RNA id: TU160125


Basic Information

Item Value
RNA id TU160125
length 9655
lncRNA type inter_gene
GC content 0.41
exon number 2
gene id G127718
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030137.1
NCBI id CM030137.1
chromosome length 27060302
location 11396710 ~ 11407860 (-)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome
species bowfin
(Amia calva)

Sequence

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Function

GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU160081 lncRNA downstream 148766 11208541 ~ 11247944 (-) True G127678
TU160019 lncRNA downstream 637216 10757870 ~ 10759494 (-) True G127631
TU159952 lncRNA downstream 780483 10615930 ~ 10616227 (-) True G127573
TU159927 lncRNA downstream 830061 10564927 ~ 10566649 (-) True G127555
TU159830 lncRNA downstream 1000784 10391304 ~ 10395926 (-) True G127478
TU160154 lncRNA upstream 197944 11605804 ~ 11606176 (-) True G127740
TU160156 lncRNA upstream 201411 11609271 ~ 11609630 (-) True G127742
TU160157 lncRNA upstream 202383 11610243 ~ 11611612 (-) True G127743
TU160162 lncRNA upstream 207597 11615457 ~ 11618105 (-) True G127747
TU160341 lncRNA upstream 501126 11908986 ~ 11911822 (-) True G127899
AMCG00000977 mRNA downstream 86697 11302327 ~ 11310013 (-) True AMCG00000977
AMCG00000971 mRNA downstream 206509 11181932 ~ 11190201 (-) True AMCG00000971
AMCG00000969 mRNA downstream 241354 11135724 ~ 11155356 (-) True AMCG00000969
AMCG00000970 mRNA downstream 296261 11077112 ~ 11100449 (-) True AMCG00000970
AMCG00000968 mRNA downstream 462915 10931552 ~ 10933795 (-) True AMCG00000968
AMCG00000978 mRNA upstream 110651 11518511 ~ 11521717 (-) True AMCG00000978
AMCG00000979 mRNA upstream 130625 11538485 ~ 11556121 (-) True AMCG00000979
AMCG00000988 mRNA upstream 204043 11611903 ~ 11614988 (-) True AMCG00000988
AMCG00000987 mRNA upstream 217231 11625091 ~ 11655006 (-) True AMCG00000987
AMCG00000992 mRNA upstream 267226 11675086 ~ 11733640 (-) True AMCG00000992
TU159975 other downstream 696362 10697707 ~ 10700348 (-) False AMCG00000960
TU159787 other downstream 1118499 10274687 ~ 10278211 (-) True G127443
TU159607 other downstream 1977385 9418996 ~ 9419325 (-) True G127292
TU159288 other downstream 3750988 7629915 ~ 7645722 (-) True G127039
TU159187 other downstream 4662893 6711958 ~ 6733817 (-) False AMCG00000888
TU160686 other upstream 1324324 12732184 ~ 12751516 (-) True G128160
TU160833 other upstream 1949123 13356983 ~ 13359770 (-) True AMCG00001061
TU161258 other upstream 3184839 14592699 ~ 14598570 (-) True G128628
TU161398 other upstream 3771381 15179241 ~ 15180322 (-) True G128741
TU161519 other upstream 3956207 15364067 ~ 15433469 (-) True AMCG00001118

Expression Profile