RNA id: TU142758



Basic Information


Item Value
RNA id TU142758
length 18724
lncRNA type inter_gene
GC content 0.37
exon number 2
gene id G125722
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id CI01000024
NCBI id null
chromosome length 8644187
location 7916804 ~ 7935557 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome
species grasscarp
(Ctenopharyngodon idella)

Sequence


CGGTGTATCTTATGGTTGTATTGTCAGTCACTGCATAGGAGAAAACGCCTTCTGTGTCTCACAGCAAACAAACTAAATATTACAAAATGGTTAAACAATTACAGAAAATTTATTCATAAGGTTTTAAATTGTAGTCTTGTTTAACATTATGCAATCCTCCGAAACGAGCAGCACAAGTCACGAACAGAAATGTTATTTCATATTAAGTAGATGAGTAAACTGCTTTCAATAAATTCGACTAAAAACAACATTAAATCATTAAAGCCACGATTTTAATATTAATACATGGGAATTCATATACATTCACACTTTACGTTACATGATTTACGTTTTTATTGCTGTTAATACGTAAGTATTTTTACGTTTTAGTCCTCTAAATACGTCAGTGTTGTACGTTTTTGTGTGTATGAAAACGTAAGTAAATGTACGTGTGGTAGAACCACACTTTACGTAAAAATACACACGTTTTCTCATGAGATCACGTTGGATAAAACACATCTCTATAATTTTAAACATTAGTGAGCTGTGAGTATAAGCTTTCACACTATAATCTGGGATAAAAATGTTTGATCACTTTTGTTATTATTTTTAATAGAAAACCTTTAACAAGACTTGAAGCGTAATCCTCATGCCTGAAGTGGTTGTAAATGTGACTTTAGATGGTCCTTGTGGACAAATGGACCTTTTTAGTTGAATTTAAGTGTTTCATTAAAGCTCCGTAATTACTTAGCAAATTCTATCCAAAATATATAGCACACAATAACTTTTAAGGTATTAGTGAAGAGTAACTATTCATTTTTTATTGGTTTTCTAAATTAAAGCATGTCTTGTGTACCCATTTGGCATTTGTTAGCTTACATACTGATGTTTTGAAACATCTGCTGTAATCAGCAGATTCCAAGATATTCATTTGTATAATATTTGCAAGAAAAATGATCTGCCTAAGTTCAATACGTTAATATACGGTTGAATGGAAATATAGTTACAATAGCCTACATTACTTTTGTTCAGTATTTAATTTTCATGACCATAATGTCTTTGTTTGAAATGGCTTCATTTTCAGCTATTTATCAAAACAGGCAGGTTTAAATTACTTGAGAAAAAAGGTAAATGAGATATCAGAACTTCAGGAAAGCAATGAGCCAAACGACACAAACACTTTTTGCATATATCACTTTCAGACCAGACTTATTTATTAGCTATTAGGGCGGCCTGTGATGAAGTTGTCTGTTTCTCACCCTTATCTGTGCATCTATTAAAGACTGTGAAGGCCCTAAATATGCATCAATACTAGTAGCATTAAGAAGTCGGTTAGAAGAAAAACAGCTGTTTAGCATTTACTGTGCTGAGTCACTATACTGAGATATTTGATGTTATATGAATGTTGACTTCTAATCATATTCAGTAGAACCATAGTAAGATTTCAGCATAAATAACAGTAAAATATTTTGTAATGTGAAGAAATAAAAAAGTATTCTTTCTTACAGAGCGATGTAAGCTAAACTAGCTAAAGTTATTCCCCCAAAGTTTTTTTCTCTGCAACTTTTTCAAATGAAACTTTTATCATAAGTTGAACAAAACTTCCATTAGGTTTTCTCATTAAATAACCATTAAGACTACTAAATTATACACAACCTCAGTTGAAGGTGAACATTTTGATATGGAACTTTTAACATAATATGATAATGTTGGTTATCAACAGAATGTTAAAACACAGGGGGTAGGATCTAGTTTTTGACATGCATGAAGAATGACCAGTACACCTTAGTTGTATCACTTTTTGAACAATTCAGCCTTAGTTAGTACTCTCATGTAGGTGGCCAGTGTTAATTTAGTTGACAAATAATTTTCGTTATCATTCGTCATATTGACATTTTTGTCAACGAATCCGTGCATTCGGACTTGACAGCAGTCTAATAAACCAGCTGTTGCTGTCCGTCATTAATGTTAATCAAACAACAAAAAAAGAAAATCACTCAATGCTCTTGACTGAATAATTTTAATAACTTTAAGGATTAATCTTTATTTAATTTATACAAATAAATATGTCTGATTGAAAGAATGAAGAATGTTGTATGCAAGTTATTATAAAGAATATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCATTTTCAGCCTTGTGTAGTGCTTTGTAGAAACGGTATAGGCAGGGAAACGTATATTTTCTGTCTGCACTGTAAGAGCTGCTCACGCTCTGCATATCATTTGTTGTCATGAGATAGACTGACTGGTGAAAAACACTCTTCTGTCAGGCCCTACTGAACATCTCCCACAATGCCTCAGCAGACATATATCTTCTCTGCTGTTTCCTTTAATAAAGAACACTTCCCCTACATTCTCTCTCACTTTTTTAACAACTTTTCAGTGCATGTGCGGCAGAGAGAATCTGGTAAAAACTCTCTTTTAGACTAACAGCAGGTGTGCTAACAAGGCTGTTGGCACAATAGTGCAGGCATCTTTTTGTTCTAGCTCAGTGATGGTAAGATGAAACTCCTACAAAACATTTTATTTACTTAAATTGCTTTTGACTGTGCACTCATTTTTTACTTTAACTTTCACGATGACGTGTAGGCTAATGACCTGTACTGACCGCATATTTTATAAGATATTTGTCAATGACAATCAGGATCTGTTGCACACCAAATCCTCCACCATTGCCTTGTCAGTCATCTCTCTTCACTCTCGTCACGTGATAAGTGAAATCTGAATCCTGCTGCTCTGTGCTTTGACTCTGCAGCTCGTGCTGTATTGAGCAGAACAGACACTTTCAGTTTATAATTGTAGCATCCATTGTCCAACTGAATGAATTGGTTTTTATTTCTATAAAAAAAAGCAAGACAACAGTGGGGCCGGTGTCGTGGTGGGCAAGTAATGTGATCATGTACAGGCAAACACAGAGTAACACCGGTAACACCGCCTACTGCAGCAAGCTTAGAGAGGAAACATCTTTTTTTTGTAGAATTGACAGTACAGCTAATTTTGCTTTTCTAGCAGCCATTCTCCAGAGATTTCACCCATTGCATTCTCAGCTTTGGCTTCTAGCTGATTGTAATCCTGGTTCAACAGGAAAAATAATTTCACTTTGATCTCTGGATGATGAGAGCTGCTATTACACTGACTTGTGCTGATTAAAGCTTTCTCGCAATGCATAATGGGAGTCAACATTTGTAAAAGCCAAGCGGATATGTGGGCTTTTGGTAAAGCCTTGTAGAAAACAAGACATCTTTAACGTCCTGTTGCATGTATCAGTAATAACTCCCAATTATAAGAGTTGCTGGTCTCCTCTGATAGGGAGCAGGAAGGAAAGCAGCAGGAAAAAAGAAAACAGTGCTAAATGCATTTTATAATCATGCATAGACCTATGAACTTTTTGTTGATGTCAAAGGCTGTGACCATTCAAACTGTATTTTACTGTACTGTATTGTGCGTGTGTGTACAGTATATCACCTCATATATCAACTAATGCATTTGTTCTGGTGCTTGAAAGGATCCTATTTGTGTGAACATATAGATAACACATAACTGCTACTTACCCTACTAAATGTCGCCTCCTCTGTATTATCTGTTAAAGACGCACAGCTGTGTCAGAAGCATTCAGTTTAACAGCAACCAAATAACTTTAGGCATATCGAATGCATCAATGTCATGTATCTGTGTTGACAGTTCCCTAACTGTGTTTTCTTAAAGGGAACGATTTTTAGATGGACCATCTTTTTATCCTGAATCCCAGGGCTGTTGATTAGATTGTCTGAGGCCAAATGAGTGTCGGATGACTTTCATTACAGTCATTAATCCATCAGTTGAGTTTCAACGAGGCTCTGACGTGTCACAAATTAGGATGGAGTGGAGTACAACTCTGGTTTGATGTTCTGATTGTTCATATTTGTAGGTACTCTGACCGATTCGAGAATACATGCGTGTATGAGTGTGTGTGTGTTTTATGAGCCGTGTCCTTTGAAGGCGATCTGCAAGTGACCAGCCACTCTGTCTTTTTATGGGAGTTTTATGGAGCCTCTCCCAGATGGTGGATAGATAGGTGTTAGATTGTGACTGCTATAATAGGCCACAGGACAAAGTGGTCCATCTCTGGCCTTGACACGCTCTGGGGATTGAAACTCAAGAGTGTATATATATCAAGCCACCGCTGGTTAATAAAATATTCCATCATATCTGTCAGCAGGAAAGCTTTTTGTGCTCAAGTCTGAAGTGCCCAAGGCTATCTATGAAGCACGGGGACTGATGAAGTCTTTGTTTCTTTAGATATGGTCATCTTAAATCATCAATTTACAGTGCTTACAGTAGCTTTTATATCCTTTCCAATAGCTATGAAGTAAACATAGACTTCCTGAAAGCTTTAAAAAAATATTTAATTGTGACATTTCTGCTTTTGTTTTCCTTTTGATTTTTAAGTCAGTTCATATGACATTTCTTTTTCTGGATAAAGAGCTGTGGAGCACACAAATAGATGCATTAAACTGTCAAAGGCATATTTTTAAGTCAAAACAATGATGTGTGCATGTATTGTGATCGTGTCTGTTAATGTTTTGTTCACGAGTTCACATATCCATAAAATTAAATAGAGTAAAGTTATGCGTATTTGGCGTGCTGTCCGGGGAGAGGGCTCTGAGCTCGGAATTTTGGCCCGAACCCAGAGTACTCCCCCCAGTGTGGTAAAAGTAGATAGAACTAGAAGTGAGGAGATGGGGTGGAGGAGGGATGCTGATAAACTCTCAGATGAACAGAGGTAAGTCTGCTGAATTTATACCTCTTGACACTGGTTGAGATGATTAACTGAATGCTCTCCACCTGTGCAAATTAGGTTAATAATCTGAACTTGCTCCTCCCGAACTTTGTTAATAAAACATCATATGTCAGAAGAGTTCACGAGTTCACGAGAATGAGACGAGATAAGATTTTTACACAGTATTTTTAAGAAATCCTCAATGATGAAATACATGACTAAAAAAATAGTCTGC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Function


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Neighbor


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TU142760 lncRNA downstream 705 7905914 ~ 7916099 (-) True G125724
TU142762 lncRNA downstream 99317 7802573 ~ 7817487 (-) True G125726
TU142803 lncRNA downstream 249612 7666916 ~ 7667192 (-) True G125763
TU142801 lncRNA downstream 252146 7664450 ~ 7664658 (-) True G125761
TU142800 lncRNA downstream 254174 7662420 ~ 7662630 (-) True G125760
TU142840 lncRNA upstream 40234 7975791 ~ 7976047 (-) True G125798
TU142843 lncRNA upstream 45301 7980858 ~ 7981094 (-) True G125801
TU142844 lncRNA upstream 47357 7982914 ~ 7983167 (-) True G125802
TU142861 lncRNA upstream 80095 8015652 ~ 8015945 (-) True G125819
TU142867 lncRNA upstream 92225 8027782 ~ 8027990 (-) True G125825
CI01000024_07858315_07901816.mRNA mRNA downstream 14866 7858157 ~ 7901938 (-) False CI01000024_07858315_07901816
CI01000024_07847824_07855700.mRNA mRNA downstream 60463 7847573 ~ 7856341 (-) True CI01000024_07847824_07855700
CI01000024_07697986_07832289.mRNA mRNA downstream 84515 7697986 ~ 7832289 (-) True CI01000024_07697986_07832289
CI01000024_07672858_07695341.mRNA mRNA downstream 220979 7672593 ~ 7695825 (-) True CI01000024_07672858_07695341
CI01000024_07604312_07619531.mRNA mRNA downstream 297273 7604312 ~ 7619531 (-) True CI01000024_07604312_07619531
CI01000024_08161023_08259943.mRNA mRNA upstream 224733 8160290 ~ 8259943 (-) True CI01000024_08161023_08259943
CI01000024_08260814_08264845.mRNA mRNA upstream 325257 8260814 ~ 8264845 (-) True CI01000024_08260814_08264845
CI01000024_08292984_08380058.mRNA mRNA upstream 357427 8292984 ~ 8380058 (-) True CI01000024_08292984_08380058
CI01000024_08450580_08455758.mRNA mRNA upstream 515005 8450562 ~ 8457764 (-) True CI01000024_08450580_08455758
CI01000024_08460577_08479254.mRNA mRNA upstream 524912 8460469 ~ 8479690 (-) True CI01000024_08460577_08479254
TU142437 other downstream 558700 7357705 ~ 7358104 (-) False G125457
TU142439 other downstream 558700 7357754 ~ 7358104 (-) True G125457
TU142441 other downstream 559209 7357237 ~ 7357595 (-) False G125457
TU140468 other downstream 3974880 3936042 ~ 3937057 (-) True G123701
TU139935 other downstream 5361768 2547460 ~ 2555036 (-) True G123233
TU142839 other upstream 40110 7975667 ~ 7976047 (-) False G125798

Expression Profile