RNA id: TCONS_00016677



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00016677
length 136
RNA type rRNA
GC content 0.51
exon number 1
gene id XLOC_008299
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007126.7
NCBI id CM002899.2
chromosome length 48040578
location 6559050 ~ 6559185 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


tgctgtggtgacccctgattaacaaagggagagagccgaaaagaaaatgaatgactgtaacatgaagctaagcagggctgcgcccggtcagtacctggatgggagaccacatgggaaagctaagttgctgccggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000120374

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00018887 lncRNA upstream 398547 6159009 ~ 6160503 (+) True XLOC_008297
TCONS_00018886 lncRNA upstream 705708 5841557 ~ 5853342 (+) True XLOC_008291
TCONS_00018885 lncRNA upstream 1087542 5468360 ~ 5471508 (+) True XLOC_008289
TCONS_00018884 lncRNA upstream 1088199 5468098 ~ 5470851 (+) False XLOC_008289
TCONS_00018883 lncRNA upstream 1280147 5277903 ~ 5278903 (+) True XLOC_008279
TCONS_00018756 lncRNA downstream 226464 6785649 ~ 6786055 (+) True XLOC_008304
TCONS_00018888 lncRNA downstream 308091 6867276 ~ 6875548 (+) True XLOC_008306
TCONS_00018757 lncRNA downstream 581225 7140410 ~ 7140882 (+) True XLOC_008308
TCONS_00018758 lncRNA downstream 1175304 7734489 ~ 7737531 (+) True XLOC_008311
TCONS_00016691 lncRNA downstream 1246594 7805779 ~ 7805920 (+) True XLOC_008312
TCONS_00016676 mRNA upstream 65435 6459847 ~ 6493615 (+) True XLOC_008298
TCONS_00016675 mRNA upstream 77066 6459847 ~ 6481984 (+) False XLOC_008298
TCONS_00016672 mRNA upstream 440382 6109861 ~ 6118668 (+) False XLOC_008296
TCONS_00016673 mRNA upstream 440382 6114109 ~ 6118668 (+) False XLOC_008296
TCONS_00016674 mRNA upstream 440382 6117502 ~ 6118668 (+) True XLOC_008296
TCONS_00016678 mRNA downstream 93211 6652396 ~ 6666303 (+) False XLOC_008300
TCONS_00016679 mRNA downstream 102158 6661343 ~ 6666232 (+) True XLOC_008300
TCONS_00016682 mRNA downstream 214691 6773876 ~ 6784279 (+) False XLOC_008303
TCONS_00016683 mRNA downstream 215809 6774994 ~ 6784965 (+) True XLOC_008303
TCONS_00016684 mRNA downstream 227572 6786757 ~ 6807963 (+) True XLOC_008305
TCONS_00016665 other upstream 703825 5855111 ~ 5855225 (+) True XLOC_008292
TCONS_00016634 other upstream 3052627 3506309 ~ 3506423 (+) True XLOC_008259
TCONS_00016623 other upstream 3873344 2685055 ~ 2685706 (+) True XLOC_008246
TCONS_00016622 other upstream 3884460 2673935 ~ 2674590 (+) True XLOC_008245
TCONS_00016611 other upstream 4200425 2358511 ~ 2358625 (+) True XLOC_008239
TCONS_00016680 other downstream 119336 6678521 ~ 6727082 (+) True XLOC_008301
TCONS_00016681 other downstream 211401 6770586 ~ 6772120 (+) True XLOC_008302
TCONS_00016699 other downstream 2123637 8682822 ~ 8682937 (+) True XLOC_008317
TCONS_00016700 other downstream 2172567 8731752 ~ 8731866 (+) True XLOC_008318
TCONS_00016703 other downstream 2479865 9039050 ~ 9039164 (+) True XLOC_008321