RNA id: TCONS_00016703



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00016703
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.60
exon number 1
gene id XLOC_008321
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007126.7
NCBI id CM002899.2
chromosome length 48040578
location 9039050 ~ 9039164 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GCCAGAacctagctctctgcaactctcgcaTGGTCACCCACTgcagctaagcagggctgcgcccagtcagtacctggatgggagaccacatgggaaagcgaggttgctgccggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000188174

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00016701 lncRNA upstream 274021 8762580 ~ 8765029 (+) True XLOC_008319
TCONS_00018889 lncRNA upstream 274937 8762474 ~ 8764113 (+) False XLOC_008319
TCONS_00016691 lncRNA upstream 1233130 7805779 ~ 7805920 (+) True XLOC_008312
TCONS_00018758 lncRNA upstream 1301519 7734489 ~ 7737531 (+) True XLOC_008311
TCONS_00018757 lncRNA upstream 1898168 7140410 ~ 7140882 (+) True XLOC_008308
TCONS_00016708 lncRNA downstream 166100 9205264 ~ 9211131 (+) True XLOC_008325
TCONS_00016715 lncRNA downstream 374989 9414153 ~ 9418151 (+) True XLOC_008329
TCONS_00016716 lncRNA downstream 412814 9451978 ~ 9457382 (+) True XLOC_008330
TCONS_00018759 lncRNA downstream 601523 9640687 ~ 9649456 (+) False XLOC_008331
TCONS_00018890 lncRNA downstream 608454 9647618 ~ 9648249 (+) True XLOC_008331
TCONS_00016702 mRNA upstream 239073 8767650 ~ 8799977 (+) True XLOC_008320
TCONS_00016698 mRNA upstream 638959 8394819 ~ 8400091 (+) True XLOC_008316
TCONS_00016697 mRNA upstream 656053 8335600 ~ 8382997 (+) True XLOC_008315
TCONS_00016696 mRNA upstream 657539 8335600 ~ 8381511 (+) False XLOC_008315
TCONS_00016695 mRNA upstream 803521 8192720 ~ 8235529 (+) True XLOC_008314
TCONS_00016704 mRNA downstream 13895 9053059 ~ 9069172 (+) True XLOC_008322
TCONS_00016705 mRNA downstream 33657 9072821 ~ 9089507 (+) True XLOC_008323
TCONS_00016706 mRNA downstream 78166 9117330 ~ 9184449 (+) False XLOC_008324
TCONS_00016707 mRNA downstream 81890 9121054 ~ 9184057 (+) True XLOC_008324
TCONS_00016709 mRNA downstream 255456 9294620 ~ 9297563 (+) False XLOC_008326
TCONS_00016700 other upstream 307184 8731752 ~ 8731866 (+) True XLOC_008318
TCONS_00016699 other upstream 356113 8682822 ~ 8682937 (+) True XLOC_008317
TCONS_00016681 other upstream 2266930 6770586 ~ 6772120 (+) True XLOC_008302
TCONS_00016680 other upstream 2311968 6678521 ~ 6727082 (+) True XLOC_008301
TCONS_00016677 other upstream 2479865 6559050 ~ 6559185 (+) True XLOC_008299
TCONS_00016712 other downstream 264645 9303809 ~ 9311478 (+) True XLOC_008326
TCONS_00016719 other downstream 856694 9895858 ~ 9895986 (+) True XLOC_008335
TCONS_00016731 other downstream 2526227 11565391 ~ 11565509 (+) True XLOC_008343
TCONS_00016757 other downstream 4485710 13524874 ~ 13524988 (+) True XLOC_008360
TCONS_00016758 other downstream 4918558 13957722 ~ 13957850 (+) True XLOC_008361