RNA id: XM_043217409.1


Basic Information

Item Value
RNA id XM_043217409.1
length 7686
RNA type mRNA
GC content 0.40
exon number 4
gene id ece2a
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056700.1
NCBI id CM032069.1
chromosome length 25613461
location 21533245 ~ 21621097 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome
species tiger barb
(Puntius tetrazona)

Sequence

CCAACAATTGCTTGACGAGAATCATAACATTATATGTCtcctaaatgtaatttaaaatgtaaacttttccGTAACAAAAAACAGTCTGGTTTATTTCCCAATGCCAAAAAACCTCTTGCGTTTtgctgaacttttattttgacatcgCAGCATTGACTTCCCACTCTTGACGTCACGATGACCGGCACGAGtagGATGGAGTATTTGCCGGACTCTAATGCCAGATATAAGGATGTGGATTACTGGAATGAACGGTACCGGACGGAGGAGAGCTTCGAGTGGTTCGGGGACTTCACTAAATTTGACCATCTGCTCAAACAGCACGTGGGAACAGAAGAAAACATCTTGATGCTAGgTTGTGGTAACAGTGCTCTGAGCTATGATATGTACCAGGCTGGCTTCACCTCCATCACTAATGTGGATTACTCCAGTGTTTGTGTGGAGAGCATGGCGGAGAGACACAAGAACTGCGCTCAGCTCAGCTGGCTGTGCATGGACGCCCGgcgactggccttccctgacggTGCATTTGATGTGGTTTTGGAAAAGGGAACTCTGGATGCCATGCTGGTGGAGGAGAGCGACCCCTGGAAGGTCTCCGAGAACGCGGCCCGACTGCTGCACCAGGTTCTCTTGGAGGTCAGTCGTGTTTTGAAACCCGGCGGGCGTTTCATCTCTGTCACGTTTGCACAGCCGCATTTTCGTAAGAGACTTTACGCTCGAGCGGAGTATGACTGGTCTATCAAGCACTATCACTATGGCAGCAGCTTCCACTACTTCCTCTATGTTCTCACCAAAGGGGAGGAGCTTAGCTCAGAGGATGCTGCACTGGAGAGGAGACTGCTTGAGGAAGCTGAGGCTCTGCCCACCGATGTAAGATTTCAAGAAGTGGATTCTGAGGACTTCCTGAATAACATTGGATTATAGGGACTTGTACAACATCTGTCAATCAAGAGAATCCTGACAGAAGTTGTACAtcaattttagacatttttttaaggcTCCTGTtcaagttcacccaaaaatgttaattactcTCACAAATGTTGGTCTACATtttatttggattatttttCTTCCATGgaactaaacattaaaaaatagtgGTAGTTTTTGGAATTTGACATGCTCCGTCTCCATTTACTTTGTTACATTTGTGTTCCAGGAAAGAAAGTCGTACAGGTTTTGAAACAACATAAGGACagacattacatttttgtgtgaacctatcttgtatatatacataggttttttttttaggatgctATGATGTGAATTTGTTCtgtgtcttttcttctctctctctctctctctctctctctctctctctctctggcctATTTCTCTGTGCGATTGTGTTGATTGGTATGACAAGGTTGAGTGTTTGACACCTGCACACTTGTGCAGAGACAAATCTGTCACAAACGCTTctcaaacaacaaataaacagacagacagaaaacaaacagccCTGCTGTGTGCCAGAATATGACAGACGTGTCTGCACTCTTTTGGATGAGGAATGGCTGCAGTGAATCGGAGGAGGCCATTAATAAAccagaaatcatttatttttaatttagctctGGAATGTAATTACCGTCTATTTTTAAGACTTGAAGAAGGTGCCTGAATTTCAGAACAGCTTCCTGTGTGCCAGTGTGAATATagattgatttttattgtaaatagaGGAAAGTTATTCTTGAACCAGGAGAgaccaaaacatatttaaacccACACtatgttgtgggtggttgccaagGCGTTACGAGTTCTTTTTAGAATGTTGCTAGGCAGTTTCTAGGTTGTGTACAGAAAAGGCTCCCCAAAATTGACAGTTGTATCACTAAATATGGCTTGGGTAAATCTATGGGAGTTTTTCATCCACTTTATTGTCTTCCAGGTGAAAACCATGCAtttgattgtaaaaaaaaaaagcaatagtaCACCTCTTCTCCGTAACTTGTGCAATTTGAGGAACTCTTTATATCCACGTGACTTACACACCCATATTAAAACTAAGGCGATGGGTTTTGGAGCCCTAACTCTACAAAAGTAATAGTGAGCATGTACCATTAAATAGCAGCGGTTCATATACCGGTAGCAGTTTCATAAACTTTTAGTTCAGTGTTGATTGTGTCCAGATTGAATGTGTTATCTGTGAAAGCTGATGATGTAGTCACAGGTCTTTCCCCTTCACTGAAGCACTAAGCAATGACGTCAGGGCAGGGACGGTATCAGATGGATGCTGGTATCAGGTGAGCCGCACGTATCGGGTGTAGATTTATTCTGTGATCGTATCCTCACGACATGCTGTGTGGCGGTTCTTCAGGAACCAAGTGCTGCCTAAACACCATGAAGCTGCCGCAGAGAACCGGAGACCCTGATTAGTCTAATGGCTGGTTATGTGTTGTTTACCCCCTCGCAATGCAAACCCACACGCAAGCTTTACTTCATATTGACATTTAAGACGATGATATTCaataatgtacttttaaataattgattagGAGTAATTTCAGAAGTGCTCTTGTGAGATATTTTCTGAGCTGTTGTCCTGTCTTGGTGAAGAACTGGAAGAGTTCTTGTGTGGTATTCAGCAGTTTGATTTTGTATGCTATGGACAGTTAGGGTTAGATTTATTGACAGCAATGCTGCCTTGTTTGAAAAGCCTTGAGGTTTAATTAatatggatggaaggatggatagacggatggactgatggatggatagacggatagactgatagatgaatggataaacggatagatagatggatggatagatgaacaGGTGGATGGATGGTTAGTTGGATGGATAGATTGCAAATAGATGgttggacagacagacagacagacagacagacagacagacagacagacagacagacagatagatagatagatagatagatagatagataggcaggtagaaggacagacagacggtgaataattaaaaaaatagctggatatctatctatttgtctatACTAAAATTCCCACTCATCATGAATCAAAAGTGAGCCTGCTCTTTAATTCAGATTTATGCCCAGAGCTGCTTTTTAATGGTTGTCAATAGAGAATGAAGCTTTCTAGGTCCAGATGGTGTAGTTACgacatctaccagcaggggctaacCAGAGGGGATAACCTGGCAAACCTTGACCCCACTGGTGCATCCTTGCCTCTAGTTTACAGACAGATCCTTTTCATGAGTCACTGTTACCGCACACACAAGAAGAGAGTCAAAATTGACCATTTGACCATTCGATATCATTAATCAAAGACTGTTCATCATAGCTCATGTTTCTGTTCTGAGAAGGGGGAGGGGTCAGGACACACCATTACATCATCATCCAGCAGCGGCAGCAACAACAGGCCAGGGGTATTGATAGCAGACACATAAACCCCTGCTCACAGCCAGCCAGCTCCACTGACAACGTTAGGGTAAACATTGCACTAAGCTGCTTTACGCACAGAGacgtgtgaatgtgtgtgagattgGTCACTACTGTTCGTAAGGTTAAAACAGTGACATTTTTGGAGCAGCACTGCAAAATACAATTgactgattttattcatttaaaacaaatggttTAGCTAACTCTGTTATCCGTATAGCATCTCTCTGTTATGTTCAGGGTTATTTTATGAGttgaaagtttaaataaaattactgaattaaattgcaatttaaattttgaccaatgcagtttttttaaatctctagAGTCCTAGGTCATGttatacttataaataaatagtatgcCTTAATGATAACAAatttaatgtttacatattaacaGTATGTAATTTTACAcgtttacattgtttttttttttttaagtgttttggaACTGCATAAGCTTCTATAACATTTACCAGTTTCTGATGGCAccttttttatatgcaaaatatgatATATCAGTTTGTcactgtatttaaaagaaatttggtgaaaacaaatttttggcaatttgtttgcttttaatgtgGTTTGCACATGTTGTTCTGGGTCTGgttttggatggatggatggatggataaacaGATTTTTGATGCATGAATTTGCAGCTTACTTGAATTGGTGTTTTTCAAACTTGTGCTCCAGGTTGAATGGCAATTGCAATTCATTCAGTATCTCTTTCTGTCATTTCCAATTTAGCATCCTTAATGGTGTGGCCAGTTCAATTTAAATTCGATTGCTTTATATATTCAGTGTAGTTGACTTTTTCAGGTAGTTCCTGTTGTAGTAGTGTAACatgcaaaatttaattttgagctGCAGACTCTGGAACAACATCTGGAACAACCTATTCATATTCCATGAGCTTCTCCTAAactcaaagcaaaatgaaaggATGAATGTCAAGTCCCAAGCCAATCCCAAACATGATTAGTTGAATATTGTGCTACAACCAACCAGGATGTATATCCAGGATCATATCCTGCTTGTCCTTGGATAATCAGAGCCACACTGAGCCATGCGGTCAAGGAGAATCTGGTTTGCAACATTTCCAGATGCTATTCAACCGTCTTTTGCGGATCAGTTCATGTCCTCTCTTTGATCCTTTTTAATAGTatgaaaaatgattatttgGTTTGGCAGTATGATACTGACATCATTTTCTCATTACTAACGATTCAGATCAAAGTAGCACCAACAAACTTGGATGAATCAAGGAATCAAtgcttttaaatcaaatgtctTTCTCTCGTGCTTTTCATTTCTTCCGGCTGAGAGCTCATTCTTTAAGAATCTTAGAATGtcatctctccctctttcttccGTTATCACGCAGTCATTATCTGCTGAGAGTTGGGCTTTCCATATTGGGTCAGGCCACAGCGTCGCTCAGTCACTCCAGAGCCGCCGCGGGCCGGCTGTCTGTTCAGATAGTGTATCAGTAATCTCCAGCTCTGAGCAGCCTGTGTGAAGCGCTAAGGATTCCCCTGGGCATTGGAGCCGTTCAGGAACACTGCAACAGCCATGAA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Function

GO:

id name namespace
GO:0032259 methylation biological_process
GO:0008168 methyltransferase activity molecular_function

KEGG:

id description
K22857 EEF1AKMT4; EEF1A lysine methyltransferase 4

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU21112 lncRNA upstream 747 21556844 ~ 21557398 (+) True G14285
TU21010 lncRNA upstream 187646 21365808 ~ 21370499 (+) True G14212
TU21039 lncRNA upstream 212044 21342371 ~ 21346101 (+) True G14234
TU20627 lncRNA upstream 389258 21166088 ~ 21168887 (+) True G13983
TU20644 lncRNA upstream 404363 21152103 ~ 21153782 (+) True G13995
TU21152 lncRNA downstream 96899 21716771 ~ 21717992 (+) True G14315
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XR_006252672.1 lncRNA downstream 191057 21810929 ~ 21812903 (+) True LOC122359002
TU21366 lncRNA downstream 229335 21849207 ~ 21850069 (+) False LOC122327294
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XM_043217338.1 mRNA upstream 25861 21504200 ~ 21532284 (+) False yeats2
XM_043217329.1 mRNA upstream 25861 21504360 ~ 21532284 (+) True yeats2
XM_043217763.1 mRNA upstream 56535 21483779 ~ 21501610 (+) True klhl24a
XM_043252934.1 mRNA upstream 75503 21481134 ~ 21482642 (+) True LOC122354659
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XM_043223839.1 mRNA downstream 62159 21682031 ~ 21687571 (+) False LOC122328123
TU21079 other upstream 75827 21481676 ~ 21482318 (+) False LOC122354659
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TU21008 other upstream 196437 21337682 ~ 21361708 (+) False G14211
TU20650 other upstream 393323 21164297 ~ 21164822 (+) False G13998
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TU21370 other downstream 241019 21860891 ~ 21861442 (+) True G14471
unassigned_transcript_253 other downstream 308875 21928747 ~ 21928819 (+) True trnam-cau_1
TU21525 other downstream 1071379 22691251 ~ 22695330 (+) True fcer1gl
TU21973 other downstream 1925234 23545106 ~ 23547974 (+) True G14831

Expression Profile