RNA id: TU281433


Basic Information

Item Value
RNA id TU281433
length 13946
lncRNA type inter_gene
GC content 0.40
exon number 3
gene id G247950
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000058
NCBI id null
chromosome length 5213219
location 1927222 ~ 1941268 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome
species grasscarp
(Ctenopharyngodon idella)

Sequence

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Function

GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
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TU281659 lncRNA upstream 50040 1876979 ~ 1877182 (+) True G248152
TU281647 lncRNA upstream 67242 1859734 ~ 1859980 (+) True G248140
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TU281474 lncRNA downstream 57602 1998870 ~ 2003167 (+) True G247991
TU281452 lncRNA downstream 62029 2003297 ~ 2056291 (+) True G247969
TU281681 lncRNA downstream 100903 2042171 ~ 2280818 (+) True G248173
TU281690 lncRNA downstream 117774 2059042 ~ 2061224 (+) True CI01000058_02052152_02085378
TU281717 lncRNA downstream 148989 2090257 ~ 2092730 (+) True G248208
CI01000058_01838039_01842964.mRNA mRNA upstream 83992 1838039 ~ 1843230 (+) True CI01000058_01838039_01842964
CI01000058_01794468_01800421.mRNA mRNA upstream 126801 1794468 ~ 1800421 (+) False CI01000058_01794468_01800421
CI01000058_01740599_01784355.mRNA mRNA upstream 142546 1740599 ~ 1784676 (+) True CI01000058_01740599_01784355
CI01000058_01625351_01664692.mRNA mRNA upstream 261428 1625351 ~ 1665794 (+) True CI01000058_01625351_01664692
CI01000058_01580247_01591754.mRNA mRNA upstream 334969 1579663 ~ 1592253 (+) True CI01000058_01580247_01591754
CI01000058_01957358_02009847.mRNA mRNA downstream 16090 1957358 ~ 2009847 (+) True CI01000058_01957358_02009847
CI01000058_02028188_02037502.mRNA mRNA downstream 86881 2028149 ~ 2037628 (+) True CI01000058_02028188_02037502
CI01000058_02052152_02085378.mRNA mRNA downstream 110695 2051963 ~ 2085455 (+) False CI01000058_02052152_02085378
CI01000058_02227590_02229507.mRNA mRNA downstream 286150 2227418 ~ 2230021 (+) True CI01000058_02227590_02229507
CI01000058_02348646_02354404.mRNA mRNA downstream 407347 2348615 ~ 2355085 (+) True CI01000058_02348646_02354404
TU281441 other upstream 129490 1795713 ~ 1795757 (+) True G247958
TU281423 other upstream 470775 1452997 ~ 1456447 (+) True G247940
TU281473 other upstream 638952 1228609 ~ 1228623 (+) True G247990
TU280966 other upstream 1330051 592331 ~ 597171 (+) True CI01000058_00592498_00596709
TU280659 other upstream 1471478 435042 ~ 455744 (+) True CI01000058_00435196_00437830
TU283772 other downstream 2753140 4694408 ~ 4696910 (+) False G250039
TU283769 other downstream 2753194 4694462 ~ 4696910 (+) False G250039
TU283770 other downstream 2753194 4694462 ~ 4697161 (+) False G250039
TU283771 other downstream 2753194 4694462 ~ 4697032 (+) True G250039
TU283837 other downstream 2885108 4826376 ~ 4849531 (+) True G250094

Expression Profile