RNA id: TU155898


Basic Information

Item Value
RNA id TU155898
length 9946
lncRNA type sense_over
GC content 0.40
exon number 5
gene id AMCG00002584
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030136.1
NCBI id CM030136.1
chromosome length 27394605
location 21647055 ~ 21678545 (-)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome
species bowfin
(Amia calva)

Sequence

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Function

GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU155844 lncRNA downstream 530320 20979097 ~ 21116735 (-) True G124327
TU155736 lncRNA downstream 1106532 20540307 ~ 20540523 (-) True G124222
TU155687 lncRNA downstream 1312601 20302072 ~ 20334454 (-) True G124175
TU155557 lncRNA downstream 2362762 19283878 ~ 19284293 (-) True G124068
TU155446 lncRNA downstream 2864689 18782145 ~ 18782366 (-) True G123981
TU155935 lncRNA upstream 116228 21794773 ~ 21794988 (-) True G124402
TU155964 lncRNA upstream 223120 21901665 ~ 21902223 (-) False AMCG00002596
TU155965 lncRNA upstream 240155 21918700 ~ 21918915 (-) True G124429
TU155967 lncRNA upstream 247062 21925607 ~ 21925856 (-) True G124431
TU155970 lncRNA upstream 262632 21941177 ~ 21953671 (-) True G124434
AMCG00002585 mRNA downstream 2009 21644360 ~ 21645046 (-) True AMCG00002585
AMCG00002586 mRNA downstream 286512 21355932 ~ 21360543 (-) True AMCG00002586
AMCG00002583 mRNA downstream 518802 21127114 ~ 21128253 (-) True AMCG00002583
AMCG00002578 mRNA downstream 1134126 20505594 ~ 20512929 (-) True AMCG00002578
AMCG00002580 mRNA downstream 1281856 20359557 ~ 20365199 (-) True AMCG00002580
AMCG00002589 mRNA upstream 80288 21758833 ~ 21778461 (-) True AMCG00002589
AMCG00002591 mRNA upstream 116809 21795354 ~ 21802954 (-) True AMCG00002591
AMCG00002593 mRNA upstream 126799 21805344 ~ 21812132 (-) True AMCG00002593
AMCG00002592 mRNA upstream 136920 21815465 ~ 21837472 (-) True AMCG00002592
AMCG00002596 mRNA upstream 222747 21901292 ~ 21902597 (-) True AMCG00002596
TU155250 other downstream 3657590 17922452 ~ 17989465 (-) True G123829
TU154950 other downstream 4807333 16836156 ~ 16839722 (-) True G123585
TU154543 other downstream 6700744 14941260 ~ 14946311 (-) True G123263
TU154299 other downstream 7992819 13649228 ~ 13654236 (-) False AMCG00002421
TU154047 other downstream 8617649 13028197 ~ 13029406 (-) True G122862
TU156333 other upstream 1407449 23085994 ~ 23153164 (-) True G124719
TU156342 other upstream 1503376 23181921 ~ 23185168 (-) True AMCG00002629
TU156457 other upstream 2583020 24261565 ~ 24261823 (-) True G124829
TU156479 other upstream 2613242 24291787 ~ 24339566 (-) True G124848
TU156949 other upstream 4625337 26303882 ~ 26305923 (-) False AMCG00002688

Expression Profile