RNA id: TU126277


Basic Information

Item Value
RNA id TU126277
length 13346
RNA type TUCP
GC content 0.43
exon number 2
gene id G85232
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056710.1
NCBI id CM032079.1
chromosome length 20499150
location 2767908 ~ 2781353 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome
species tiger barb
(Puntius tetrazona)

Sequence

GGACTTTGTGCTCAGCGATCAGAGCACCTTCTTGCTTGCCCGCCCCTGCCTTCACACCATTGGCTGATTCCTGAGACGCTGAGCAGCGGGGCATAGTATCAGACTGCTCGCCATTTTGCCGAGGTTTTCCTGAATCCGCTCGGGATGATGATGTCATGGAGTCACTGGAGTTCTCCTGACTGTAAGGGGttgaaattttacatttagtaaggaagaaattcactaaaataatgctatgtaagaatgttttaaaaacaataccaTGCATTCTGGCAAACCTGtataatgtagttttattttttattttttggatttagattttttcattttgtctttatttaggTAAGATAGTGTAGAGTAGACAAAAAGCAAAGTGGGAAAGAGAGGGAAGTGGGATTGGAAAAGGTCCTTGAGCCAAGACACAGAGTCAGGACACCTGCAACGCAATGGCGTtaaaagagacttctttcatcaacataatttgaaataattaaataaaataatttgaatgcatCCTTATTTAGtactaattttgtttaaaaaaaataacatgcttaACCCAAATTTTTTAAAGGATGTTCATTTACAAGCATTCATAACTGAAGAagttgtaataaatataaattgatgAAAGTGGTCcttattatgttttatgaatttCTGACTTTACAAACCCAAAGACTTCAGCTGTTCTAGCACCTTAGTTCCTAAAGATGGTCTTTCTAGTAAAAAGGAcatgcttttacatttacagtttgtCTTCTAGtacttaaaacatattaaattaaatttcttatGATATGATTAAATGTGGGTAATGTCAGCGTAATAATTGTAACTATGTACAGTACCTGTTGTCTTGTCGGTCCATGTAGTCTGACCCATGACCCCGCCCTGAAGCGGGCGGCTCTGTGTTTGATGTCTCTGTGAGCCAGCCTGCAGAGAGCGAGCACAACTCAGACTCAATTTGTTCAACACCTCTCACTacctctctcactttctcctTAGTCATCTCCTCATTCActtccctctccctctctccgaTGTGGCCTCCTGACACCTCCGGTTGCTCCTGCCTTTGctcgtcttcctcctcctcctcctcctcNNAAAGGGGACTCATCATGATCTTTGACCTCTTTCAGAATCACTTTCTCCTGTCCCCTCGTGTTAAGATTTGGTTCTTTTAAAGATGATGGTAGTAATGATGATGAGGGACAATCTTCCTTTTCCTTGTGTGCTAGCTCTATCTGTTCCACCGGAGGAGAAGATTTCTGTTGGTCctcattttcttcttcttttcttgcCTGGTTTTCCTGTATGAGGTGGTCTTGTTCGATCCTGATCATGGGTGGGTCTGTTTTTGGGACAGACTGGAGTGGTACAGAGCAAACCGAGGGATTTAGAGGAGGTTCATCGTGGTCTAGGGGAGAAAGCTTATGGGTAAGGTGTGATTCAGGGTCACATGTGACAGCTGAGAGTTGTGTTGTGAGTTCGGGGTTGTCGGAAGGGAGCTGAGAATTAGgggagagtatgtgtgtgtgtgtgtgtatttgtgcagttgtttcagagagtgtgtgaggcTGATTTACAGGTTTGGACAAGGGTAGGTCGCAGGGTCTGGTTGGGGCGATTCTGACAGACTCGTCCTCATTGTAACGCTCTAGTTCCCAAGAAGGGCAATAAGGGGGAGGGTCAAGGGGCAGATCTAAGATGGGTTCGATGTCATCAGACATAGTGGGGCAGATAGGGGGTGTGGTGGGGGTGGGACTGGTAGTTGACTGCAGTTGAGCCAGGATGTTGTGGTAACCTGGGTGAgatgatacacacacaaatggatGGACATGACAGGACACAATtacaatcacacacaaacaggcaCACACATTAACATGCTTAAAGtaacagtttacccaaaaatttaagTTCTGCCATTAAtgtttactcatcctcatgttgtttgtttcaaacctgtatttcagtcatttatttgaagtaacatgagggtgagtaaataccAATTACATTTCTGggtaaactattttttaaacatagacACAGACAATCACCTAATCCCACCCAGAAGAGCAAAAGTACAGTATTTGACAGTATTTCCCAGAGATTCAGCAGGCATACAGaccaacaaacacacagttaATACATAATGGCAATGGAACAGATTCAGATCTCCAAAAACAGAGAGATTGTGATTGTGTGTATAATACATatgaaaagtttggggtcggtacgattttttgaagaaattaatacttttattcagcaaggatgcattgatCAAAGTGAATATTCATCAGTGAACAATGTTTCCCAcaaaaatgcttcttgagcaccaaatattcatatcagaatgatttcttaaagaTCATGTGATCAGACTGGATTAATGGCAGGTGTAAATTCAGCTGTCATCACAAGAGTAAAtgatactttttaaaacatattaaaataaaaaaaagaatttagaatatttcacaatattacacctattttaatcaaataaatgcagctttggtgagcataaaagacgtctttcaaaaacataaaaaatccttaccaaccccaaacatttgaagaGTAGTGTATATCTATGTGTGATCTCCCCATAGTCAAAGGATAGAtggagtgtgtgttcatgtcaACCTTGactcaaaaaacaaaagtgctaCATTAGACTTAACATTTGAgtctataataataaagtggAGTAACAGTTTAGATTTGGGAGCACATATTAACTTTTAACAATAAACTCCTTATTCTATTTGAAGTAAAATGGTTGTTGTAGTCGTTATTTTTAGGTAATGAGTAGCATTCAGTGTATTacaatatggtcatgcagaataaggctttatttttacatataataacaGTCATTCTTAGTACGTAATATTacatactaataaacagccaatatacaAGGAAAAAATACCTAGTGAATAGTGTTCTCTAATGTAAAGGAGTCACTTTCATCGGTTAGTTAGACACCTTTACAAATGTTCAAATAAGAAGCAGTTGAGATGTGTGCTACTACTAGTATGGGGAGACTCATAATCTGGCTAAATAATGAGGATATTGAtgtctgttcagatgaagagcTCAACAGTAGAGGAGTTAAGACAGAGGGATGAAGTAGTGAGGGGTGGTCCTGGGGGCATGCAGGGGCAATGACAGCATGCACAAGGAGGCAATGGTGTGGGAGGTGGGGAGAAGGAGGCAGGACTCATGCAACGTGATGCACAGGGAGAGGaagaaggaagaaaagaagGGCAAGGTAAGGGAGAGAGACAAATTCTATGTGCCGAAACAGGAGATGACAGGCTGAGAGcaggagaaggagagagagaggagagagagaagtaaGATTTAAGAAGAGCAGATGATGATAGAGAACTGGATGGCAAGTCTTGGGCCACATGAGGATACAGTTGTATGAGGTGTTGTGGTGGAGTATACAGCagacgcagacacacacacacacacacacacacacaNNGGCTATATTAATGAGAAAAATGAGGTTCTAGGGTCTGGGAGGGGGAAATGAGGGATTGTACTGGAGGAGAGGAGACGACAATTCATTTTGTATCTGACAGAGGGATGCACAGGAGACTGTCAGGAGGAGGAGACTACGGAGAGAAGGATTAtctccttctttctcttctttttccccCTCTCACTTTTTATCCCTTGCTCCAGTGCAGGGAAGGAGAGGAGAGAAGGATAGATGGAGGAGGAAGCAGATCGACAGCTTGAGAGGCAGAGGACAGCTGAGTCTTTTAGCTGAGGCCATGCGCTTTGGTCCACTATGTAAAACAACATCTGGCCTGTAACACTCCTACCAACTGATATCAAAAGAGCTTCATCAGGATACTGCTgataataacatgcattttgtttggAAATATCTCTTTCCTTAGCTTTCAATAACAGAATTAATTTCATAACAGAGAACAGTGTTCATTTCATGTTCCACTGGCAACGTACTGCAGGGCCTTcattaaaaccaaaagaaaagtGTGTACATGTGTAACAGGAAAATATTTTTCGAGTGGCCCTTCCTACACTTGTTGAGGCAAAGCATCATGCTGTGATTGCTTCACGTCACATGaccatatacatgcatgttcaAACCAGGTCCATGCATATGGTGTTGGGAGGAAGGGAAAGGGGTAACAGAAATGAAGTTTTTGAATACAGaaagtctttaaaataaaagaatagtgAGTGATTaagtaagagtgtgtgtgatcaggGCCTGTGGCCTAATCTTCTGTAAATGTGGCTTCTGTAAATCTCACTAagatttcaaattcaaaatagtAATTATTGGTGGTCCATCTGTGATTAGCAATTTGGCAAACTGCACAGGGAGGTTGTAGAGGAAAAAACAAAGGTGACACTCAAAAAGGAATGAGTTGGGGAGGAGAGGGTGGGTTGGGGTTGGGTTTGGGGGGGGGGAGTGGATTCAGCTAGATGGGGCTAAACTTTACCATCCGCCTTTTCCTGGCACACAGCGCTATCATCTGCAAAACTTCTGGTGCCTGAAATGTTACCATAGTCAAATATGGGCCCTTCCAGCAGAGTCACAATATCCATCCGGTTCACTTTAGTCAGGACAGCCGTCAGTGCATCCGCTAAGAAAGCATAAATAGTGacttacatttatttgctttaggtAGATGTTATAACTTCACAGAACatacaagaaagaaaaagaaagaaattaatgagaaaaaagacagatggagagaaaatgACTCTCACTTGTGGCGTTTTTCCCATCCCGACTGACCCACTTCTTAAGGAGCATAAAGCTCTGGGCTGTGAGAGAGTTTGGGTTCTCTGTACGAATGTGGTTTATCTCATCCACAGAAAAATTCATCTCTCGAGCCAGCTCtataaatcagaaaaacacataatgttATAACTAGCATCACCTCTGCACAGTGAGCTAGTAAAGGAAGACAAATGTAAAGACA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Function

GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU126237 lncRNA downstream 87591 2680044 ~ 2680317 (-) True G85216
TU126235 lncRNA downstream 88617 2678722 ~ 2679291 (-) True G85214
TU126176 lncRNA downstream 191002 2573311 ~ 2576906 (-) True G85165
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TU126188 lncRNA downstream 281704 2485194 ~ 2486204 (-) True G85174
TU126283 lncRNA upstream 10567 2791920 ~ 2792523 (-) True G85235
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TU126331 lncRNA upstream 137832 2919185 ~ 2947389 (-) True G85257
TU126448 lncRNA upstream 169483 2950836 ~ 3037584 (-) True G85342
TU126466 lncRNA upstream 375463 3156816 ~ 3159743 (-) True G85355
XM_043253233.1 mRNA downstream 58979 2704288 ~ 2708929 (-) True LOC122355185
XM_043253150.1 mRNA downstream 151621 2605131 ~ 2616287 (-) False slc4a1b
XM_043253149.1 mRNA downstream 151621 2605131 ~ 2616287 (-) True slc4a1b
XM_043253151.1 mRNA downstream 154155 2605131 ~ 2613753 (-) False slc4a1b
XM_043254406.1 mRNA downstream 164216 2597896 ~ 2603692 (-) False atxn7l3b
XM_043254049.1 mRNA upstream 68623 2849976 ~ 2860000 (-) True LOC122355585
XM_043254050.1 mRNA upstream 88768 2870121 ~ 2877710 (-) True LOC122355586
XM_043254449.1 mRNA upstream 223076 3004429 ~ 3083353 (-) True LOC122355866
XM_043254446.1 mRNA upstream 224243 3005596 ~ 3063570 (-) False LOC122355866
XM_043254447.1 mRNA upstream 226132 3007485 ~ 3063570 (-) False LOC122355866
unassigned_transcript_1807 other downstream 274117 2493710 ~ 2493791 (-) True trnal-uag_3
TU125823 other downstream 820496 1870773 ~ 1947412 (-) False ank3b
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TU126483 other upstream 517195 3298548 ~ 3299606 (-) True G85366
unassigned_transcript_1808 other upstream 1213738 3995091 ~ 3995185 (-) True trnal-uag_4

Expression Profile