RNA id: TCONS_00014393


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00014393
length 300
RNA type mRNA
GC content 0.34
exon number 16
gene id XLOC_007291
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007125.7
NCBI id CM002898.2
chromosome length 52660232
location 24075254 ~ 24110480 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TGCTTCTCAGAAGATgtaaaaatttatTATTACAACAGGATATACCCAAATGTCCAAAATTCAGATAAGAAACTATCAGTAAACCTCAAAAGTGGAAACGGTAGAGTAAGacagactgacagacagacagGTCGAGAGCCGAAGACAAAACAttttttttttcccccacgaaaaTATAAATCAGAGAACGCATTCTcttctgcaaaaaaaaTAGTATTGAAGACAAaaaagTTAATTGTAAATGCTGAATCATTGATGCGTGTTAGGCTGatagTACTTAGAGAAATCTCTCACAGCAAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000181117

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00014388 lncRNA upstream 111113 23960728 ~ 23964141 (+) True XLOC_007287
TCONS_00014383 lncRNA upstream 364666 23709642 ~ 23710588 (+) True XLOC_007284
TCONS_00014368 lncRNA upstream 702538 23076128 ~ 23372716 (+) False XLOC_007280
TCONS_00015972 lncRNA upstream 1116034 22957867 ~ 22959220 (+) True XLOC_007279
TCONS_00014366 lncRNA upstream 1208673 22841462 ~ 22866581 (+) False XLOC_007279
TCONS_00014394 lncRNA downstream 104566 24215046 ~ 24217788 (+) False XLOC_007292
TCONS_00016205 lncRNA downstream 120431 24230911 ~ 24234703 (+) True XLOC_007293
TCONS_00015973 lncRNA downstream 167116 24277596 ~ 24280411 (+) False XLOC_007296
TCONS_00014400 lncRNA downstream 167567 24278047 ~ 24283714 (+) False XLOC_007296
TCONS_00014401 lncRNA downstream 169740 24280220 ~ 24283708 (+) False XLOC_007296
TCONS_00014392 mRNA upstream 31403 24042760 ~ 24043851 (+) True XLOC_007290
TCONS_00014391 mRNA upstream 40556 24033718 ~ 24034698 (+) True XLOC_007289
TCONS_00014389 mRNA upstream 75688 23970818 ~ 23999566 (+) False XLOC_007288
TCONS_00014390 mRNA upstream 96730 23970832 ~ 23978524 (+) True XLOC_007288
TCONS_00014386 mRNA upstream 105081 23874062 ~ 23970173 (+) False XLOC_007287
TCONS_00014395 mRNA downstream 104566 24215046 ~ 24221965 (+) True XLOC_007292
TCONS_00014396 mRNA downstream 130761 24241241 ~ 24244034 (+) True XLOC_007294
TCONS_00014397 mRNA downstream 148082 24258562 ~ 24262791 (+) False XLOC_007295
TCONS_00014398 mRNA downstream 148082 24258562 ~ 24262815 (+) True XLOC_007295
TCONS_00014399 mRNA downstream 167076 24277556 ~ 24279957 (+) False XLOC_007296
TCONS_00014372 other upstream 702782 23187112 ~ 23372472 (+) True XLOC_007280
TCONS_00014367 other upstream 919598 23076127 ~ 23155656 (+) False XLOC_007280
TCONS_00014351 other upstream 1756253 22316234 ~ 22319001 (+) False XLOC_007271
TCONS_00014324 other upstream 2329770 21739616 ~ 21745484 (+) True XLOC_007257
TCONS_00014315 other upstream 2396337 21671107 ~ 21678917 (+) False XLOC_007255
TCONS_00014405 other downstream 246920 24357400 ~ 24357517 (+) True XLOC_007298
TCONS_00014442 other downstream 2686424 26796904 ~ 26830566 (+) False XLOC_007327
TCONS_00014490 other downstream 6303297 30413777 ~ 30424854 (+) False XLOC_007352
TCONS_00014495 other downstream 6477487 30587967 ~ 30620257 (+) False XLOC_007356
TCONS_00014499 other downstream 6630508 30740988 ~ 30741116 (+) True XLOC_007359