RNA id: AMCG00000814


Basic Information

Item Value
RNA id AMCG00000814
length 5270
RNA type mRNA
GC content 0.41
exon number 16
gene id AMCG00000814
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030137.1
NCBI id CM030137.1
chromosome length 27060302
location 4330368 ~ 4349297 (+)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome
species bowfin
(Amia calva)

Sequence

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Function

GO:

id name namespace
GO:0016020 membrane cellular_component

KEGG:

id description
K15289 SLC35F5; solute carrier family 35, member F5

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU158436 lncRNA upstream 85332 4244732 ~ 4245036 (+) True G126368
TU158362 lncRNA upstream 600312 3725920 ~ 3730056 (+) True G126301
TU158294 lncRNA upstream 657192 3670802 ~ 3673176 (+) True G126248
TU158279 lncRNA upstream 673787 3652673 ~ 3656581 (+) True G126240
TU158251 lncRNA upstream 771944 3555566 ~ 3558424 (+) True G126215
TU158587 lncRNA downstream 527570 4876867 ~ 4880503 (+) True G126500
TU158588 lncRNA downstream 527570 4876867 ~ 4877646 (+) False G126500
TU158693 lncRNA downstream 771748 5121045 ~ 5124330 (+) True G126568
TU158694 lncRNA downstream 771907 5121204 ~ 5123938 (+) False G126568
TU158695 lncRNA downstream 777262 5126559 ~ 5126808 (+) True G126569
AMCG00000816 mRNA upstream 24017 4299531 ~ 4306351 (+) True AMCG00000816
AMCG00000812 mRNA upstream 282690 4002126 ~ 4047678 (+) True AMCG00000812
AMCG00000808 mRNA upstream 402208 3908654 ~ 3928160 (+) True AMCG00000808
AMCG00000805 mRNA upstream 567025 3762819 ~ 3763343 (+) True AMCG00000805
AMCG00000806 mRNA upstream 631832 3686259 ~ 3698536 (+) True AMCG00000806
AMCG00000815 mRNA downstream 2081 4351378 ~ 4366946 (+) True AMCG00000815
AMCG00000819 mRNA downstream 49289 4398586 ~ 4399059 (+) True AMCG00000819
AMCG00000823 mRNA downstream 286995 4636292 ~ 4642779 (+) True AMCG00000823
AMCG00000822 mRNA downstream 302685 4651982 ~ 4667416 (+) True AMCG00000822
AMCG00000829 mRNA downstream 335398 4684695 ~ 4703265 (+) True AMCG00000829
TU157662 other upstream 2634121 1668845 ~ 1696247 (+) True AMCG00000729
TU157655 other upstream 2729729 1599696 ~ 1600639 (+) False AMCG00000723
TU157377 other upstream 3988597 339640 ~ 341771 (+) False G125561
TU159397 other downstream 4267902 8617199 ~ 8620195 (+) True G127134
TU159756 other downstream 5798560 10147857 ~ 10154187 (+) False AMCG00000949
TU160309 other downstream 7650367 11999664 ~ 12011425 (+) True AMCG00001002
TU161370 other downstream 10820614 15169911 ~ 15174147 (+) True AMCG00001098
TU161504 other downstream 11059815 15409112 ~ 15420880 (+) False G128823

Expression Profile