RNA id: TU49313


Basic Information

Item Value
RNA id TU49313
length 9053
lncRNA type inter_gene
GC content 0.40
exon number 2
gene id G39556
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030125.1
NCBI id CM030125.1
chromosome length 49972098
location 6786456 ~ 6795733 (-)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome
species bowfin
(Amia calva)

Sequence

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Function

GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU49269 lncRNA downstream 90532 6638507 ~ 6695924 (-) False AMCG00012751
TU49191 lncRNA downstream 498521 6285455 ~ 6287935 (-) True G39462
TU49166 lncRNA downstream 517518 6268235 ~ 6268938 (-) True G39443
TU49135 lncRNA downstream 722639 6060990 ~ 6063817 (-) True AMCG00012732
TU49078 lncRNA downstream 891342 5818186 ~ 5895114 (-) False G39377
TU49319 lncRNA upstream 102254 6897987 ~ 6898237 (-) True G39561
TU49351 lncRNA upstream 354884 7150617 ~ 7150823 (-) True G39580
TU49465 lncRNA upstream 875503 7671236 ~ 7671642 (-) True G39662
TU49523 lncRNA upstream 1031545 7827278 ~ 7828147 (-) True G39707
TU49559 lncRNA upstream 1095844 7891577 ~ 7895726 (-) False AMCG00012782
AMCG00012751 mRNA downstream 135634 6638480 ~ 6650822 (-) True AMCG00012751
AMCG00012752 mRNA downstream 166698 6607194 ~ 6619758 (-) True AMCG00012752
AMCG00012745 mRNA downstream 326430 6452009 ~ 6460026 (-) True AMCG00012745
AMCG00012744 mRNA downstream 350825 6412731 ~ 6435631 (-) True AMCG00012744
AMCG00012743 mRNA downstream 408202 6362449 ~ 6378254 (-) True AMCG00012743
AMCG00012757 mRNA upstream 20075 6815808 ~ 6823765 (-) True AMCG00012757
AMCG00012758 mRNA upstream 132797 6928530 ~ 6981212 (-) True AMCG00012758
AMCG00012759 mRNA upstream 220372 7016105 ~ 7024518 (-) True AMCG00012759
AMCG00012760 mRNA upstream 418012 7213745 ~ 7235643 (-) True AMCG00012760
AMCG00012766 mRNA upstream 482969 7278702 ~ 7289692 (-) True AMCG00012766
TU49217 other downstream 330278 6455721 ~ 6456178 (-) True G39487
TU47984 other downstream 4602293 2183885 ~ 2184163 (-) True G38490
TU47949 other downstream 5009235 1776854 ~ 1777221 (-) True G38458
TU47757 other downstream 6246865 523747 ~ 539591 (-) True AMCG00012628
TU49940 other upstream 2316708 9112441 ~ 9113076 (-) False AMCG00012829
TU50581 other upstream 5444663 12240396 ~ 12253443 (-) True AMCG00012888
TU50830 other upstream 6319160 13114893 ~ 13115487 (-) True G40778
TU52042 other upstream 11084492 17880225 ~ 17899426 (-) False AMCG00013038
TU52041 other upstream 11158330 17954063 ~ 18043587 (-) False AMCG00013042

Expression Profile