RNA id: TU344066


Basic Information

Item Value
RNA id TU344066
length 8078
lncRNA type antisense_over
GC content 0.40
exon number 2
gene id G302902
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000091
NCBI id null
chromosome length 1322612
location 121975 ~ 130074 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome
species grasscarp
(Ctenopharyngodon idella)

Sequence

TCAACTGCTATTGGGAAACTGCAACTGATGTTAGCTGAATGCAGCCATGACCTTACCTGAACTCTGCAGCCATTCTGTCATCGTCTGTTTCACATCAAATGAGAGCCAGCGATTGGACCAATCCTTGGAGACAAAGCGGGTGCCCAGATATCGAGCCTGATCACCTACTCCACGATACAGTTCCAGCCTCTGCTCTTGGTCCATGGTGGGATTCTTAATCCGAAGCCGTAACTCAGCTTGAGACAGCAGCCGGTAGTCTGGAATACTCTGTCTCATCTCTGATACATTAAAAAACATCTGATGCTTTGTGCCATTCTGAGCTAGAGATAAAGTGAGAAATAGAAAAGTTCATGGTTGTTTTATAGCTCAGACAACAGACCACTTTTTTGTCAGATAAACCACCAAAGCAAAAATAAGCCATAGATTCGCCTGGTTAATGGCATCAAATCTTTGATAGATATTCAGAGTTTTGTTTGAGGGACTGGGTATCCATGAGCATCCAATCATATATTCTGCTTTGTTTGATTTTTTTTTTTTATCTTTTCATATCAGTCAGATGGACTATTTCTGTTTCAGTAGGTGGTTCGTAGTCAGAATCACCTGCTAACTGCTACCACAGTTTACAATACAGGTAAGACAGCATTAATGTTGTATGTCTAAATGAGACTTACTATATGCTGCCCTTGTCTATATTTTGGCTGAAGCTGTAATTTAAAGAGAAAGCCATCATTAAGCTGTGTTTGGGGTTGCTATAGCCTAACTGTTTTTGCTGATGTTTAATATAGGGAGGAGGCCCATGGTGTGGGATGAGTTACACACCATAGTTTAATATTTATGATTTCATTTGAATAAAATCTTAATCGTAATTGTGTCACATTATTGGTGGCTATATGTTTACTTGGAAACATATAGAAATCAACTGAGATGGAGCCAATGGCAGACTGAGATGAAGTCGGTGGAAGTGGAGAAAGTGTGGAGCCAGGGAGTGGAGCCAGGGTGCCAGAGGACTGGGGATAAGCCGGTTAGATTAAGGACCAAGGCAGAATCAGAGGAAAGGCGAAGCCCGATGGAGCCAAAGGGGTGGAGGGATGAAGTACAGCTGAAGGCCGGGAAGTCTATGGCACAGGCTAGAGTGATGAATGACCAAGACAGAACCAGAGGGATGAGGGAGCCCAGTGGAGCCGTAAGGATGATGGTTCCATGTGGAGTCGAGGGAGGGAGGAGCTAAGGTGGAGCTGACTGGTCAGTGAGCTGAGGTGGAGTGAAGAGTTCAGCTGCTAGAGGCAAAGCCAAGGGATCCTCTTGCCAAGGTGGAGTTGGAGACTGGAAGACTCAAGACAGATCCACATGATCCGCAAGACTGAAGGAAAATAGCTGAGGTGGGACCAGGGAACTGGCTGTCTTAAGTAGAGGGAGTGGTAGAGGGAGGATGGGCAGTGTGGGCAGGGCTTCTTTCAATCCTCTCGTACTCCACAAGCATGTCCACTGGAACTTGACAGTTGAAATCCTATAGAAGGAACATAAGCCGTCTTGCTGGCTTATGCACCTGGTCAGACTCTTCGTTAGGCTCAGGCTCTGGGGCAATGGTCTTGCTCTCTGGCCTTGCATTGCAGCAGGCTCAGGCTCTGTCTCTGCGGTGGGCTCCTGGCTGGGTTCCGGGTCCAGAGTGGGCCTGGTAATGTCCTCCTCAGTGGGGCAGATGGTAAATGGAGATCAGTTTGTCCCCAGCACCCACTCCACGAATACGGCAAATGTCTCTCGAGGACCTTCACCGGGCAGGCGTGCCTTGGTTCGCTCATCAGTCAGTGGTTTGGAGCGTGTATCAAACTGCCAAAGTCACGTGAGCTATTGAAATTTCGAAACACTTTTGACATATCACATGACTTTGGCGATCCGAACCACTGATTCGAAACCAAAAGATTTGTAAAGCTTCGAAGCTTCATGAAGCAGTGTTTTGAAATCGGCCATCACTAGATATTGTTGAATAAAGCCGTTATTTGTTTGTTTTTTTTGGCGCACAAAAAGTATTCTCATCGCTTCATAACATTAAGGTTGAACCACTGTAGTCACATGAACCATTTGAAATATATTGTTGGTACCTTTCTGAGCATTTGAAAGTGTTATTTGAAAGTATATTATTATCTTGCTGTCAATGCAGGCCTCACTGAGCCATCGGATTTCATCAAAAATATCTTAACTTGTGTTCCGAAGATGAACGAAGGTCTTGCGGGTGTGGAACGACATTAGGGTGAGTAATAAATGACAGAATGACAGACATTTTTGGGTGAACTAAGCCATTAAGATTTTGAGGTAGTTCAAACATTAGTATTCAGGTAACAAAGACCTCAGAAATTTAACAAAATAATCACATGTAAAATAACGCCATATTCTTCACTGTATAAATTAAATATAGATTATCCTTATTAAAGCTTCAAAAGTTATTCAGTCAAGAGCAGTTAGTTAATTTCTCTTTGTCTTTTGTTCTTTGATTAACATTAATGACACAAAATGCAACCAGTATATTAGGCTGCTGTCACTACCGATCTCAAATCAGTACTGACGTGCTGTCTGTGAAGCTGCTTTCTATGCCCGCATTTCAGGTGTGTGCACATAGAAAAGCTTCACAGACAGCGTGTCAATACCAAATTTAGTTCTCTTTTGCATCTTATCATGCTTGTATGGTTTAAAAGGCCTTGAATAAATGATTGGCTGATATTTATGCTTTAATATAATTTCTTTTGTTTTCTTTTGGCCTCGCGTTGAAATGTGACCTGTACATGCTTTCATAGTATATTAAGATCTTTCTCTAAAGCAATGGGAAACAGATGATTCTCATAAGCTTGGTGCTACACTTTAATGGCATGTTCTATTCACCATCCACTGTTAAGGGATATAATGTATTGATTATATTCAGTATGGGTTCCATGCATCAACACCTGTGATCACACATAAAAAGGCTCAATGAACTACTAGAGAATAGGGTGGAGTGGGATTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGCGCGTGCGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTACACAGGCTGGTGCTCAGGTAAGCTCAGGACAGCTGTCCTAACAGGCACTGAGACAGACCTATCATTAGTAGTGGGTGCAACCAGATTCCAGCAGGCTTAAAAATCTGCCTTTCCAACACATGCTTTACCCTTCCTGTCCTCTTACCGTCGCCTTGCATAGAATCACAACTCTCTCTTTTCTTAACTATTCTGTTCCAATCACATTAAGCCATGACACACTTTTCCGGGCAGATGAGCTCTGCAGTCAGCACAATCTTTGACATGTAATAACATGATATGAAAAGTAGCACATATACAATAAAACAGACTGATTAGTCTAAAGAAAAACATGGAAAATTAGACATGCCTGCAGGACATGACTGTACATAGAGTGCTCTCTATTTGACAACATAATTTATGATTACACAACTGTATGGTCAGTACTAGCTAGAAGGCAAAATCTCTTTCTACCTTCAACTAAAAGATATCAAGTGTAGCAAGCTATAAGGAAAAATAAAGGTTTCAAATAAAAATAATGCAGCCTGATACTATTAGTTTCAAACTAGTATAACTTTTTTGTTTTGTTTTATAGCTGTGGTCAGTACACATGCTCGAGACATAGACAAGTGTTGATGGCAAAATCGGCAACCAGTTTTGGGTCTGCCCTGAGTGTCATGTATGTGTGATACAATGTGACAAAATCTGCAATGTAGCTCTTTGTCAAGCCAAACAACTATGCTACTGAAAAAGTCTTAATGGGTAGAAGGATAGGAACACCATAGATGATGACAGCAATTCCTGCAAAAGCAAATCTGTAATCCTGAAAAATATTTTAACATACATTCATTGCTAAAGTTAGTGGTTCTGACAGACCTATTTCAAAATGGACAACACTATACATAATATGTTTTTCTGGTAACACTTTACAATAAGGTTCATTAGTTAACATTAGTTAACTACATTAGTTAACATGAACTAATAATGAACTGCACTTATACAGAATTTATTAATCTTTGTTAATGTTAATTTTAACATTTACTAATACATTATTAAAATCTTGTTAATGTTAGTTAATGCACTGTGAACTAAGATGAACAAACAATGAACAACTGTATTTTCATTAACTAAAGTTAACGAAGTACATACAGTAACAAATGTATTGCCCATGGTTAGTTCATGTTAGTTAATACATTAACTAATGTTTAACTAATGAACCTTATTGTAAAGTGTTAGCGTTTTTCTGTTCATGTTCAACAGGCCAAAAATATTTTATTGTATTCTTAAATGCATTTAAATGTATTGCAACAATATAAATCATAAATATATAATATATATTAATATATTGGTTTTTGTAAAGCAAGCATGCTATTTCTGCTAGTAGAACAACCTCTAACCCTAAATAAAACATTTTGCCACATAACTGACCCCACACCCCACACTGTTTATGCTGCAGACAAGAATTATACCTCAAATTATGTAGTGTTGCTTGTAACCACCCAGCAACATCCCAGAACACCCTAGCAACCACACAGCAATGTTTTTAAAACACTTATCAAAATCTTAGCAACTGCAGTGCAACACCCTGGCAACCACCCTAGCAGTGCAGCAGGGTGGTTTTCCTTGGTTCAAGCACAATATTCTTCAGTAAATGTAAAAACCTAGGTATTCACAAACAATTGTGGCTCCGATTGCGGAGTGTGATGTTGTGTAATGTTGTATTGCGAAAGAATGCAATTACTACATTACTGATGGTTGTAAATACTGAGTGTGGGAGGCCTTGCAATTGCATCAATGTATTCCACCTTAAACAAATGTAAGAAGCTTTATGCAAACACAAAACATAAAGAAGAGTTTTGTCCCTCAAGGGGAATTGCAAGAGCAGGAATGGTTGCTATTTAGGACTATTTCCTCGCAATCTTAGTCACACCTCAGAAACAAGCAACCC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Function

GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU343597 lncRNA downstream 78069 42712 ~ 43906 (-) True G302504
TU344090 lncRNA upstream 21129 151203 ~ 151551 (-) True G302924
TU344097 lncRNA upstream 34129 164203 ~ 164408 (-) True G302931
TU344100 lncRNA upstream 36683 166757 ~ 166971 (-) True G302934
TU344103 lncRNA upstream 39876 169950 ~ 170450 (-) True G302937
TU344107 lncRNA upstream 41160 171234 ~ 171527 (-) True G302938
CI01000091_00108499_00117102.mRNA mRNA downstream 2866 108220 ~ 119109 (-) True CI01000091_00108499_00117102
CI01000091_00265846_00269683.mRNA mRNA upstream 135766 265840 ~ 270360 (-) True CI01000091_00265846_00269683
CI01000091_00337653_00338300.mRNA mRNA upstream 207573 337647 ~ 338587 (-) True CI01000091_00337653_00338300
CI01000091_00346274_00346930.mRNA mRNA upstream 215943 346017 ~ 347510 (-) True CI01000091_00346274_00346930
CI01000091_00348777_00349430.mRNA mRNA upstream 218393 348467 ~ 349729 (-) True CI01000091_00348777_00349430
CI01000091_00400737_00412559.mRNA mRNA upstream 270366 400440 ~ 412559 (-) True CI01000091_00400737_00412559
TU344246 other upstream 344528 474602 ~ 562944 (-) True G303047

Expression Profile