RNA id: TCONS_00009076



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00009076
length 121
RNA type rRNA
GC content 0.53
exon number 1
gene id XLOC_004565
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007123.7
NCBI id CM002896.2
chromosome length 49182954
location 11643551 ~ 11643671 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


agccacagccatgtcaccctgcaacCCAAGACTCACTtgctactcactgaagctaagcaggtgtgagcctggtcagtacctgtatgggagaccacatgggaaagcatggttgctgttggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000115917

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00009075 lncRNA upstream 280490 11359201 ~ 11363061 (+) True XLOC_004564
TCONS_00009063 lncRNA upstream 1194720 10448242 ~ 10448831 (+) True XLOC_004558
TCONS_00009058 lncRNA upstream 1476074 10163641 ~ 10167477 (+) True XLOC_004554
TCONS_00010897 lncRNA upstream 1693062 9941133 ~ 9950489 (+) True XLOC_004550
TCONS_00010896 lncRNA upstream 1831065 9797037 ~ 9812486 (+) True XLOC_004546
TCONS_00010724 lncRNA downstream 771585 12415256 ~ 12415835 (+) True XLOC_004568
TCONS_00009084 lncRNA downstream 1450645 13094316 ~ 13095670 (+) True XLOC_004570
TCONS_00009098 lncRNA downstream 1708590 13352261 ~ 13355576 (+) True XLOC_004577
TCONS_00009105 lncRNA downstream 2012039 13655710 ~ 13721912 (+) True XLOC_004580
TCONS_00009107 lncRNA downstream 2096545 13740216 ~ 13742676 (+) True XLOC_004582
TCONS_00009072 mRNA upstream 272260 11352630 ~ 11371291 (+) False XLOC_004564
TCONS_00009073 mRNA upstream 273201 11352944 ~ 11370350 (+) False XLOC_004564
TCONS_00009074 mRNA upstream 284161 11356592 ~ 11359390 (+) False XLOC_004564
TCONS_00009071 mRNA upstream 444775 11167870 ~ 11198776 (+) True XLOC_004563
TCONS_00009070 mRNA upstream 486314 11080776 ~ 11157237 (+) True XLOC_004562
TCONS_00009077 mRNA downstream 6475 11650146 ~ 11763658 (+) True XLOC_004566
TCONS_00009078 mRNA downstream 468713 12112384 ~ 12833736 (+) False XLOC_004567
TCONS_00009080 mRNA downstream 1146182 12789853 ~ 12795214 (+) True XLOC_004567
TCONS_00009082 mRNA downstream 1448171 13091842 ~ 13106963 (+) False XLOC_004570
TCONS_00009081 mRNA downstream 1448171 13091842 ~ 13106963 (+) False XLOC_004570
TCONS_00009060 other upstream 1432503 10210932 ~ 10211048 (+) True XLOC_004556
TCONS_00009055 other upstream 1497740 10134366 ~ 10145811 (+) False XLOC_004553
TCONS_00009019 other upstream 3910901 7732534 ~ 7732650 (+) True XLOC_004523
TCONS_00009018 other upstream 4082349 7561065 ~ 7561202 (+) True XLOC_004522
TCONS_00009013 other upstream 4223403 7420032 ~ 7420148 (+) True XLOC_004520
TCONS_00009079 other downstream 969664 12613335 ~ 12613451 (+) True XLOC_004569
TCONS_00009094 other downstream 1640103 13283774 ~ 13292767 (+) True XLOC_004575
TCONS_00009101 other downstream 1813566 13457237 ~ 13457356 (+) True XLOC_004579
TCONS_00009106 other downstream 2014351 13658022 ~ 13658144 (+) True XLOC_004581
TCONS_00009115 other downstream 2458433 14102104 ~ 14103806 (+) True XLOC_004585