RNA id: AMCG00000970



Basic Information


Item Value
RNA id AMCG00000970
length 12628
RNA type mRNA
GC content 0.35
exon number 9
gene id AMCG00000970
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id CM030137.1
NCBI id CM030137.1
chromosome length 27060302
location 11077112 ~ 11100449 (-)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome
species bowfin
(Amia calva)

Sequence


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Function


GO: NA

KEGG:

id description
ko04913 Ovarian steroidogenesis

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
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TU159952 lncRNA downstream 460885 10615930 ~ 10616227 (-) True G127573
TU159927 lncRNA downstream 510463 10564927 ~ 10566649 (-) True G127555
TU159830 lncRNA downstream 681186 10391304 ~ 10395926 (-) True G127478
TU159757 lncRNA downstream 926178 10147775 ~ 10150934 (-) True G127420
TU160081 lncRNA upstream 108092 11208541 ~ 11247944 (-) True G127678
TU160125 lncRNA upstream 296261 11396710 ~ 11407860 (-) True G127718
TU160154 lncRNA upstream 505355 11605804 ~ 11606176 (-) True G127740
TU160156 lncRNA upstream 508822 11609271 ~ 11609630 (-) True G127742
TU160157 lncRNA upstream 509794 11610243 ~ 11611612 (-) True G127743
AMCG00000968 mRNA downstream 143317 10931552 ~ 10933795 (-) True AMCG00000968
AMCG00000965 mRNA downstream 235414 10840113 ~ 10841698 (-) True AMCG00000965
AMCG00000964 mRNA downstream 269291 10762970 ~ 10807821 (-) True AMCG00000964
AMCG00000963 mRNA downstream 325044 10749030 ~ 10752068 (-) True AMCG00000963
AMCG00000962 mRNA downstream 339836 10725849 ~ 10737276 (-) True AMCG00000962
AMCG00000969 mRNA upstream 35275 11135724 ~ 11155356 (-) True AMCG00000969
AMCG00000971 mRNA upstream 81483 11181932 ~ 11190201 (-) True AMCG00000971
AMCG00000977 mRNA upstream 201878 11302327 ~ 11310013 (-) True AMCG00000977
AMCG00000978 mRNA upstream 418062 11518511 ~ 11521717 (-) True AMCG00000978
AMCG00000979 mRNA upstream 438036 11538485 ~ 11556121 (-) True AMCG00000979
TU159975 other downstream 376764 10697707 ~ 10700348 (-) False AMCG00000960
TU159787 other downstream 798901 10274687 ~ 10278211 (-) True G127443
TU159607 other downstream 1657787 9418996 ~ 9419325 (-) True G127292
TU159288 other downstream 3431390 7629915 ~ 7645722 (-) True G127039
TU159187 other downstream 4343295 6711958 ~ 6733817 (-) False AMCG00000888
TU160686 other upstream 1631735 12732184 ~ 12751516 (-) True G128160
TU160833 other upstream 2256534 13356983 ~ 13359770 (-) True AMCG00001061
TU161258 other upstream 3492250 14592699 ~ 14598570 (-) True G128628
TU161398 other upstream 4078792 15179241 ~ 15180322 (-) True G128741
TU161519 other upstream 4263618 15364067 ~ 15433469 (-) True AMCG00001118

Expression Profile