RNA id: AMCG00021880


Basic Information

Item Value
RNA id AMCG00021880
length 10447
RNA type mRNA
GC content 0.42
exon number 32
gene id AMCG00021880
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030130.1
NCBI id CM030130.1
chromosome length 39556810
location 35108615 ~ 35175768 (+)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome
species bowfin
(Amia calva)

Sequence

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Function

GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU111048 lncRNA upstream 688558 34419791 ~ 34420057 (+) True G89010
TU111044 lncRNA upstream 720943 34387254 ~ 34387672 (+) True G89006
TU111010 lncRNA upstream 722413 34383959 ~ 34386202 (+) True G88981
TU111009 lncRNA upstream 734950 34369970 ~ 34373665 (+) False G88980
TU111008 lncRNA upstream 736435 34369970 ~ 34372180 (+) True G88980
TU111320 lncRNA downstream 230942 35406710 ~ 35406984 (+) True G89222
TU111386 lncRNA downstream 685148 35860916 ~ 36195602 (+) True G89280
TU111391 lncRNA downstream 716395 35892163 ~ 35893862 (+) True G89283
TU111393 lncRNA downstream 724875 35900643 ~ 35901176 (+) True G89285
TU111411 lncRNA downstream 787990 35963758 ~ 35970466 (+) True G89298
AMCG00021882 mRNA upstream 22111 35077101 ~ 35086504 (+) True AMCG00021882
AMCG00021881 mRNA upstream 31525 35028870 ~ 35077090 (+) True AMCG00021881
AMCG00021883 mRNA upstream 125527 34981577 ~ 34983088 (+) True AMCG00021883
AMCG00021871 mRNA upstream 283939 34820340 ~ 34824676 (+) True AMCG00021871
AMCG00021872 mRNA upstream 372272 34718666 ~ 34736343 (+) True AMCG00021872
AMCG00021884 mRNA downstream 24477 35200245 ~ 35218131 (+) True AMCG00021884
AMCG00021886 mRNA downstream 404191 35579959 ~ 35593338 (+) True AMCG00021886
AMCG00021894 mRNA downstream 688981 35864749 ~ 35887253 (+) True AMCG00021894
AMCG00021893 mRNA downstream 808287 35984055 ~ 36013655 (+) True AMCG00021893
AMCG00021899 mRNA downstream 1290018 36465786 ~ 36501828 (+) True AMCG00021899
TU111156 other upstream 67327 34926553 ~ 35041288 (+) False AMCG00021881
TU111160 other upstream 67327 35037839 ~ 35041288 (+) False AMCG00021881
TU110433 other upstream 4714394 30267402 ~ 30394221 (+) False AMCG00021803
TU110432 other upstream 4714394 30388837 ~ 30394221 (+) False AMCG00021803
TU110267 other upstream 5726342 29378575 ~ 29382273 (+) False AMCG00021779
TU111226 other downstream 35365 35211133 ~ 35263537 (+) True G89142
TU111415 other downstream 788803 35964571 ~ 35967384 (+) False G89299
TU111425 other downstream 788803 35964571 ~ 35967384 (+) True G89299
TU111747 other downstream 2945489 38121257 ~ 38151049 (+) True G89578
TU111748 other downstream 2945489 38121257 ~ 38151049 (+) False G89578

Expression Profile