RNA id: TU375897



Basic Information


Item Value
RNA id TU375897
length 13543
lncRNA type inter_gene
GC content 0.40
exon number 2
gene id G317395
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_047615.1
NCBI id CM018561.1
chromosome length 21248730
location 9444709 ~ 9465969 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome
species striped catfish
(Pangasianodon hypophthalmus)

Sequence


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Function


GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
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XR_004580302.1 lncRNA downstream 239951 9705920 ~ 9711900 (+) True LOC117599959
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XM_034314910.1 mRNA upstream 281515 9033569 ~ 9163194 (+) False LOC113543049
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XM_026925914.2 mRNA downstream 66710 9532679 ~ 9642644 (+) True LOC113533645
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XM_034314569.1 mRNA downstream 323028 9788997 ~ 9827888 (+) False LOC113533145
TU375892 other upstream 29545 9412323 ~ 9415164 (+) True G317390
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XR_004580322.1 other downstream 1070462 10536431 ~ 10562994 (+) False capn10
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TU376560 other downstream 1097866 10563835 ~ 10568896 (+) False eif4e2

Expression Profile