RNA id: TCONS_00014213



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00014213
length 118
RNA type rRNA
GC content 0.53
exon number 1
gene id XLOC_007192
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007125.7
NCBI id CM002898.2
chromosome length 52660232
location 14909553 ~ 14909670 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


tgccacagccatatcaccctgcagccgaagaccagttactcactgaagctaggcagggctgagcctggtcagtacctggatgggagaccactaaggaatgctctggttactaaagtaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000165011

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00016173 lncRNA upstream 23422 14866579 ~ 14886131 (+) False XLOC_007191
TCONS_00016172 lncRNA upstream 23422 14866579 ~ 14886131 (+) False XLOC_007191
TCONS_00016174 lncRNA upstream 23422 14866761 ~ 14886131 (+) True XLOC_007191
TCONS_00016169 lncRNA upstream 68394 14836628 ~ 14841159 (+) False XLOC_007188
TCONS_00016175 lncRNA downstream 82907 14992577 ~ 14994921 (+) False XLOC_007193
TCONS_00016176 lncRNA downstream 244913 15154583 ~ 15155416 (+) True XLOC_007195
TCONS_00014220 lncRNA downstream 295265 15204935 ~ 15210747 (+) False XLOC_007198
TCONS_00016177 lncRNA downstream 298884 15208554 ~ 15210202 (+) True XLOC_007198
TCONS_00016178 lncRNA downstream 370456 15280126 ~ 15280589 (+) True XLOC_007199
TCONS_00014212 mRNA upstream 44213 14847745 ~ 14865340 (+) False XLOC_007190
TCONS_00014211 mRNA upstream 44213 14847745 ~ 14865340 (+) True XLOC_007190
TCONS_00014210 mRNA upstream 44505 14847304 ~ 14865048 (+) False XLOC_007190
TCONS_00014207 mRNA upstream 63387 14841685 ~ 14846166 (+) False XLOC_007189
TCONS_00014208 mRNA upstream 63584 14841729 ~ 14845969 (+) False XLOC_007189
TCONS_00014214 mRNA downstream 83239 14992909 ~ 14996925 (+) True XLOC_007193
TCONS_00014215 mRNA downstream 155200 15064870 ~ 15068562 (+) True XLOC_007194
TCONS_00014216 mRNA downstream 246014 15155684 ~ 15156724 (+) True XLOC_007196
TCONS_00014217 mRNA downstream 281506 15191176 ~ 15232400 (+) False XLOC_007197
TCONS_00014218 mRNA downstream 281506 15191176 ~ 15258549 (+) False XLOC_007197
TCONS_00014209 other upstream 63394 14844916 ~ 14846159 (+) True XLOC_007189
TCONS_00014206 other upstream 72283 14837073 ~ 14837270 (+) True XLOC_007188
TCONS_00014169 other upstream 2706360 12189837 ~ 12203193 (+) True XLOC_007167
TCONS_00014158 other upstream 2980397 11928543 ~ 11929156 (+) False XLOC_007163
TCONS_00014154 other upstream 3450497 11457529 ~ 11459056 (+) False XLOC_007162
TCONS_00014275 other downstream 3889764 18799434 ~ 18799558 (+) True XLOC_007232
TCONS_00014313 other downstream 6329012 21238682 ~ 21245773 (+) False XLOC_007253
TCONS_00014315 other downstream 6761437 21671107 ~ 21678917 (+) False XLOC_007255
TCONS_00014324 other downstream 6829946 21739616 ~ 21745484 (+) True XLOC_007257
TCONS_00014351 other downstream 7406564 22316234 ~ 22319001 (+) False XLOC_007271