RNA id: TU197030



Basic Information


Item Value
RNA id TU197030
length 12136
lncRNA type inter_gene
GC content 0.36
exon number 3
gene id G156430
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id CM030142.1
NCBI id CM030142.1
chromosome length 21087710
location 17159577 ~ 17171780 (+)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome
species bowfin
(Amia calva)

Sequence


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Function


GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU196904 lncRNA upstream 514728 16644447 ~ 16644849 (+) True G156329
TU196901 lncRNA upstream 531864 16625558 ~ 16627713 (+) True G156326
TU196896 lncRNA upstream 559719 16599532 ~ 16599858 (+) True G156321
TU196875 lncRNA upstream 654371 16504770 ~ 16505206 (+) True G156302
TU196847 lncRNA upstream 691901 16464008 ~ 16467676 (+) True G156279
TU197041 lncRNA downstream 160756 17332536 ~ 17342156 (+) True G156440
TU197127 lncRNA downstream 351454 17523234 ~ 17524750 (+) True G156506
TU197131 lncRNA downstream 363851 17535631 ~ 17547361 (+) True G156509
TU197144 lncRNA downstream 395779 17567559 ~ 17571532 (+) True G156521
TU197184 lncRNA downstream 490410 17662190 ~ 17700067 (+) False AMCG00006188
AMCG00006149 mRNA upstream 31944 17123248 ~ 17127633 (+) True AMCG00006149
AMCG00006150 mRNA upstream 38072 17104337 ~ 17121505 (+) True AMCG00006150
AMCG00006151 mRNA upstream 57716 17095682 ~ 17101861 (+) True AMCG00006151
AMCG00006130 mRNA upstream 83313 17070040 ~ 17076264 (+) True AMCG00006130
AMCG00006125 mRNA upstream 241597 16908516 ~ 16917980 (+) True AMCG00006125
AMCG00006136 mRNA downstream 340122 17511902 ~ 17518833 (+) True AMCG00006136
AMCG00006188 mRNA downstream 528199 17699979 ~ 17735084 (+) True AMCG00006188
AMCG00006190 mRNA downstream 574353 17746133 ~ 17762467 (+) False AMCG00006190
AMCG00006191 mRNA downstream 617203 17788983 ~ 17811459 (+) True AMCG00006191
AMCG00006189 mRNA downstream 680259 17852039 ~ 17877059 (+) True AMCG00006189
TU197026 other upstream 32023 17123205 ~ 17127554 (+) False AMCG00006149
TU196902 other upstream 530395 16627793 ~ 16629182 (+) True G156327
TU196796 other upstream 1014954 16140544 ~ 16144623 (+) False AMCG00006089
TU196781 other upstream 1099747 16054035 ~ 16059830 (+) False AMCG00006113
TU196746 other upstream 1186571 15964433 ~ 15973006 (+) False AMCG00006107
TU197282 other downstream 801961 17973741 ~ 17980637 (+) False G156640
TU197332 other downstream 1018444 18190224 ~ 18356589 (+) True AMCG00006138
TU197362 other downstream 1306348 18478128 ~ 18480087 (+) True AMCG00006174

Expression Profile