RNA id: AMCG00007645


Basic Information

Item Value
RNA id AMCG00007645
length 7521
RNA type mRNA
GC content 0.42
exon number 7
gene id AMCG00007645
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030123.1
NCBI id CM030123.1
chromosome length 53548854
location 24484012 ~ 24495209 (-)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome
species bowfin
(Amia calva)

Sequence

agtttaccacttacctttgtaccatttcaggttattcactggacttgaactgcttaaatgtcaataaaaactggaaaaatgggggtgttctaaaacttgtgaccggtagtgtatatctGAAAAACATAGGCCTGCGAAGTTCAGCCTGTTGGATTGCTGTCTCTATCAGTGTTTCAGGCATGACACATGTTCTCCCAGATGCCATATTCATTCCAACTACAACATGGTCATTCCCTGCCCACAGTGTATAGGATAAGTTAATGCATAACTCGCTCCAGTTTCCCAGGGACAGAATAAGCACTTCTCACAGCTCGTCAGAGCTCCACACCATACTGCTATTATGACCAGTCTAGGTTGCTGACTGACTCTTGGCCACTTTGTGCCCTGCTCTTTCTTCTTGGCTTAATTTCTCAGTATTCTCATCACTTGTGAACAGTTATTTTGATAAATGATTTCATTATTCAGGCATGCATgcagaacacatttatttaactttcaaaCTGTGTGTTTAAACACAACATTTGTGAATTCAGTAATATTGGCTGAGATTTGTTTCAATGACCACGTTCCGCAGTGGTTTATTTCTTAGTGTTTTGACCATTACATCAATTGCATCACATGCaaattgtttattgaaaatCTAAATGAACACAGAACAGGAACAATGCTGAATAGAAGGCGTTTGCTTTGTTGAGGAGCATCATGCTTCTGATCTTTCATAAAGGATAGTCTTTGTGTGGAGAGATGAATTGCACCCTTCATCCAGAGCAGGCCTTTGTTGATCCCTGGGCCTAGGGCATCCATTTGGGCTCAGGGTTTATTGTGAGGGCCTCTAGCCTCCTTGATTTTACAGATTGACAGGGGCACTCCAAGAAACATTAAATCTGATAAGGACTCTGAACAGTATGATCTAGAAACAGCTTGACTGGTAACGCCTGCTCATCACATGGCTGGGTGCTTCATGGCagcattctttttatttttcaggtcaATAATTAACTATTCAATGAGATGCAGAGTTTATAGTTGGTCTGAAAAAGCTGTTTCCATATTGTTCTCATCAGATACAGTCCACtacagtattatttttagaCCTGTCAGGAAAAGCACTACAGAGTTTTATAGCCTGACCTTGCTGTGTATTGATTTCAGTATATCCAGTATTCAGTATAGCCTCTGCATCCTACTTGTATCATGTAGTATTGATCCACATTTTGGAAAGTGTTTACCCATCGAATCAATAGCAGTTTGTCATTGTTTGCCTCCCTTGAAAATTATGTTACAGATCAGTAGGTAAGGCCATGCATAGCCCTGGAGCCCACAGTCAGATTGCAATGGGAAGTCTGGTCTCCCAGTCAGTGTGTTCGCTCTGTAATCACCTTCTGTTGCCTCTTTCCCTGGTACTGAAAACACAGGAATATTCCTGTCTGATGGGTTGGGAGATTATTAACGCAGCCACTTATTCCCAACTGTTTTTGTATAGGACAGCCTAAAGGCCTTTTGCAAGTTGTACACTTTTTAGTACTGGAATAATCCTCTCACAAAAATGCTGGTCTAACCATAATTAAACACTCTGAATACCTTTACAAGTATGGTGTTTGAGTCAGTGtttgaggggagggagggatgtTTGGATTGAGATCGGTGACCAATCCTCTTATTTGTAAGCAGAATGGCAGCGAACAGGCACTGGTGTTGATGCACAATGACTGGTTGTCAGATTACTAAACATGAGTGTCTCAAGGAAGTTTAAAGTTGAAGAGCCTTAAAAAAGATacctatttaaaaatgcaataaactctaaaaataaagtatttagcTTCTTTCAAAGTATTAATGGTAGTATGTAGGATTGAGGTAGTATTTGGTTAACTGTAATTACAgcctcaattaaaaaaaaaatatatatatatattaagtatacattttgtgGTGTGGGATATTAAAACGTAGAGATGGAAataatctttcattttaataaataagctTAACATAGTTATGAAAcctataaaaacataaattagcaTGTGCTGTCCGATAGGGTATAATTATGCATGGACTACTTGGTAAACAGGCATTTAATGAAGGAATTGCATACTGTGGATATGTCAAATGATTTTTCAaggtgtatatttttgtttgaattgtgtgtaaatatgtacaaaataaataaacctacaATGGCCAGCATTTTCAGTCACCTCTGGTGGCAGTATTCTTTGAAGACAAGTGCGCCTCTTAGTGGAATGATATGGAACTGCAGTGAATATATGCATGaatggttaatttaatttattttaatgtctgctAGATGGATCCATTGAATTTTCTGTTGGGTCATTTAGGGAAATTagaatatatgtaaaataaccatgacaaaatacaaatttgcattttcatacaAGAACATAATTGCTATACTGGGGAGAGGACAACCAACAAGACCTGCTATTAATTACTAGTGATATAAGTATTctaaaaagggaaataaaattgattttggGATGGCACCATGTTTGGGGTAAAGAGGAGCAGCCCTTCTTCTTGTGTCTTAAGTGAAGAGAGGGGTCAGTCTGGGTGATCACTTGACTAGACCTCCCTCTGACAGCTCTGTGGGGGATGGATTCCTGTTAATGTTTTCTGGCTCTGGAGAGACCTCGACTGTGCTGGTGCAGAGGCCTTCATAGCAGATTACACAACCATCTCCCAGCCCTCACGGTGCTACAAACACAGCTGTGCCTGCCCTGCCACTGTCAGTCACCTggagttaaagaaacaaaaacaaaaaggaaaaaaaacatggtgaGATCCACTCATAGGCAGATAAAAGAGAAATCAAAGGCATGCaaaaataagtgtcagaaaCCAGAAGAAAATATCTTCCAATGACATGTTATTTGGCAACCTTTGTTCACATTAATTCTGATAATACACTAGACAGATACTAAATCGTGTGCTGTTTCATGTCGTTTTTGAGTTAAACTTGGCATGGCCTAGTGGTTAAACATGGTATTTTAgagttccttttattttatctccCCTCTCCCACTCCTTGCCCCTAACAGTGGGGCCCCAGTGGAGTAGTTCCACTGCTTGCCGGTTTCTCTGATACATGGAGGATTGCAGCCTGCCTGGTTTATCTGGGCTGTCAGAGCCTTGGTGTGTCATCTGCCCACCTGGCAGCTTCAAAAAATGAGTTGGGATTTGAATTTTTGAATTTTATCCTCCCATCAGCCAGCCCCCACTTCCAATGTGTGTTGACCTTGGCGGGGTTGACAGGGTACTGTGAGGTGGCCTACTTTGAGCATCTGTGGAGCTCCGAGAGACTGCTAGCCCTCCATGTTTGGCAGCACACAGActcccctctgtccctctcccggTGAGCCCACTGTCATCACCTCTGTTAGTTCAGGAAGGCACCTGCAGCAGGCAGGACAGGGGGTAGGGAGGCACACAGTTATAGTATTGTGCGTCTCCAGGCTTCAATCACTCCACTAATTAGACAACAAGCCGGGGGCCGTGATTTAACTTGCACAGCAAGTTCTTGCTGCATCGAACCCACCAGCAGACTGCACCAGCACAACAGCCCTCCAGTTCTCGCTGTCAGTGGCCAGAAACCTTCAGGCTTCAGGCTTCAATGAAAGTCTCTCTTTTGGTGGGTGTTTTCTGTGAGACCCAGTGAGCTCAATTTGAAGCAGATTTCCAAACCTCAGGTAATATCTAGGATTGTGGAGGAGTCTGGATTAGGGTGGATGATGGGAGGAATGTGTGCTAAgagatttgtagtttttattactTCAAAAGTGAGCTGTTACAGAATCTTACTTCTGTTCCTACCTGTTGCAAGAGATCTGCTGAAGCCATCGTCTTTTCATTTCACATAGCTCAAGAATCGGCCTGCTAACCAAGCCAGAGAAAATGCATAACCACCTGCTAAGTGGCAGTCCCCATACCTTTgttgtgtgtacatgtatgtattgtatcCATGGCATGAAAAGTTATCATTGAGTGGTGTGATCATTGGTGATTTCCCTGACGGATGACGGGTAGCACATGCGTGCGACGTTTGTGACCGTGTGCTGGTGTTTATCCCTAGATGTGAACGAGTGTGCAGGGCAACCCTGTAAGAATGGCGGAACCTGTCGCGATCTGGATGGAGATTTTACGTGCAAATGCCCATCACCCTACGTTGGGAAGAACTGTCAATTGCGCTGTATCTCCATGCTGGGGATGGAGGGCGGGGGCATTGCAGAGTCTCAGATCTCGTCCTCCTCGGTGCACTATGGTTTCCTGGGGCTGCAACGCTGGGGACCGGAGCTCGCCAGACTTAACAACAAGGGCATTGTCAACGCCTGGACCTCAGCCACCCATGATAAGAACCCCTGGATAGAGATCAACCTGCAGAGGAAGATGCGTCTCTCTGGGATTATCACGCAGGGTGCCAGTCGCATGGGCACTGCAGAGTACATCAAATCCTTCAAGGTGTTTGTTGGCAACGTGGATAACGATGGCACCAAGACCAACCTGTTTGACCCGCCCATCGTGGCGCAGTACATCCGCATTGTACCGTTGGTGTGTCGGCATGCCTGCACTCTGCGCATGGAGCTTGTGGGCTGTGAGCTAAATGTGTATTTAAACACGGCAGGTTGCTCTGAGCCCCTGGGCATGAAGTCCTATCTGATCTCAGACAGCCAGGTGTCAGCCTCCAGTGCCTTTCGCACATGGGGCATTGATGCCTTCACCTGGCATCCCCACTTCGCCCGCCTTGACAAGCGGGGCAAGACCAACGCCTGGACGGCACTTAGCAACAACCGCTCTGAGTGGCTGCAGGTGGACTTGCAATCTCCAAAACGAGTCACAGCGATCATCACCCAGGGAGCCAAGGACTTTGGGAACGTCCAGTTTGTGTCGGCCTTTAAGCTTGCCTACAGTGATGATGGCCAGTCCTGGACAGTGTATAAAGATGACAAAACCAGAGCGGAGAAAgTGTTCCAGGGCAA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Function

GO:

id name namespace
GO:0007155 cell adhesion biological_process
GO:0005509 calcium ion binding molecular_function

KEGG:

id description
K24464 EDIL3; EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU31571 lncRNA downstream 115639 24368169 ~ 24368373 (-) True G25177
TU31570 lncRNA downstream 129702 24350030 ~ 24354310 (-) True G25176
TU31569 lncRNA downstream 136593 24347099 ~ 24347419 (-) True G25175
TU31454 lncRNA downstream 433576 24050148 ~ 24050436 (-) True G25079
TU31453 lncRNA downstream 433939 24049815 ~ 24050073 (-) True G25078
TU31671 lncRNA upstream 3156 24498365 ~ 24542158 (-) True G25248
TU31821 lncRNA upstream 486725 24981934 ~ 24982139 (-) True G25375
TU31834 lncRNA upstream 493636 24988845 ~ 24989054 (-) True G25387
TU31874 lncRNA upstream 712565 25207774 ~ 25245930 (-) False G25415
TU31876 lncRNA upstream 712565 25207774 ~ 25247379 (-) True G25415
AMCG00007643 mRNA downstream 4176 24471035 ~ 24479836 (-) True AMCG00007643
AMCG00007648 mRNA downstream 19665 24463727 ~ 24464347 (-) True AMCG00007648
AMCG00007644 mRNA downstream 80890 24368631 ~ 24403122 (-) True AMCG00007644
AMCG00007637 mRNA downstream 202448 24262690 ~ 24281564 (-) True AMCG00007637
AMCG00007634 mRNA downstream 227971 24251466 ~ 24256041 (-) True AMCG00007634
AMCG00007647 mRNA upstream 51323 24546532 ~ 24550224 (-) True AMCG00007647
AMCG00007642 mRNA upstream 63846 24559055 ~ 24562456 (-) True AMCG00007642
AMCG00007646 mRNA upstream 68586 24563795 ~ 24570297 (-) True AMCG00007646
AMCG00007652 mRNA upstream 119291 24614500 ~ 24624473 (-) True AMCG00007652
AMCG00007651 mRNA upstream 134297 24629506 ~ 24645364 (-) True AMCG00007651
TU31562 other downstream 216091 24265824 ~ 24267921 (-) False AMCG00007637
TU31390 other downstream 511347 23971671 ~ 23972665 (-) True G25026
TU30382 other downstream 4011308 20471111 ~ 20472704 (-) True AMCG00007500
TU30340 other downstream 4152201 20331513 ~ 20331811 (-) True G24217
TU30203 other downstream 4560859 19915146 ~ 19923153 (-) True AMCG00007487
TU31883 other upstream 769123 25264332 ~ 25264951 (-) True G25422
TU31949 other upstream 1135586 25630795 ~ 25631592 (-) True AMCG00007684
TU33771 other upstream 10374226 34869435 ~ 34869807 (-) True G26961
TU34246 other upstream 12744880 37240089 ~ 37242983 (-) False AMCG00007929
TU34303 other upstream 12999702 37494911 ~ 37499392 (-) True G27416

Expression Profile