RNA id: TCONS_00000695


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00000695
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.49
exon number 1
gene id XLOC_000407
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007112.7
NCBI id CM002885.2
chromosome length 59578282
location 34400240 ~ 34400354 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TGAAACAGCCATTTCACCCTGCAGCACAAGACTGGTTGCTCACTGAAGCTAGGAAGGGCTGAGCCTGgctagtacctggatgggagaaaaCATGGGAAATCTAGTCATGTGTAAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000180998

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00003084 lncRNA upstream 166184 34231603 ~ 34234056 (+) False XLOC_000404
TCONS_00002851 lncRNA upstream 168113 34231738 ~ 34232127 (+) True XLOC_000404
TCONS_00000683 lncRNA upstream 698324 33697341 ~ 33701916 (+) True XLOC_000399
TCONS_00002850 lncRNA upstream 881417 33517802 ~ 33518823 (+) True XLOC_000394
TCONS_00000651 lncRNA upstream 2382125 32017437 ~ 32018115 (+) True XLOC_000383
TCONS_00003085 lncRNA downstream 50305 34450659 ~ 34454447 (+) True XLOC_000408
TCONS_00002852 lncRNA downstream 457014 34857368 ~ 34859323 (+) False XLOC_000414
TCONS_00002853 lncRNA downstream 457014 34857368 ~ 34861057 (+) False XLOC_000414
TCONS_00002854 lncRNA downstream 458452 34858806 ~ 34859323 (+) True XLOC_000414
TCONS_00003086 lncRNA downstream 633940 35034294 ~ 35093512 (+) False XLOC_000415
TCONS_00000694 mRNA upstream 102837 34295925 ~ 34297403 (+) True XLOC_000406
TCONS_00000693 mRNA upstream 138247 34243650 ~ 34261993 (+) True XLOC_000405
TCONS_00000691 mRNA upstream 166302 34203858 ~ 34233938 (+) False XLOC_000404
TCONS_00000690 mRNA upstream 167991 34203817 ~ 34232249 (+) False XLOC_000404
TCONS_00000692 mRNA upstream 168002 34224360 ~ 34232238 (+) False XLOC_000404
TCONS_00000696 mRNA downstream 96501 34496855 ~ 34556723 (+) False XLOC_000409
TCONS_00000697 mRNA downstream 126859 34527213 ~ 34558804 (+) True XLOC_000409
TCONS_00000698 mRNA downstream 285051 34685405 ~ 34694365 (+) False XLOC_000410
TCONS_00000700 mRNA downstream 285116 34685470 ~ 34694359 (+) True XLOC_000410
TCONS_00000701 mRNA downstream 295019 34695373 ~ 34706763 (+) False XLOC_000411
TCONS_00000688 other upstream 277268 34122880 ~ 34122972 (+) True XLOC_000403
TCONS_00000685 other upstream 432967 33967157 ~ 33967273 (+) True XLOC_000401
TCONS_00000684 other upstream 665106 33735018 ~ 33735134 (+) True XLOC_000400
TCONS_00000681 other upstream 706336 33683231 ~ 33693904 (+) True XLOC_000398
TCONS_00000675 other upstream 945008 33401858 ~ 33455232 (+) True XLOC_000393
TCONS_00000699 other downstream 285091 34685445 ~ 34688642 (+) False XLOC_000410
TCONS_00000704 other downstream 295160 34695514 ~ 34706470 (+) False XLOC_000411
TCONS_00000714 other downstream 1094550 35494904 ~ 35515273 (+) False XLOC_000418
TCONS_00000717 other downstream 1390538 35790892 ~ 35803084 (+) True XLOC_000419
TCONS_00000728 other downstream 1753907 36154261 ~ 36154377 (+) True XLOC_000425