RNA id: AMCG00003100


Basic Information

Item Value
RNA id AMCG00003100
length 11031
RNA type mRNA
GC content 0.39
exon number 11
gene id AMCG00003100
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030139.1
NCBI id CM030139.1
chromosome length 23121578
location 11253483 ~ 11272674 (-)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome
species bowfin
(Amia calva)

Sequence

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Function

GO: NA

KEGG:

id description
K24309 TET2_3; methylcytosine dioxygenase TET2/3

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU176821 lncRNA downstream 145879 11107396 ~ 11107604 (-) True G140588
TU176798 lncRNA downstream 216172 11011138 ~ 11037311 (-) True G140567
TU176774 lncRNA downstream 285881 10965532 ~ 10967602 (-) True G140546
TU176757 lncRNA downstream 323511 10926118 ~ 10929972 (-) True G140537
TU176739 lncRNA downstream 434324 10818769 ~ 10819159 (-) True G140521
TU176916 lncRNA upstream 32797 11305471 ~ 11308389 (-) True G140648
TU176996 lncRNA upstream 59755 11332429 ~ 11333684 (-) True G140704
TU177049 lncRNA upstream 325384 11598058 ~ 11599956 (-) True G140742
TU177065 lncRNA upstream 346115 11618789 ~ 11619926 (-) False AMCG00003110
TU177066 lncRNA upstream 352751 11625425 ~ 11626381 (-) True G140756
AMCG00003098 mRNA downstream 1862 11240771 ~ 11251621 (-) True AMCG00003098
AMCG00003099 mRNA downstream 23106 11225235 ~ 11230377 (-) True AMCG00003099
AMCG00003104 mRNA downstream 29050 11207473 ~ 11224433 (-) True AMCG00003104
AMCG00003097 mRNA downstream 78452 11170540 ~ 11175031 (-) True AMCG00003097
AMCG00003106 mRNA downstream 86581 11138197 ~ 11166902 (-) True AMCG00003106
AMCG00003102 mRNA upstream 87753 11360427 ~ 11374048 (-) True AMCG00003102
AMCG00003101 mRNA upstream 166691 11439365 ~ 11455653 (-) True AMCG00003101
AMCG00003103 mRNA upstream 183566 11456240 ~ 11478384 (-) True AMCG00003103
AMCG00003105 mRNA upstream 279017 11551691 ~ 11562305 (-) True AMCG00003105
AMCG00003110 mRNA upstream 335789 11608463 ~ 11622649 (-) True AMCG00003110
TU176570 other downstream 922111 10301800 ~ 10331372 (-) True AMCG00003049
TU176114 other downstream 2015753 9236658 ~ 9237730 (-) True G140015
TU176103 other downstream 2405643 8847032 ~ 8847840 (-) True G140006
TU176000 other downstream 2758887 8485361 ~ 8494596 (-) True G139933
TU175851 other downstream 3315242 7931257 ~ 7938241 (-) False AMCG00002970
TU177068 other upstream 368142 11640816 ~ 11647619 (-) True G140758
TU177067 other upstream 421332 11694006 ~ 11733762 (-) True G140757
TU177331 other upstream 1578347 12851021 ~ 12855341 (-) False AMCG00003144
TU177332 other upstream 1578347 12851021 ~ 12855341 (-) False AMCG00003144
TU177333 other upstream 1578347 12851021 ~ 12855341 (-) False AMCG00003144

Expression Profile