RNA id: TCONS_00017597



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00017597
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.58
exon number 1
gene id XLOC_008910
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007126.7
NCBI id CM002899.2
chromosome length 48040578
location 1321790 ~ 1321906 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


AGGGTCAGATCCTGCTCTCTgctactctcacatggtcgcccactgaagctaagcagggctgcgcccggtcagtacctggatgggaggacacatgggaaagctaggttgctgctgcaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000178034

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00019111 lncRNA downstream 178721 1140445 ~ 1143069 (-) True XLOC_008908
TCONS_00019110 lncRNA downstream 313431 1007600 ~ 1008359 (-) True XLOC_008903
TCONS_00019109 lncRNA downstream 328203 986144 ~ 993587 (-) True XLOC_008902
TCONS_00019108 lncRNA downstream 328250 986144 ~ 993540 (-) False XLOC_008902
TCONS_00019107 lncRNA downstream 328401 986144 ~ 993389 (-) False XLOC_008902
TCONS_00017602 lncRNA upstream 201566 1523472 ~ 1534219 (-) True XLOC_008912
TCONS_00017604 lncRNA upstream 267907 1589813 ~ 1590795 (-) False XLOC_008914
TCONS_00017607 lncRNA upstream 284943 1606849 ~ 1611693 (-) False XLOC_008915
TCONS_00017613 lncRNA upstream 399681 1721587 ~ 1725484 (-) False XLOC_008918
TCONS_00017624 lncRNA upstream 508364 1830270 ~ 1834822 (-) False XLOC_008922
TCONS_00017596 mRNA downstream 122904 1181423 ~ 1198886 (-) True XLOC_008909
TCONS_00017595 mRNA downstream 124382 1179876 ~ 1197408 (-) False XLOC_008909
TCONS_00017594 mRNA downstream 255521 1045374 ~ 1066269 (-) True XLOC_008907
TCONS_00017593 mRNA downstream 283597 1033244 ~ 1038193 (-) True XLOC_008906
TCONS_00017592 mRNA downstream 284912 1033243 ~ 1036878 (-) False XLOC_008906
TCONS_00017598 mRNA upstream 130928 1452834 ~ 1484795 (-) False XLOC_008911
TCONS_00017599 mRNA upstream 131630 1453536 ~ 1485086 (-) True XLOC_008911
TCONS_00017600 mRNA upstream 172587 1494493 ~ 1534258 (-) False XLOC_008912
TCONS_00017601 mRNA upstream 172591 1494497 ~ 1534232 (-) False XLOC_008912
TCONS_00017603 mRNA upstream 252450 1574356 ~ 1584137 (-) True XLOC_008913
TCONS_00017537 other downstream 896034 425695 ~ 425756 (-) True XLOC_008873
TCONS_00017535 other downstream 972223 349451 ~ 349567 (-) True XLOC_008870
TCONS_00017627 other upstream 513065 1834971 ~ 1837883 (-) True XLOC_008922
TCONS_00017639 other upstream 944063 2265969 ~ 2266083 (-) True XLOC_008927
TCONS_00017647 other upstream 1303122 2625028 ~ 2625663 (-) True XLOC_008933
TCONS_00017655 other upstream 1414477 2736383 ~ 2736498 (-) True XLOC_008940
TCONS_00017689 other upstream 2782502 4104408 ~ 4104526 (-) True XLOC_008968