RNA id: TU36682


Basic Information

Item Value
RNA id TU36682
length 8279
lncRNA type inter_gene
GC content 0.39
exon number 1
gene id G29271
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030123.1
NCBI id CM030123.1
chromosome length 53548854
location 45725983 ~ 45734261 (+)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome
species bowfin
(Amia calva)

Sequence

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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko04911 Insulin secretion

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU36579 lncRNA upstream 183777 45539769 ~ 45542206 (+) True G29223
TU36491 lncRNA upstream 347630 45378011 ~ 45378353 (+) True G29153
TU36485 lncRNA upstream 371904 45353716 ~ 45354079 (+) True G29148
TU36298 lncRNA upstream 909320 44768677 ~ 44816663 (+) True G28991
TU36303 lncRNA upstream 927520 44795924 ~ 44798463 (+) True G28995
TU36703 lncRNA downstream 153688 45887949 ~ 45888412 (+) True G29291
TU36736 lncRNA downstream 358647 46092908 ~ 46093489 (+) True G29320
TU36779 lncRNA downstream 534414 46268675 ~ 46268989 (+) True G29355
TU36782 lncRNA downstream 744231 46478492 ~ 46478774 (+) True G29358
TU36795 lncRNA downstream 776123 46510384 ~ 46531909 (+) True G29368
AMCG00008212 mRNA upstream 11940 45708568 ~ 45714043 (+) True AMCG00008212
AMCG00008211 mRNA upstream 87194 45599200 ~ 45638789 (+) True AMCG00008211
AMCG00008210 mRNA upstream 237017 45488632 ~ 45488966 (+) True AMCG00008210
AMCG00008198 mRNA upstream 239016 45484630 ~ 45486967 (+) True AMCG00008198
AMCG00008205 mRNA upstream 257524 45443938 ~ 45468459 (+) True AMCG00008205
AMCG00008218 mRNA downstream 133082 45867343 ~ 45911607 (+) True AMCG00008218
AMCG00008219 mRNA downstream 305687 46039948 ~ 46068818 (+) True AMCG00008219
AMCG00008220 mRNA downstream 343046 46077307 ~ 46090993 (+) True AMCG00008220
AMCG00008221 mRNA downstream 389869 46124130 ~ 46131017 (+) True AMCG00008221
AMCG00008226 mRNA downstream 796189 46530450 ~ 46530758 (+) True AMCG00008226
TU36524 other upstream 284919 45440513 ~ 45441064 (+) True G29183
TU36476 other upstream 382069 45340596 ~ 45343914 (+) False AMCG00008194
TU36420 other upstream 554155 45149429 ~ 45171828 (+) True AMCG00008185
TU36366 other upstream 689567 45023148 ~ 45036416 (+) True AMCG00008177
TU35919 other upstream 2424561 43292596 ~ 43301422 (+) False AMCG00008132
TU36777 other downstream 533630 46267891 ~ 46268327 (+) True G29353
TU36848 other downstream 1845952 47580213 ~ 47586235 (+) True G29418
TU36851 other downstream 1860843 47595104 ~ 47595686 (+) True G29421
TU36868 other downstream 1893035 47627296 ~ 47671421 (+) False AMCG00008232
TU36872 other downstream 1897929 47632190 ~ 47637376 (+) True AMCG00008232

Expression Profile