RNA id: TCONS_00010864


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00010864
length 18703
lncRNA type sense_over
GC content 0.29
exon number 1
gene id XLOC_004438
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007123.7
NCBI id CM002896.2
chromosome length 49182954
location 1139690 ~ 1241565 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko04131 Membrane trafficking
ko04031 GTP-binding proteins

JBrowse2

Neighbor

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TCONS_00008921 lncRNA downstream 1371825 2578020 ~ 2607032 (+) True XLOC_004450
TCONS_00010865 lncRNA downstream 1563370 2769565 ~ 2772390 (+) False XLOC_004456
TCONS_00010866 lncRNA downstream 1563394 2769589 ~ 2772390 (+) False XLOC_004456
TCONS_00008903 mRNA upstream 54810 1087263 ~ 1132683 (+) True XLOC_004437
TCONS_00008901 mRNA upstream 177077 1000323 ~ 1010416 (+) False XLOC_004435
TCONS_00008902 mRNA upstream 180867 1000526 ~ 1006626 (+) True XLOC_004435
TCONS_00008900 mRNA upstream 379050 804314 ~ 808443 (+) True XLOC_004432
TCONS_00008897 mRNA upstream 400685 695619 ~ 786808 (+) False XLOC_004431
TCONS_00008905 mRNA downstream 80447 1286642 ~ 1386682 (+) False XLOC_004439
TCONS_00008906 mRNA downstream 178997 1385192 ~ 1388444 (+) True XLOC_004439
TCONS_00008907 mRNA downstream 192209 1398404 ~ 1400009 (+) True XLOC_004440
TCONS_00008908 mRNA downstream 248952 1455147 ~ 1467915 (+) True XLOC_004441
TCONS_00008909 mRNA downstream 262895 1469090 ~ 1524187 (+) False XLOC_004442
TCONS_00008894 other upstream 665671 509947 ~ 521822 (+) True XLOC_004427
TCONS_00008960 other downstream 3291169 4497364 ~ 4497479 (+) True XLOC_004480
TCONS_00008972 other downstream 3845367 5051562 ~ 5051697 (+) True XLOC_004492
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TCONS_00008974 other downstream 3851026 5057221 ~ 5057356 (+) True XLOC_004494
TCONS_00008975 other downstream 3855372 5061567 ~ 5061697 (+) True XLOC_004495

Expression Profile

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