RNA id: TCONS_00000705


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00000705
length 601
RNA type mRNA
GC content 0.35
exon number 23
gene id XLOC_000412
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007112.7
NCBI id CM002885.2
chromosome length 59578282
location 34696503 ~ 34727517 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

acattatagTGTAATTGTGGAATCAGAtgatttctttagttacttatacaaaatccaggagaatataaatatTGTTCCCCTGCTATttgatggtaagttTATCGagagaacaaaaaaggatatcggtgatctaatgatttgccttaatTTTGTGTCTGaggtcctCAAAAACGTTTGTGATGTGACAACCAGTTTTGAAGGGGTAGCTATAAAGGTAAACAGTAAGTTAGTTTTTACCCCCTTTGACAAAGAGCTATTTcaacaaaTAATAAAATCACAAGCAATgataaataaagcaaaactaaaaaagaaGCACACAAACCGAATAATACCTCTATTTTGCAACAGCCCATCAAAGATACGTCACACCCTAAATAACTTTAAACACgttgtgtttttcaaagttaaatttgttaactctgataataaaattcagttgatgtattttaaggatgccggggttaaacccctactcttttcgaaggacgaaatgtcactggagcggtgttcTCATAAGGATCATTTAAGTTCATCCAGGCGTGATGATGAGATGTTGCAAACGTTCATTTCCTCAAATgaagggtgtctctccggctcaatc

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000186106

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00003085 lncRNA upstream 242056 34450659 ~ 34454447 (+) True XLOC_000408
TCONS_00003084 lncRNA upstream 462447 34231603 ~ 34234056 (+) False XLOC_000404
TCONS_00002851 lncRNA upstream 464376 34231738 ~ 34232127 (+) True XLOC_000404
TCONS_00000683 lncRNA upstream 994587 33697341 ~ 33701916 (+) True XLOC_000399
TCONS_00002850 lncRNA upstream 1177680 33517802 ~ 33518823 (+) True XLOC_000394
TCONS_00002852 lncRNA downstream 129851 34857368 ~ 34859323 (+) False XLOC_000414
TCONS_00002853 lncRNA downstream 129851 34857368 ~ 34861057 (+) False XLOC_000414
TCONS_00002854 lncRNA downstream 131289 34858806 ~ 34859323 (+) True XLOC_000414
TCONS_00003086 lncRNA downstream 306777 35034294 ~ 35093512 (+) False XLOC_000415
TCONS_00003087 lncRNA downstream 348950 35076467 ~ 35093512 (+) True XLOC_000415
TCONS_00000698 mRNA upstream 2138 34685405 ~ 34694365 (+) False XLOC_000410
TCONS_00000700 mRNA upstream 2144 34685470 ~ 34694359 (+) True XLOC_000410
TCONS_00000697 mRNA upstream 137699 34527213 ~ 34558804 (+) True XLOC_000409
TCONS_00000696 mRNA upstream 139780 34496855 ~ 34556723 (+) False XLOC_000409
TCONS_00000694 mRNA upstream 399100 34295925 ~ 34297403 (+) True XLOC_000406
TCONS_00000707 mRNA downstream 36022 34763539 ~ 34786959 (+) False XLOC_000413
TCONS_00000708 mRNA downstream 36026 34763543 ~ 34807059 (+) True XLOC_000413
TCONS_00000709 mRNA downstream 466937 35194454 ~ 35234700 (+) True XLOC_000416
TCONS_00000711 mRNA downstream 745702 35473219 ~ 35491005 (+) False XLOC_000417
TCONS_00000710 mRNA downstream 745702 35473219 ~ 35491005 (+) False XLOC_000417
TCONS_00000699 other upstream 7861 34685445 ~ 34688642 (+) False XLOC_000410
TCONS_00000695 other upstream 296149 34400240 ~ 34400354 (+) True XLOC_000407
TCONS_00000688 other upstream 573531 34122880 ~ 34122972 (+) True XLOC_000403
TCONS_00000685 other upstream 729230 33967157 ~ 33967273 (+) True XLOC_000401
TCONS_00000684 other upstream 961369 33735018 ~ 33735134 (+) True XLOC_000400
TCONS_00000714 other downstream 767387 35494904 ~ 35515273 (+) False XLOC_000418
TCONS_00000717 other downstream 1063375 35790892 ~ 35803084 (+) True XLOC_000419
TCONS_00000728 other downstream 1426744 36154261 ~ 36154377 (+) True XLOC_000425
TCONS_00000735 other downstream 1938026 36665543 ~ 36690899 (+) False XLOC_000428
TCONS_00000740 other downstream 2000780 36728297 ~ 36746569 (+) True XLOC_000429