RNA id: TCONS_00000769



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00000769
length 119
RNA type rRNA
GC content 0.48
exon number 1
gene id XLOC_000440
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007112.7
NCBI id CM002885.2
chromosome length 59578282
location 37996459 ~ 37996577 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


tttcacagccatatcaccctgcagcccaaagatcagttactcactgaagctaagcagggctgagcctggtcaataTCTGGATAggaaaccacatgggaaaactaggttgctactggaag

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000117307

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00003090 lncRNA upstream 162067 37833347 ~ 37834392 (+) True XLOC_000439
TCONS_00002857 lncRNA upstream 358092 37591258 ~ 37638367 (+) True XLOC_000436
TCONS_00000764 lncRNA upstream 578828 37404990 ~ 37417631 (+) True XLOC_000435
TCONS_00000758 lncRNA upstream 704278 37284575 ~ 37292181 (+) True XLOC_000433
TCONS_00000757 lncRNA upstream 736747 37212236 ~ 37259712 (+) False XLOC_000433
TCONS_00000772 lncRNA downstream 149831 38146408 ~ 38154559 (+) False XLOC_000441
TCONS_00003091 lncRNA downstream 175280 38171857 ~ 38278251 (+) False XLOC_000442
TCONS_00003092 lncRNA downstream 187222 38183799 ~ 38187194 (+) True XLOC_000443
TCONS_00003093 lncRNA downstream 266123 38262700 ~ 38278251 (+) False XLOC_000442
TCONS_00000775 lncRNA downstream 267116 38263693 ~ 38278434 (+) False XLOC_000442
TCONS_00000765 mRNA upstream 292276 37701261 ~ 37704183 (+) True XLOC_000437
TCONS_00000763 mRNA upstream 576586 37391716 ~ 37419873 (+) False XLOC_000435
TCONS_00000761 mRNA upstream 578265 37391141 ~ 37418194 (+) False XLOC_000435
TCONS_00000762 mRNA upstream 596406 37391195 ~ 37400053 (+) False XLOC_000435
TCONS_00000759 mRNA upstream 634213 37312580 ~ 37362246 (+) False XLOC_000434
TCONS_00000770 mRNA downstream 145777 38142354 ~ 38170906 (+) False XLOC_000441
TCONS_00000771 mRNA downstream 146138 38142715 ~ 38166814 (+) False XLOC_000441
TCONS_00000773 mRNA downstream 154685 38151262 ~ 38170575 (+) False XLOC_000441
TCONS_00000774 mRNA downstream 157367 38153944 ~ 38162576 (+) True XLOC_000441
TCONS_00000778 mRNA downstream 365835 38362412 ~ 38374799 (+) True XLOC_000445
TCONS_00000744 other upstream 872687 37123642 ~ 37123772 (+) True XLOC_000432
TCONS_00000740 other upstream 1249890 36728297 ~ 36746569 (+) True XLOC_000429
TCONS_00000735 other upstream 1305560 36665543 ~ 36690899 (+) False XLOC_000428
TCONS_00000728 other upstream 1842082 36154261 ~ 36154377 (+) True XLOC_000425
TCONS_00000717 other upstream 2193375 35790892 ~ 35803084 (+) True XLOC_000419
TCONS_00000777 other downstream 365771 38362348 ~ 38374799 (+) False XLOC_000445
TCONS_00000779 other downstream 669177 38665754 ~ 38753029 (+) True XLOC_000446
TCONS_00000785 other downstream 821735 38818312 ~ 38822163 (+) False XLOC_000448
TCONS_00000786 other downstream 823000 38819577 ~ 38822163 (+) True XLOC_000448
TCONS_00000794 other downstream 1517164 39513741 ~ 39513857 (+) True XLOC_000454