RNA id: TCONS_00009307



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00009307
length 127
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_004700
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007123.7
NCBI id CM002896.2
chromosome length 49182954
location 22578404 ~ 22578530 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


ACCAGCATATAGTTTGTCCTTGTCACAGTgttgcagcccaagaccggttactcactgaagctaagcagggctgagcctgatcagtacctgaatgggagaccatgggaagactaggttgctgttggat

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000121174

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00009303 lncRNA upstream 151349 22423953 ~ 22427055 (+) False XLOC_004697
TCONS_00010927 lncRNA upstream 273563 22289980 ~ 22304841 (+) True XLOC_004696
TCONS_00010734 lncRNA upstream 319006 22258962 ~ 22259398 (+) False XLOC_004696
TCONS_00010926 lncRNA upstream 558634 22017946 ~ 22019770 (+) True XLOC_004695
TCONS_00010925 lncRNA upstream 779008 21790979 ~ 21799396 (+) False XLOC_004694
TCONS_00010735 lncRNA downstream 39858 22618388 ~ 22619122 (+) True XLOC_004701
TCONS_00010928 lncRNA downstream 458917 23037447 ~ 23040091 (+) True XLOC_004707
TCONS_00010929 lncRNA downstream 875899 23454429 ~ 23605722 (+) False XLOC_004711
TCONS_00010930 lncRNA downstream 875928 23454458 ~ 23605722 (+) False XLOC_004711
TCONS_00010931 lncRNA downstream 875998 23454528 ~ 23469341 (+) False XLOC_004711
TCONS_00009305 mRNA upstream 5107 22560067 ~ 22573297 (+) True XLOC_004698
TCONS_00009301 mRNA upstream 133343 22404108 ~ 22445061 (+) False XLOC_004697
TCONS_00009302 mRNA upstream 134017 22407852 ~ 22444387 (+) False XLOC_004697
TCONS_00009300 mRNA upstream 273563 22258962 ~ 22304841 (+) False XLOC_004696
TCONS_00009298 mRNA upstream 830396 21697540 ~ 21748008 (+) True XLOC_004693
TCONS_00009308 mRNA downstream 2049 22580579 ~ 22599067 (+) False XLOC_004699
TCONS_00009309 mRNA downstream 2097 22580627 ~ 22607887 (+) False XLOC_004699
TCONS_00009310 mRNA downstream 10393 22588923 ~ 22607887 (+) False XLOC_004699
TCONS_00009311 mRNA downstream 29231 22607761 ~ 22618080 (+) True XLOC_004699
TCONS_00009312 mRNA downstream 50174 22628704 ~ 22645215 (+) True XLOC_004702
TCONS_00009304 other upstream 133632 22443629 ~ 22444772 (+) True XLOC_004697
TCONS_00009299 other upstream 784288 21794002 ~ 21794116 (+) True XLOC_004694
TCONS_00009295 other upstream 1140946 21437346 ~ 21437458 (+) True XLOC_004691
TCONS_00009286 other upstream 1886391 20691358 ~ 20692013 (+) False XLOC_004688
TCONS_00009270 other upstream 2079324 20498983 ~ 20499080 (+) True XLOC_004679
TCONS_00009313 other downstream 79393 22657923 ~ 22661380 (+) False XLOC_004703
TCONS_00009319 other downstream 99423 22677953 ~ 22745783 (+) False XLOC_004704
TCONS_00009330 other downstream 342947 22921477 ~ 22932021 (+) False XLOC_004706
TCONS_00009332 other downstream 531633 23110163 ~ 23110277 (+) True XLOC_004708
TCONS_00009336 other downstream 998736 23577266 ~ 23577391 (+) True XLOC_004712

Expression Profile


//