RNA id: TU214923


Basic Information

Item Value
RNA id TU214923
length 16644
lncRNA type inter_gene
GC content 0.40
exon number 2
gene id G181599
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047605.1
NCBI id CM018551.1
chromosome length 26640196
location 14960885 ~ 14977551 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome
species striped catfish
(Pangasianodon hypophthalmus)

Sequence

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Function

GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU214912 lncRNA upstream 30023 14867927 ~ 14930862 (+) True G181588
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XM_026913598.2 mRNA downstream 73038 15050589 ~ 15079767 (+) False frem1b
XR_004579090.1 other upstream 249158 14708927 ~ 14711727 (+) False pdzk1ip1
XR_004579085.1 other upstream 314063 14622543 ~ 14646822 (+) True si:dkey-121a11.3
TU214729 other upstream 366270 14589919 ~ 14594615 (+) False ankrd29
TU214656 other upstream 397919 14561690 ~ 14562966 (+) False LOC113540185
TU214440 other upstream 786667 14165026 ~ 14174218 (+) True G181175
TU215983 other downstream 1277512 16255063 ~ 16255852 (+) False LOC113532318
XR_003403746.1 other downstream 1602685 16580236 ~ 16580303 (+) True LOC113537281
TU216336 other downstream 1605752 16583303 ~ 16584943 (+) True G182819
TU216450 other downstream 1935707 16913258 ~ 16922922 (+) True G182877
trnak-cuu_26 other downstream 2052321 17029872 ~ 17029944 (+) True trnak-cuu_26

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