RNA id: TCONS_00009163



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00009163
length 118
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_004624
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007123.7
NCBI id CM002896.2
chromosome length 49182954
location 17345550 ~ 17345667 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


AGTAATGactcatatcaccctgcagcccaagaccagttacacactgaagctaagcagggctgagcctggtcaatacctggatggtagaccacatgggaaagctagggtGCTGTTGAAA

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000119418

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00009162 lncRNA upstream 133881 17201556 ~ 17211669 (+) True XLOC_004623
TCONS_00009160 lncRNA upstream 141156 17201527 ~ 17204394 (+) False XLOC_004623
TCONS_00010910 lncRNA upstream 470847 16742395 ~ 16874703 (+) True XLOC_004615
TCONS_00010909 lncRNA upstream 760496 16583373 ~ 16585054 (+) True XLOC_004614
TCONS_00010907 lncRNA upstream 775506 16567854 ~ 16570044 (+) False XLOC_004613
TCONS_00010911 lncRNA downstream 78764 17424431 ~ 17427380 (+) True XLOC_004625
TCONS_00009169 lncRNA downstream 280683 17626350 ~ 17630707 (+) True XLOC_004629
TCONS_00010912 lncRNA downstream 370030 17715697 ~ 17739456 (+) False XLOC_004630
TCONS_00010913 lncRNA downstream 370658 17716325 ~ 17739456 (+) False XLOC_004630
TCONS_00009171 lncRNA downstream 370845 17716512 ~ 17739456 (+) False XLOC_004630
TCONS_00009159 mRNA upstream 22209 17201522 ~ 17323341 (+) False XLOC_004623
TCONS_00009161 mRNA upstream 72818 17201548 ~ 17272732 (+) False XLOC_004623
TCONS_00009158 mRNA upstream 186915 17154655 ~ 17158635 (+) True XLOC_004622
TCONS_00009156 mRNA upstream 229069 17100021 ~ 17116481 (+) False XLOC_004621
TCONS_00009157 mRNA upstream 229820 17106117 ~ 17115730 (+) True XLOC_004621
TCONS_00009164 mRNA downstream 91237 17436904 ~ 17456083 (+) False XLOC_004626
TCONS_00009165 mRNA downstream 93913 17439580 ~ 17456071 (+) True XLOC_004626
TCONS_00009166 mRNA downstream 158892 17504559 ~ 17562703 (+) True XLOC_004627
TCONS_00009167 mRNA downstream 257861 17603528 ~ 17619524 (+) True XLOC_004628
TCONS_00009168 mRNA downstream 274400 17620067 ~ 17633727 (+) False XLOC_004629
TCONS_00009153 other upstream 384769 16960693 ~ 16960781 (+) True XLOC_004618
TCONS_00009129 other upstream 1963736 15381694 ~ 15381814 (+) True XLOC_004597
TCONS_00009115 other upstream 3241744 14102104 ~ 14103806 (+) True XLOC_004585
TCONS_00009106 other upstream 3687406 13658022 ~ 13658144 (+) True XLOC_004581
TCONS_00009101 other upstream 3888194 13457237 ~ 13457356 (+) True XLOC_004579
TCONS_00009172 other downstream 381875 17727542 ~ 17727651 (+) True XLOC_004630
TCONS_00009175 other downstream 582204 17927871 ~ 17941043 (+) False XLOC_004633
TCONS_00009179 other downstream 779991 18125658 ~ 18125774 (+) True XLOC_004634
TCONS_00009200 other downstream 1253183 18598850 ~ 18598964 (+) True XLOC_004644
TCONS_00009203 other downstream 1335756 18681423 ~ 18699622 (+) False XLOC_004646