RNA id: TCONS_00009336


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00009336
length 126
RNA type rRNA
GC content 0.52
exon number 1
gene id XLOC_004712
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007123.7
NCBI id CM002896.2
chromosome length 49182954
location 23577266 ~ 23577391 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

CTTTTGAGATTTAATCCTTTTGAAGCTCTTCGCAACTCTCActtggtcgcccactgaagctaagcagggctgcgcctggtcagtagctggatgggagaccacatggcaaAGCAGGGTTGCTGaaga

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000119566

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00010932 lncRNA upstream 85373 23454528 ~ 23491893 (+) False XLOC_004711
TCONS_00010931 lncRNA upstream 107925 23454528 ~ 23469341 (+) False XLOC_004711
TCONS_00010928 lncRNA upstream 537175 23037447 ~ 23040091 (+) True XLOC_004707
TCONS_00010735 lncRNA upstream 958144 22618388 ~ 22619122 (+) True XLOC_004701
TCONS_00009303 lncRNA upstream 1150211 22423953 ~ 22427055 (+) False XLOC_004697
TCONS_00010933 lncRNA downstream 11633 23589024 ~ 23605722 (+) False XLOC_004711
TCONS_00010934 lncRNA downstream 12611 23590002 ~ 23605722 (+) True XLOC_004711
TCONS_00010935 lncRNA downstream 72501 23649892 ~ 23651056 (+) True XLOC_004713
TCONS_00010736 lncRNA downstream 201561 23778952 ~ 23779177 (+) True XLOC_004716
TCONS_00010737 lncRNA downstream 235139 23812530 ~ 23859432 (+) False XLOC_004717
TCONS_00009334 mRNA upstream 146910 23424108 ~ 23430356 (+) True XLOC_004710
TCONS_00009333 mRNA upstream 161205 23371542 ~ 23416061 (+) True XLOC_004709
TCONS_00009331 mRNA upstream 643742 22921492 ~ 22933524 (+) True XLOC_004706
TCONS_00009329 mRNA upstream 661566 22870372 ~ 22915700 (+) False XLOC_004705
TCONS_00009328 mRNA upstream 661566 22870372 ~ 22915700 (+) True XLOC_004705
TCONS_00009337 mRNA downstream 86944 23664335 ~ 23674621 (+) True XLOC_004714
TCONS_00009338 mRNA downstream 185575 23762966 ~ 23796566 (+) False XLOC_004715
TCONS_00009339 mRNA downstream 185575 23762966 ~ 23796707 (+) True XLOC_004715
TCONS_00009340 mRNA downstream 235139 23812530 ~ 23932576 (+) False XLOC_004717
TCONS_00009342 mRNA downstream 273270 23850661 ~ 23870648 (+) False XLOC_004717
TCONS_00009332 other upstream 466989 23110163 ~ 23110277 (+) True XLOC_004708
TCONS_00009330 other upstream 645245 22921477 ~ 22932021 (+) False XLOC_004706
TCONS_00009319 other upstream 831483 22677953 ~ 22745783 (+) False XLOC_004704
TCONS_00009313 other upstream 915886 22657923 ~ 22661380 (+) False XLOC_004703
TCONS_00009307 other upstream 998736 22578404 ~ 22578530 (+) True XLOC_004700
TCONS_00009341 other downstream 261408 23838799 ~ 23866353 (+) False XLOC_004717
TCONS_00009347 other downstream 333441 23910832 ~ 23910949 (+) True XLOC_004718
TCONS_00009349 other downstream 345934 23923325 ~ 23932015 (+) True XLOC_004717
TCONS_00009353 other downstream 637010 24214401 ~ 24214517 (+) True XLOC_004721
TCONS_00009355 other downstream 764940 24342331 ~ 24345493 (+) False XLOC_004722