RNA id: XM_026917302.2


Basic Information

Item Value
RNA id XM_026917302.2
length 10208
RNA type mRNA
GC content 0.40
exon number 7
gene id slc16a2
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047607.1
NCBI id CM018553.1
chromosome length 26458119
location 21236802 ~ 21272507 (-)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome
species striped catfish
(Pangasianodon hypophthalmus)

Sequence

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Function

GO:

id name namespace
GO:0055085 transmembrane transport biological_process
GO:0007417 central nervous system development biological_process
GO:0009790 embryo development biological_process
GO:0016021 integral component of membrane cellular_component
GO:0070324 thyroid hormone binding molecular_function

KEGG:

id description
K08231 SLC16A2; MFS transporter, MCT family, solute carrier family 16 (monocarboxylic acid transporters), member 2

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU254118 lncRNA downstream 332761 20900085 ~ 20904041 (-) False spry1
TU254119 lncRNA downstream 332965 20903098 ~ 20903837 (-) True G214626
TU254012 lncRNA downstream 395168 20841431 ~ 20841634 (-) True G214526
TU253976 lncRNA downstream 455100 20778765 ~ 20781702 (-) True G214493
TU253795 lncRNA downstream 791054 20445523 ~ 20445748 (-) True G214331
TU254446 lncRNA upstream 55153 21327660 ~ 21329675 (-) True G214917
TU254466 lncRNA upstream 81499 21354006 ~ 21356874 (-) False LOC113528016
TU254470 lncRNA upstream 87190 21359697 ~ 21359899 (-) True G214933
TU254478 lncRNA upstream 134363 21406870 ~ 21416430 (-) True G214941
TU254479 lncRNA upstream 134363 21406870 ~ 21425414 (-) False G214941
XM_026916809.2 mRNA downstream 34933 21184962 ~ 21201869 (-) True ints10
XM_026916810.2 mRNA downstream 35060 21184962 ~ 21201742 (-) False ints10
XM_034310189.1 mRNA downstream 35060 21184962 ~ 21201742 (-) False ints10
XM_026917194.2 mRNA downstream 62270 21165851 ~ 21174532 (-) True klb
XM_034309861.1 mRNA downstream 73741 21157480 ~ 21163061 (-) False ube2ka
XM_026916242.2 mRNA upstream 79774 21352281 ~ 21359190 (-) True LOC113528016
XM_026916243.2 mRNA upstream 79776 21352283 ~ 21359190 (-) False LOC113528016
XM_026916545.2 mRNA upstream 88055 21360562 ~ 21367112 (-) True arl9
XM_026916544.2 mRNA upstream 88055 21360562 ~ 21367109 (-) False arl9
XM_034309841.1 mRNA upstream 96247 21368754 ~ 21380216 (-) True srp72
TU254170 other downstream 209543 21014439 ~ 21027259 (-) True fgf2
trnal-aag_9 other downstream 823872 20412849 ~ 20412930 (-) True trnal-aag_9
TU253598 other downstream 1173312 20040423 ~ 20063490 (-) False slc2a9l2
TU253095 other downstream 1788468 19444989 ~ 19448334 (-) False rbbp6
trnat-cgu_6 other downstream 2160462 19076269 ~ 19076340 (-) True trnat-cgu_6
LOC113546932 other upstream 399655 21672162 ~ 21683433 (-) True LOC113546932
LOC117598919 other upstream 400315 21672822 ~ 21673330 (-) True LOC117598919
LOC117598868 other upstream 403131 21675638 ~ 21676807 (-) True LOC117598868
TU254923 other upstream 403764 21676271 ~ 22215359 (-) False G215187
LOC117598954 other upstream 411517 21684024 ~ 21684645 (-) True LOC117598954

Expression Profile