RNA id: TCONS_00009609


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00009609
length 119
RNA type rRNA
GC content 0.48
exon number 1
gene id XLOC_004869
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007123.7
NCBI id CM002896.2
chromosome length 49182954
location 34881777 ~ 34881895 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TGTATTGGCCACTgctcaccctgcagcccaagactggttacttacTGATGCTAAGAAGGGTTGaacctggttagtacctggatgggagaccaaatgggaaaactaggttgttgTTGCAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000121030

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00010974 lncRNA upstream 34935 34844442 ~ 34846842 (+) True XLOC_004867
TCONS_00010973 lncRNA upstream 135446 34732315 ~ 34746331 (+) True XLOC_004864
TCONS_00010971 lncRNA upstream 411314 34459669 ~ 34470463 (+) False XLOC_004863
TCONS_00010972 lncRNA upstream 411314 34459718 ~ 34470463 (+) True XLOC_004863
TCONS_00009598 lncRNA upstream 700343 34179988 ~ 34181434 (+) True XLOC_004860
TCONS_00010975 lncRNA downstream 176252 35058147 ~ 35059608 (+) True XLOC_004874
TCONS_00010976 lncRNA downstream 463930 35345825 ~ 35348411 (+) True XLOC_004879
TCONS_00010977 lncRNA downstream 823238 35705133 ~ 35706948 (+) True XLOC_004884
TCONS_00010978 lncRNA downstream 956393 35838288 ~ 35842371 (+) True XLOC_004885
TCONS_00010979 lncRNA downstream 1039282 35921177 ~ 35925412 (+) True XLOC_004886
TCONS_00009608 mRNA upstream 11688 34854562 ~ 34870089 (+) True XLOC_004868
TCONS_00009607 mRNA upstream 39265 34827808 ~ 34842512 (+) True XLOC_004866
TCONS_00009603 mRNA upstream 58956 34763795 ~ 34822821 (+) False XLOC_004865
TCONS_00009605 mRNA upstream 60969 34768106 ~ 34820808 (+) False XLOC_004865
TCONS_00009604 mRNA upstream 60969 34768106 ~ 34820808 (+) False XLOC_004865
TCONS_00009610 mRNA downstream 9634 34891529 ~ 34892823 (+) True XLOC_004870
TCONS_00009611 mRNA downstream 15061 34896956 ~ 34901874 (+) True XLOC_004871
TCONS_00009612 mRNA downstream 71143 34953038 ~ 35019303 (+) False XLOC_004872
TCONS_00009613 mRNA downstream 71189 34953084 ~ 35014160 (+) False XLOC_004872
TCONS_00009614 mRNA downstream 71236 34953131 ~ 35014187 (+) False XLOC_004872
TCONS_00009593 other upstream 901697 33975142 ~ 33980080 (+) True XLOC_004859
TCONS_00009582 other upstream 1414048 33460822 ~ 33467729 (+) False XLOC_004852
TCONS_00009570 other upstream 1929881 32951782 ~ 32951896 (+) True XLOC_004848
TCONS_00009554 other upstream 2964725 31916943 ~ 31917052 (+) True XLOC_004837
TCONS_00009527 other upstream 3673226 31208436 ~ 31208551 (+) True XLOC_004822
TCONS_00009621 other downstream 224680 35106575 ~ 35107998 (+) True XLOC_004876
TCONS_00009628 other downstream 729803 35611698 ~ 35611814 (+) True XLOC_004881
TCONS_00009648 other downstream 2816707 37698602 ~ 37698717 (+) True XLOC_004908
TCONS_00009670 other downstream 4548307 39430202 ~ 39430317 (+) True XLOC_004923
TCONS_00009671 other downstream 4621669 39503564 ~ 39503678 (+) True XLOC_004924