RNA id: TCONS_00014275


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00014275
length 125
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_007232
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007125.7
NCBI id CM002898.2
chromosome length 52660232
location 18799434 ~ 18799558 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

caccacagccatatcaccttgcagcccaagaccagttactcactgaagctaagcagggctgagcctggtcagtaacCATGGTCagtatgggagaccacatgggaaaaactaggttgctgttgaaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000120461

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00016192 lncRNA upstream 267879 18508628 ~ 18531555 (+) True XLOC_007230
TCONS_00015966 lncRNA upstream 503315 18291987 ~ 18296119 (+) True XLOC_007229
TCONS_00016191 lncRNA upstream 506833 18291282 ~ 18292601 (+) False XLOC_007229
TCONS_00015965 lncRNA upstream 507255 18291752 ~ 18292179 (+) False XLOC_007229
TCONS_00016189 lncRNA upstream 806769 17967953 ~ 17992665 (+) False XLOC_007228
TCONS_00016193 lncRNA downstream 192595 18992153 ~ 18995961 (+) False XLOC_007233
TCONS_00015967 lncRNA downstream 192610 18992168 ~ 19000316 (+) True XLOC_007233
TCONS_00015968 lncRNA downstream 912704 19712262 ~ 19716338 (+) True XLOC_007235
TCONS_00014278 lncRNA downstream 1007083 19806641 ~ 19809124 (+) False XLOC_007236
TCONS_00014279 lncRNA downstream 1007083 19806641 ~ 19811485 (+) True XLOC_007236
TCONS_00014272 mRNA upstream 9653 18781082 ~ 18789781 (+) False XLOC_007231
TCONS_00014274 mRNA upstream 9653 18785727 ~ 18789781 (+) True XLOC_007231
TCONS_00014273 mRNA upstream 12377 18782610 ~ 18787057 (+) False XLOC_007231
TCONS_00014267 mRNA upstream 1382704 17397534 ~ 17416730 (+) False XLOC_007226
TCONS_00014268 mRNA upstream 1382718 17397535 ~ 17416716 (+) False XLOC_007226
TCONS_00014276 mRNA downstream 459144 19258702 ~ 19261266 (+) False XLOC_007234
TCONS_00014277 mRNA downstream 459144 19258702 ~ 19261733 (+) True XLOC_007234
TCONS_00014280 mRNA downstream 1356919 20156477 ~ 20191281 (+) True XLOC_007237
TCONS_00014281 mRNA downstream 1542995 20342553 ~ 20736925 (+) False XLOC_007239
TCONS_00014282 mRNA downstream 1543014 20342572 ~ 20411073 (+) False XLOC_007239
TCONS_00014213 other upstream 3889764 14909553 ~ 14909670 (+) True XLOC_007192
TCONS_00014209 other upstream 3953275 14844916 ~ 14846159 (+) True XLOC_007189
TCONS_00014206 other upstream 3962164 14837073 ~ 14837270 (+) True XLOC_007188
TCONS_00014169 other upstream 6596241 12189837 ~ 12203193 (+) True XLOC_007167
TCONS_00014158 other upstream 6870278 11928543 ~ 11929156 (+) False XLOC_007163
TCONS_00014313 other downstream 2439124 21238682 ~ 21245773 (+) False XLOC_007253
TCONS_00014315 other downstream 2871549 21671107 ~ 21678917 (+) False XLOC_007255
TCONS_00014324 other downstream 2940058 21739616 ~ 21745484 (+) True XLOC_007257
TCONS_00014351 other downstream 3516676 22316234 ~ 22319001 (+) False XLOC_007271
TCONS_00014367 other downstream 4276569 23076127 ~ 23155656 (+) False XLOC_007280