RNA id: TU281430


Basic Information

Item Value
RNA id TU281430
length 19031
lncRNA type antisense_over
GC content 0.38
exon number 2
gene id G247947
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000058
NCBI id null
chromosome length 5213219
location 1714284 ~ 1733492 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome
species grasscarp
(Ctenopharyngodon idella)

Sequence

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Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU281431 lncRNA upstream 7901 1686779 ~ 1706383 (+) True G247948
TU281619 lncRNA upstream 37131 1676857 ~ 1677153 (+) True G248112
TU281609 lncRNA upstream 96364 1617351 ~ 1617920 (+) True G248104
TU281606 lncRNA upstream 97270 1616576 ~ 1617014 (+) True G248103
TU281476 lncRNA upstream 163434 1492179 ~ 1550850 (+) True G247993
TU281458 lncRNA downstream 14278 1747770 ~ 1752339 (+) True G247975
TU281625 lncRNA downstream 90297 1823789 ~ 1823990 (+) True G248118
TU281629 lncRNA downstream 98577 1832069 ~ 1832368 (+) True G248122
TU281635 lncRNA downstream 103816 1837308 ~ 1837522 (+) True G248128
TU281642 lncRNA downstream 118182 1851674 ~ 1851901 (+) True G248135
CI01000058_01625351_01664692.mRNA mRNA upstream 48490 1625351 ~ 1665794 (+) True CI01000058_01625351_01664692
CI01000058_01580247_01591754.mRNA mRNA upstream 122031 1579663 ~ 1592253 (+) True CI01000058_01580247_01591754
CI01000058_01496481_01498802.mRNA mRNA upstream 214474 1494870 ~ 1499810 (+) True CI01000058_01496481_01498802
CI01000058_01431719_01434294.mRNA mRNA upstream 279771 1431559 ~ 1434513 (+) True CI01000058_01431719_01434294
CI01000058_01391493_01394283.mRNA mRNA upstream 319865 1391493 ~ 1394419 (+) True CI01000058_01391493_01394283
CI01000058_01740599_01784355.mRNA mRNA downstream 7107 1740599 ~ 1784676 (+) True CI01000058_01740599_01784355
CI01000058_01794468_01800421.mRNA mRNA downstream 60976 1794468 ~ 1800421 (+) False CI01000058_01794468_01800421
CI01000058_01838039_01842964.mRNA mRNA downstream 104547 1838039 ~ 1843230 (+) True CI01000058_01838039_01842964
CI01000058_01957358_02009847.mRNA mRNA downstream 223866 1957358 ~ 2009847 (+) True CI01000058_01957358_02009847
CI01000058_02028188_02037502.mRNA mRNA downstream 294657 2028149 ~ 2037628 (+) True CI01000058_02028188_02037502
TU281423 other upstream 257837 1452997 ~ 1456447 (+) True G247940
TU281473 other upstream 426014 1228609 ~ 1228623 (+) True G247990
TU280966 other upstream 1117113 592331 ~ 597171 (+) True CI01000058_00592498_00596709
TU280659 other upstream 1258540 435042 ~ 455744 (+) True CI01000058_00435196_00437830
TU281441 other downstream 62221 1795713 ~ 1795757 (+) True G247958
TU283772 other downstream 2960916 4694408 ~ 4696910 (+) False G250039
TU283769 other downstream 2960970 4694462 ~ 4696910 (+) False G250039
TU283770 other downstream 2960970 4694462 ~ 4697161 (+) False G250039
TU283771 other downstream 2960970 4694462 ~ 4697032 (+) True G250039

Expression Profile