RNA id: TCONS_00009505


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00009505
length 276
RNA type mRNA
GC content 0.27
exon number 13
gene id XLOC_004808
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007123.7
NCBI id CM002896.2
chromosome length 49182954
location 30498412 ~ 30529576 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

ATGGAGAATCTTAAtagtacattttattataaacagCCAAGTTCCAATCAAATTAGGGAGATAATAAGCTGGAAAaaaaaaaaaagatttttaatcaTAAAGaaaaaaaatagtggaatttttaacatgaaatattttaatAGCACAGAGGAAGAAGAGCACTTGAAGGTTTTAGAGATCCATTCAAAAGATTTGTTGTACATTTTTGAAAACTCACAGATAGCTTTTGAAGTGATTTTGAAGacaccaaaatgtAATGCTTCATCTTTGATCTTT

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000182598

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00010951 lncRNA upstream 23260 30470981 ~ 30475152 (+) True XLOC_004807
TCONS_00009502 lncRNA upstream 65448 30429833 ~ 30432964 (+) False XLOC_004806
TCONS_00009503 lncRNA upstream 65448 30429860 ~ 30432964 (+) False XLOC_004806
TCONS_00010950 lncRNA upstream 65448 30430735 ~ 30432964 (+) True XLOC_004806
TCONS_00009504 lncRNA upstream 65784 30430642 ~ 30432628 (+) False XLOC_004806
TCONS_00009511 lncRNA downstream 100443 30630019 ~ 30633002 (+) False XLOC_004813
TCONS_00010952 lncRNA downstream 100458 30630034 ~ 30633002 (+) False XLOC_004813
TCONS_00010953 lncRNA downstream 100511 30630087 ~ 30633002 (+) False XLOC_004813
TCONS_00010954 lncRNA downstream 100514 30630090 ~ 30631389 (+) True XLOC_004813
TCONS_00010746 lncRNA downstream 102220 30631796 ~ 30632376 (+) True XLOC_004814
TCONS_00009499 mRNA upstream 75956 30367079 ~ 30422456 (+) False XLOC_004805
TCONS_00009500 mRNA upstream 78460 30367371 ~ 30419952 (+) False XLOC_004805
TCONS_00009501 mRNA upstream 125568 30368145 ~ 30372844 (+) True XLOC_004805
TCONS_00009496 mRNA upstream 131404 30360184 ~ 30367008 (+) False XLOC_004804
TCONS_00009498 mRNA upstream 131792 30360579 ~ 30366620 (+) True XLOC_004804
TCONS_00009508 mRNA downstream 33974 30563550 ~ 30567711 (+) True XLOC_004811
TCONS_00009509 mRNA downstream 57023 30586599 ~ 30618440 (+) False XLOC_004812
TCONS_00009510 mRNA downstream 57141 30586717 ~ 30588289 (+) True XLOC_004812
TCONS_00009512 mRNA downstream 123471 30653047 ~ 30681927 (+) False XLOC_004816
TCONS_00009513 mRNA downstream 124366 30653942 ~ 30681342 (+) False XLOC_004816
TCONS_00009491 other upstream 286966 30207213 ~ 30211446 (+) False XLOC_004802
TCONS_00009487 other upstream 297643 30168330 ~ 30200769 (+) False XLOC_004802
TCONS_00009482 other upstream 527783 29970513 ~ 29970629 (+) True XLOC_004801
TCONS_00009481 other upstream 538358 29959940 ~ 29960054 (+) True XLOC_004800
TCONS_00009480 other upstream 686452 29811844 ~ 29811960 (+) True XLOC_004799
TCONS_00009521 other downstream 196848 30726424 ~ 30756585 (+) False XLOC_004818
TCONS_00009526 other downstream 666250 31195826 ~ 31195950 (+) True XLOC_004821
TCONS_00009527 other downstream 678860 31208436 ~ 31208551 (+) True XLOC_004822
TCONS_00009554 other downstream 1387367 31916943 ~ 31917052 (+) True XLOC_004837
TCONS_00009570 other downstream 2422206 32951782 ~ 32951896 (+) True XLOC_004848