RNA id: TCONS_00008801


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00008801
length 32813
lncRNA type inter_gene
GC content 0.34
exon number 1
gene id XLOC_004169
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007122.7
NCBI id CM002895.2
chromosome length 45484837
location 27543578 ~ 27625465 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

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TCONS_00007976 lncRNA upstream 158303 27783758 ~ 27806767 (-) True XLOC_004173
TCONS_00008474 lncRNA upstream 175404 27800859 ~ 27809715 (-) True XLOC_004174
TCONS_00007985 lncRNA upstream 203775 27829230 ~ 27830335 (-) False XLOC_004176
TCONS_00007993 lncRNA upstream 453188 28078643 ~ 28079691 (-) False XLOC_004178
TCONS_00007966 mRNA downstream 54982 27511277 ~ 27537661 (-) False XLOC_004168
TCONS_00007967 mRNA downstream 54993 27520321 ~ 27537650 (-) False XLOC_004168
TCONS_00007968 mRNA downstream 55050 27521513 ~ 27537593 (-) True XLOC_004168
TCONS_00007961 mRNA downstream 91616 27486584 ~ 27501027 (-) True XLOC_004166
TCONS_00007958 mRNA downstream 535071 26704181 ~ 27057572 (-) False XLOC_004164
TCONS_00007970 mRNA upstream 19069 27644524 ~ 27702778 (-) False XLOC_004170
TCONS_00007971 mRNA upstream 21220 27646675 ~ 27702835 (-) True XLOC_004170
TCONS_00007972 mRNA upstream 79575 27705030 ~ 27739049 (-) False XLOC_004171
TCONS_00007973 mRNA upstream 81124 27706579 ~ 27738489 (-) False XLOC_004171
TCONS_00007975 mRNA upstream 120163 27745618 ~ 27778831 (-) True XLOC_004172
TCONS_00007964 other downstream 89323 27503232 ~ 27503320 (-) True XLOC_004167
TCONS_00007963 other downstream 89511 27503017 ~ 27503132 (-) False XLOC_004167
TCONS_00007960 other downstream 844214 26748292 ~ 26748429 (-) True XLOC_004165
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TCONS_00007950 other downstream 1217125 26373998 ~ 26375518 (-) True XLOC_004160
TCONS_00007974 other upstream 88009 27713464 ~ 27719269 (-) True XLOC_004171
TCONS_00007992 other upstream 452693 28078148 ~ 28086924 (-) False XLOC_004178
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TCONS_00008030 other upstream 2184242 29809697 ~ 29816202 (-) False XLOC_004195

Expression Profile

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