RNA id: TCONS_00010715


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00010715
length 4401
lncRNA type inter_gene
GC content 0.35
exon number 2
gene id XLOC_004444
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007123.7
NCBI id CM002896.2
chromosome length 49182954
location 1966673 ~ 2004160 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

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Function

GO:

id name namespace
GO:0019199 transmembrane receptor protein kinase activity molecular_function

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00010864 lncRNA upstream 760478 1187493 ~ 1206195 (+) True XLOC_004438
TCONS_00010863 lncRNA upstream 888493 1074403 ~ 1078180 (+) True XLOC_004436
TCONS_00010862 lncRNA upstream 1063021 902588 ~ 903652 (+) True XLOC_004434
TCONS_00010860 lncRNA upstream 1071030 892178 ~ 895643 (+) False XLOC_004433
TCONS_00010861 lncRNA upstream 1071030 892180 ~ 895643 (+) True XLOC_004433
TCONS_00010716 lncRNA downstream 573860 2578020 ~ 2607032 (+) False XLOC_004450
TCONS_00008921 lncRNA downstream 573860 2578020 ~ 2607032 (+) True XLOC_004450
TCONS_00010865 lncRNA downstream 765405 2769565 ~ 2772390 (+) False XLOC_004456
TCONS_00010866 lncRNA downstream 765429 2769589 ~ 2772390 (+) False XLOC_004456
TCONS_00010867 lncRNA downstream 765431 2769591 ~ 2772390 (+) False XLOC_004456
TCONS_00008913 mRNA upstream 224892 1592146 ~ 1741781 (+) False XLOC_004443
TCONS_00008912 mRNA upstream 224892 1592146 ~ 1741781 (+) False XLOC_004443
TCONS_00008914 mRNA upstream 224892 1609563 ~ 1741781 (+) True XLOC_004443
TCONS_00008911 mRNA upstream 440622 1492641 ~ 1526051 (+) True XLOC_004442
TCONS_00008910 mRNA upstream 440630 1469327 ~ 1526043 (+) False XLOC_004442
TCONS_00008915 mRNA downstream 377053 2381213 ~ 2401234 (+) True XLOC_004445
TCONS_00008916 mRNA downstream 394970 2399130 ~ 2421670 (+) True XLOC_004446
TCONS_00008917 mRNA downstream 424087 2428247 ~ 2430582 (+) True XLOC_004447
TCONS_00008918 mRNA downstream 442677 2446837 ~ 2492470 (+) False XLOC_004448
TCONS_00008919 mRNA downstream 451269 2455429 ~ 2483810 (+) True XLOC_004448
TCONS_00008894 other upstream 1444851 509947 ~ 521822 (+) True XLOC_004427
TCONS_00008960 other downstream 2493204 4497364 ~ 4497479 (+) True XLOC_004480
TCONS_00008972 other downstream 3047402 5051562 ~ 5051697 (+) True XLOC_004492
TCONS_00008973 other downstream 3048283 5052443 ~ 5052578 (+) True XLOC_004493
TCONS_00008974 other downstream 3053061 5057221 ~ 5057356 (+) True XLOC_004494
TCONS_00008975 other downstream 3057407 5061567 ~ 5061697 (+) True XLOC_004495

Expression Profile

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