RNA id: TU27939


Basic Information

Item Value
RNA id TU27939
length 3958
lncRNA type inter_gene
GC content 0.34
exon number 1
gene id G22298
representative False

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030123.1
NCBI id CM030123.1
chromosome length 53548854
location 8976117 ~ 8980818 (-)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome
species bowfin
(Amia calva)

Sequence

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Function

GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU27884 lncRNA downstream 285366 8690198 ~ 8690751 (-) True G22249
TU27848 lncRNA downstream 532973 8439852 ~ 8443144 (-) True G22217
TU27822 lncRNA downstream 721450 8253893 ~ 8254667 (-) True G22193
TU27820 lncRNA downstream 723453 8252027 ~ 8252664 (-) True G22191
TU27714 lncRNA downstream 991607 7913604 ~ 7984510 (-) False G22111
TU27949 lncRNA upstream 200944 9181018 ~ 9184829 (-) True G22305
TU28070 lncRNA upstream 437694 9417768 ~ 9437269 (-) True G22393
TU28077 lncRNA upstream 477718 9457792 ~ 9463337 (-) False AMCG00007267
TU28101 lncRNA upstream 618618 9598692 ~ 9599154 (-) True G22414
TU28102 lncRNA upstream 644492 9624566 ~ 9624878 (-) True G22415
AMCG00007249 mRNA downstream 277968 8695461 ~ 8698149 (-) True AMCG00007249
AMCG00007248 mRNA downstream 349772 8620538 ~ 8626345 (-) True AMCG00007248
AMCG00007247 mRNA downstream 358818 8603478 ~ 8617299 (-) True AMCG00007247
AMCG00007246 mRNA downstream 415677 8552097 ~ 8560440 (-) True AMCG00007246
AMCG00007240 mRNA downstream 509323 8443327 ~ 8466794 (-) True AMCG00007240
AMCG00007255 mRNA upstream 1496 8981570 ~ 9011201 (-) True AMCG00007255
AMCG00007256 mRNA upstream 111858 9091932 ~ 9098606 (-) True AMCG00007256
AMCG00007261 mRNA upstream 208537 9188611 ~ 9233981 (-) True AMCG00007261
AMCG00007260 mRNA upstream 338106 9318180 ~ 9318690 (-) True AMCG00007260
AMCG00007258 mRNA upstream 351115 9331189 ~ 9335174 (-) True AMCG00007258
TU27830 other downstream 579893 8393196 ~ 8396224 (-) True G22200
TU27501 other downstream 1469242 7499447 ~ 7506875 (-) True G21942
TU27173 other downstream 2961948 6007640 ~ 6014169 (-) False AMCG00007173
TU27087 other downstream 3155833 5816809 ~ 5820284 (-) True G21632
TU26789 other downstream 3918711 5056787 ~ 5057406 (-) True G21429
TU28289 other upstream 1207240 10187314 ~ 10190204 (-) False AMCG00007289
TU28633 other upstream 4371443 13351517 ~ 13352073 (-) True G22838
TU28749 other upstream 4965569 13945643 ~ 13946065 (-) True G22931
TU29239 other upstream 7340923 16320997 ~ 16322651 (-) False AMCG00007365
TU29238 other upstream 7340963 16321037 ~ 16322651 (-) False AMCG00007365

Expression Profile