaagctTCATTCAGGGCATTTTCTTTGGATTAATGAGTTtagagaacagaaaagaaaagaaaatagtgAGTAGTGATCAGGAGAATATGATCTTCAGGCAGTTGTCTCAGATTAGTGAGAcatttgtttttgggtttttttttggaaggaaggTGGGGGTcaaagattttaatttaaagtctTAATATACTTTGGAGGAGATTTAATCAGATCTCACCCAATATTTCAATGCCCTTGAGTTTTGTTTCATTGTTCTCGTTCAGTGCGCCTCTTCACGGTGAGGCTGTAACACTGGGTTACCATGTTGGCTGGAAGAACCTTTTTCAGATGGTTAATGGTGATTAGACTATTTAATGAAGAGCAGACGAATGTATTTTTTCCCGAAACCAAACGAGCCATAACCACCGAATTGCTTAAATAACACTGCAACCAATTCGCTTGAAACCCTTCTTGTTTTCAAAAACAGGCGCACATTTGCGCTGTACTTGTGGTGTTTGTGAGGAATCACTCGGGTTTAGACATAACGCAGAATCTGTAGGGGTGTCTGGACGCTGCCAAATtgtttaataatcattaaatcTACGTTGCAGTTTCTTTTAGAAGCTCCTTAATACGTTAGTCTTCAATAATGGCGACGTCTTTTTATGTAGTAGTATATAGAGCGTGGATGCACACGTTTCTATAGCGCTCTACTTTCACACTCCCCCCTCTCCTGTGTCGGGAGTGGGCGGGTCCGTGATAGCGCGCGCCGCCTCTTTCACGCTGCTGTAGTATTCTCGAGTAGCTCTGTGACTTTATGAATGAAGGCAGGTCTCCCCTTCTCCTCTGCCTGTACAGCGCTGCGTAAACGCTGGAGCATTGCAGAGACACGggattaaacaacacattttcttcttacgctttttttttttaaataacacgcAGTGCTGCCCTGTTGCATTTGTCCTACATTTTAAAAGCATCTCGATTGAGCATAAATCGAGCAGTAATGACTTAAGATAATCCTGCAATGTGATATTGAAACATGGAATGACTACTgtactccaaaaaaaaaaaatcttattctAGCACAGTAGTAGTGGTGTTTCAGTATTCTTGTGCCTGTTTTTAATACCATGATTGTACTGATTCTTTAAAACTACATACATTCAATCACAATGCAATGTAGTagcattcatatttcataaaaaatgaaaagggtgaaatgcacacatgcatatgTGGAATATAATGACAGCAGTGCTGACATGGTTGCTAAACAAAGTCCTCGTGGTGTATGTGCCTGGAATAGTAGTCTGCGCGCGCGCACGCATGTGAGCGCGCTTCATTGTGGGTAATTGGGCGTTGTCAGGAGAATATGGCTGCTTTCACTCTAAAATGGCTGAGTGGAAATTCGCTTGTTGTCAACCACATAGCTTGCAGAACAGATAATGGATTAACGTGCGTAAAATAGGCTGACCATTTAGCCGAAAAATATAGCTCATATTTACTTGAATCCTGggttaattttaattatacggcgagtttttattttcatgttgcCTTACAGTAGGCCTGctatcttaaaaaaataataataataaatcctaTTTAGCCAAACACACATGCTCTACTTATACATAGGCTAGGTCTATTCCTAAATACATTTGATAGGCTATTTGCGAGGGAACATCATACATCTGATAAACACCTTTaaagcaagacactacaggtagaGACGTCAATCATTTTCGGGTATTTTTTGGATAAATTGTATCTATAAGATATCATCTCTTACTGTAGTAATTAAAACTACCAAAAAGACAATGTTCTTCCACTTGGTTTGTCCACTCGCGACCACTGCATTATCTTAAACTTAGCAACTTTAAAGAAGGCTTAAGCCCCGCCCACGTCTCCACAGTCACGTGAGGCCATCTAGCCCAGATGTGTTTTCtattataaacagaaaatatgCTGTTTTCTGTTATATCAGTGTATGTGACATGTGACATAGCTAAACGTCAGTTTCCTTTATAAACCGTGTAAAATACACTAGCGTTGAAACATATGAAGTCACATTGTATTTTAAAACCATTTCCCTCAAATCTGTTTCTGGATGACTTGCATTTCAAGAAATTTTTACATGTTCTTTCACTTCCCCAATCAAAAGCTTAATACAGAGGAATTTATCTAAATGTTTAGAATTGTTTGGATTTATGCTAGATTTTATACTGAGAAGccagaaacattttataacagCCTGTGGACTTTTCTTGGTTAAACAGAGAAATTATATTCCAATAAAGTGTCAatttcacagtgaaataaacattttgattcAAACATCAGCTGAAGAGTagatttttagttttagtaGGCCTAAGTGTGCAAATCTCCACACGTTTAATGTGTGTACACTATTCACCTGTAGTGTGTTGCTTTTAAAGAGAAACCAAGACACTACTTGCTTAAAAGCTAtcaataatgatttatttaatataactttacaattaatgttttaattttaaaaatcaattttattaaCAGGGACTTTAACAAGTCCATattcatagaaaatgaatatgaaacCAGAAGGACGGTGGTGAGTTAttttatatctataatatatagCCAGTTTTCATGCAAGAGATTCATATGGGCAAAAATTCCTATTTAGTTTTatgatttataaattttatattatttcaggTAACATAAGTCAGTGACTCCAGTTTATCTATGGAAAATGAAAGCAGGTTTATTTAACTTAAACCTGTAATGGAGGCATTACTCGTTAGCTTGTTGCTGAGCAGAGTGAAAACCTGCTCTGGCTGATTGGCCACATTGTTggtacatggaaaaaaaaatttgatttatatatagatatacatttTCCCCCAAGGAACATTCCTTTCTGATAGTGACACATCCGGTAATTCTGGAGAATGGTAGGTACTAGTAAAGATGATACAATTACTGCTATCATggcttattttttttgtaagtttaCAAAAGCGAATActtaaaaactgtttaaaaaaaaaagctttaaaattctaaaaacctGTATGTGGTTAAGTCTAATTTCTTCTGCACCTGGATGCACCTGAATGACTGCTCCTGTAAAGACGAGTCGGGGGAAAAAGCCGAAGCGCCCTGTTACCTTCCACCtgcaaagtgcattatgggtgcTGAGGATTGCCTGGGCTAGTTTGGATCCTTTCCTATTGCAATATATGTGTAATTTCATGAGAGTGCTGGATATTTGGCATTAGCCattatagtgcactatatagtgaaaaGGGTGTGGTTTGGAGAGCAGACAGGTGGAGCGTCTGTGCATTTCTACTGGAACTACGTAGCACCGTGAAGCAGAAAAACTACATTACCGAcgatttaaagaaaaagaaaaaaaaactcaagagTGTAGAGTCTGTCACATGTTTCAGACTTGCACGTTACCCATTTCATTTGCAGTGAACCAGAAAATCCGGCTTTACACGTGTCGAGATCGTGGGGCCTAAATGTACAGTGCAAAATGCACCAGTTCCTGTATTGTGTTTGTGACTGCGCACTTCTGCAGCCTGCCATGAGAGAAGTGTACACTCGAACTTTTAACGCTTAATGCACAAGGTACTGCGATCACATAAAGCAATCATACAGAGAATACAGACCTAAAACCGTGGTGCATTGTCTCTTAACATATGTGCATTGACGTTTGGTGTAAATGCTGAATGTTATtctcatatttcatttcattcattcattcgtcccATAATTGGAGCAAAAGTAGCCTGCGTGGTGAGTTGCATTACGTTTGTGTGTCAGGTTACACTAAACCGGGGGATTAATAGTACATTTTGCATAAAAACGTATtattactgagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgcctgtgATCAGGAAGGCTAACACTGAGAGCTAGTTTTGTTTTAAGCCTGtttaacatatataataa

Function

GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU246950 lncRNA upstream 98074 9746285 ~ 9748010 (+) True G208472
TU246951 lncRNA upstream 98074 9746850 ~ 9748010 (+) False G208472
TU246862 lncRNA upstream 107218 9737009 ~ 9738866 (+) True G208415
TU246885 lncRNA upstream 112037 9732608 ~ 9734047 (+) True G208430
TU246850 lncRNA upstream 290270 9555612 ~ 9555814 (+) True G208403
TU246996 lncRNA downstream 6095 9864977 ~ 9883127 (+) True G208504
TU246973 lncRNA downstream 180527 10039409 ~ 10061965 (+) False G208488
TU246974 lncRNA downstream 180527 10039409 ~ 10061965 (+) True G208488
TU246978 lncRNA downstream 180527 10039409 ~ 10061965 (+) False G208488
TU247237 lncRNA downstream 362401 10221283 ~ 10221539 (+) True G208700
XM_026916900.2 mRNA upstream 19075 9814084 ~ 9827009 (+) True ube2z
XM_026916012.2 mRNA upstream 34503 9806798 ~ 9811581 (+) True atp5mc1
XM_026916970.2 mRNA upstream 64162 9779523 ~ 9781922 (+) True eve1
XM_026917137.2 mRNA upstream 357543 9477811 ~ 9488541 (+) True nfe2l1a
XM_034309941.1 mRNA upstream 445246 9390424 ~ 9400838 (+) False si:dkey-110g7.8
XM_026916952.2 mRNA downstream 27902 9886784 ~ 9893496 (+) True si:dkey-225f5.4
XM_034310316.1 mRNA downstream 27920 9886802 ~ 9893496 (+) False si:dkey-225f5.4
XM_026917260.2 mRNA downstream 53886 9912768 ~ 9917101 (+) False msl1a
XM_026917258.1 mRNA downstream 53983 9912865 ~ 9917101 (+) True msl1a
XM_026916963.2 mRNA downstream 59080 9917962 ~ 9926203 (+) True casc3
TU246534 other upstream 782769 9061565 ~ 9063315 (+) False nupr1b
XR_003402909.1 other upstream 943407 8896618 ~ 8902677 (+) True LOC113528069
trnas-cga_1 other upstream 1837817 8008186 ~ 8008267 (+) False trnas-cga_1
TU245701 other upstream 1992575 7853191 ~ 7853509 (+) True G207480
trnac-gca_21 other upstream 2546400 7299613 ~ 7299684 (+) True trnac-gca_21
XR_003402918.2 other downstream 85424 9944306 ~ 9979954 (+) False rapgefl1
TU247340 other downstream 490520 10349402 ~ 10417881 (+) False G208781
TU247338 other downstream 513533 10372415 ~ 10417881 (+) False G208781
TU247339 other downstream 554102 10412984 ~ 10417881 (+) True G208781
XR_003402977.1 other downstream 1678165 11537047 ~ 11537165 (+) True LOC113528662

Expression Profile