RNA id: TU50581


Basic Information

Item Value
RNA id TU50581
length 10627
RNA type TUCP
GC content 0.37
exon number 5
gene id AMCG00012888
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030125.1
NCBI id CM030125.1
chromosome length 49972098
location 12240396 ~ 12271789 (-)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome
species bowfin
(Amia calva)

Sequence

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Function

GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU50578 lncRNA downstream 939 12237229 ~ 12239457 (-) True G40584
TU50295 lncRNA downstream 1378084 10857881 ~ 10862312 (-) True AMCG00012856
TU50262 lncRNA downstream 1497165 10740354 ~ 10743231 (-) True AMCG00012858
TU50261 lncRNA downstream 1500095 10739895 ~ 10740301 (-) True G40327
TU50260 lncRNA downstream 1501018 10739085 ~ 10739378 (-) True G40326
TU50708 lncRNA upstream 330068 12583511 ~ 12583719 (-) True G40684
TU50771 lncRNA upstream 487732 12741175 ~ 12742696 (-) True G40735
TU50787 lncRNA upstream 643077 12896520 ~ 12899282 (-) False AMCG00012906
TU50788 lncRNA upstream 643811 12897254 ~ 12899282 (-) False AMCG00012906
TU50792 lncRNA upstream 654004 12907447 ~ 12911725 (-) True G40747
AMCG00012879 mRNA downstream 601371 11597966 ~ 11639025 (-) True AMCG00012879
AMCG00012877 mRNA downstream 736862 11484011 ~ 11503534 (-) True AMCG00012877
AMCG00012878 mRNA downstream 777658 11436012 ~ 11462738 (-) True AMCG00012878
AMCG00012882 mRNA downstream 812809 11425333 ~ 11427587 (-) True AMCG00012882
AMCG00012880 mRNA downstream 854323 11365014 ~ 11386073 (-) True AMCG00012880
AMCG00012889 mRNA upstream 180051 12433494 ~ 12439926 (-) True AMCG00012889
AMCG00012890 mRNA upstream 235975 12489418 ~ 12493266 (-) True AMCG00012890
AMCG00012891 mRNA upstream 248713 12502156 ~ 12508836 (-) True AMCG00012891
AMCG00012898 mRNA upstream 276951 12530394 ~ 12617383 (-) True AMCG00012898
AMCG00012899 mRNA upstream 398261 12651704 ~ 12669255 (-) True AMCG00012899
TU49940 other downstream 3127320 9112441 ~ 9113076 (-) False AMCG00012829
TU49217 other downstream 5784218 6455721 ~ 6456178 (-) True G39487
TU47984 other downstream 10056233 2183885 ~ 2184163 (-) True G38490
TU47949 other downstream 10463175 1776854 ~ 1777221 (-) True G38458
TU47757 other downstream 11700805 523747 ~ 539591 (-) True AMCG00012628
TU50830 other upstream 861450 13114893 ~ 13115487 (-) True G40778
TU52042 other upstream 5626782 17880225 ~ 17899426 (-) False AMCG00013038
TU52041 other upstream 5700620 17954063 ~ 18043587 (-) False AMCG00013042
TU52091 other upstream 5922618 18176061 ~ 18191522 (-) True G41807
TU52133 other upstream 5989307 18242750 ~ 18244093 (-) True G41836

Expression Profile