RNA id: AMCG00021764


Basic Information

Item Value
RNA id AMCG00021764
length 5361
RNA type mRNA
GC content 0.37
exon number 6
gene id AMCG00021764
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030130.1
NCBI id CM030130.1
chromosome length 39556810
location 28991590 ~ 29005897 (+)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome
species bowfin
(Amia calva)

Sequence

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Function

GO:

id name namespace
GO:0006486 protein glycosylation biological_process
GO:0097503 sialylation biological_process
GO:0030173 integral component of Golgi membrane cellular_component
GO:0008373 sialyltransferase activity molecular_function

KEGG:

id description
K00780 SIAT4A; beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase (sialyltransferase 4A)

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU110140 lncRNA upstream 21642 28921629 ~ 28969948 (+) True G88249
TU110138 lncRNA upstream 88976 28902398 ~ 28902614 (+) True G88248
TU110127 lncRNA upstream 160267 28830906 ~ 28831323 (+) True G88237
TU110122 lncRNA upstream 216397 28774871 ~ 28775193 (+) True G88232
TU110115 lncRNA upstream 293505 28697878 ~ 28698085 (+) True G88225
TU110198 lncRNA downstream 258930 29264827 ~ 29268282 (+) True AMCG00021772
TU110201 lncRNA downstream 264660 29270557 ~ 29271545 (+) False AMCG00021772
TU110206 lncRNA downstream 273280 29279177 ~ 29280833 (+) True G88306
TU110207 lncRNA downstream 291940 29297837 ~ 29298080 (+) True G88307
TU110209 lncRNA downstream 301982 29307879 ~ 29315559 (+) True G88308
AMCG00021759 mRNA upstream 161213 28827986 ~ 28830377 (+) True AMCG00021759
AMCG00021760 mRNA upstream 187414 28767415 ~ 28804176 (+) True AMCG00021760
AMCG00021762 mRNA upstream 480775 28510456 ~ 28510815 (+) True AMCG00021762
AMCG00021761 mRNA upstream 481555 28509629 ~ 28510035 (+) True AMCG00021761
AMCG00021763 mRNA upstream 482116 28506377 ~ 28509474 (+) True AMCG00021763
AMCG00021765 mRNA downstream 1499 29007396 ~ 29021741 (+) True AMCG00021765
AMCG00021766 mRNA downstream 19666 29025563 ~ 29041941 (+) True AMCG00021766
AMCG00021768 mRNA downstream 70204 29076101 ~ 29095261 (+) True AMCG00021768
AMCG00021769 mRNA downstream 204380 29210277 ~ 29223312 (+) True AMCG00021769
AMCG00021772 mRNA downstream 260541 29266438 ~ 29275347 (+) False AMCG00021772
TU110128 other upstream 212857 28778315 ~ 28778733 (+) True G88238
TU109668 other upstream 2794514 26152068 ~ 26197076 (+) False AMCG00021703
TU109403 other upstream 3625613 25276776 ~ 25365977 (+) False AMCG00021682
TU109135 other upstream 4813600 24174509 ~ 24177990 (+) True AMCG00021656
TU108421 other upstream 7755510 21235070 ~ 21236080 (+) True G86861
TU110172 other downstream 54990 29060887 ~ 29065339 (+) True G88276
TU110265 other downstream 372678 29378575 ~ 29382273 (+) False AMCG00021779
TU110267 other downstream 372678 29378575 ~ 29382273 (+) False AMCG00021779
TU110433 other downstream 1261505 30267402 ~ 30394221 (+) False AMCG00021803
TU110432 other downstream 1382940 30388837 ~ 30394221 (+) False AMCG00021803

Expression Profile