RNA id: TCONS_00019955



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00019955
length 126
RNA type rRNA
GC content 0.42
exon number 1
gene id XLOC_010035
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 31634470 ~ 31634595 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


AGCAACATCTATAAGATTAAGAATTTCGCAGATACTGAATCTAAGCATGGCTCACTGATGCTGAGCAGGGCTGAACATGGttagtacctgaatgggagatcccatgggaaaactaggttgttgTTT

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000172705

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00021726 lncRNA upstream 499039 31121756 ~ 31135431 (+) True XLOC_010031
TCONS_00021725 lncRNA upstream 506386 31121756 ~ 31128084 (+) False XLOC_010031
TCONS_00021968 lncRNA upstream 539890 31090998 ~ 31094580 (+) True XLOC_010030
TCONS_00021966 lncRNA upstream 1303589 30329863 ~ 30330881 (+) False XLOC_010024
TCONS_00021967 lncRNA upstream 1303589 30330280 ~ 30330881 (+) True XLOC_010024
TCONS_00021969 lncRNA downstream 326313 31960908 ~ 31985059 (+) False XLOC_010041
TCONS_00019972 lncRNA downstream 326321 31960916 ~ 31970381 (+) True XLOC_010041
TCONS_00021970 lncRNA downstream 458117 32092712 ~ 32095588 (+) False XLOC_010047
TCONS_00019987 lncRNA downstream 632524 32267119 ~ 32270270 (+) True XLOC_010051
TCONS_00021971 lncRNA downstream 644404 32278999 ~ 32314568 (+) False XLOC_010052
TCONS_00019954 mRNA upstream 86670 31542645 ~ 31547800 (+) True XLOC_010034
TCONS_00019953 mRNA upstream 117243 31511739 ~ 31517227 (+) True XLOC_010033
TCONS_00019952 mRNA upstream 232316 31396647 ~ 31402154 (+) True XLOC_010032
TCONS_00019948 mRNA upstream 627781 30933044 ~ 31006689 (+) False XLOC_010028
TCONS_00019949 mRNA upstream 667890 30959423 ~ 30966580 (+) False XLOC_010028
TCONS_00019956 mRNA downstream 167608 31802203 ~ 31813015 (+) False XLOC_010036
TCONS_00019957 mRNA downstream 167608 31802203 ~ 31813018 (+) False XLOC_010036
TCONS_00019958 mRNA downstream 169995 31804590 ~ 31812889 (+) True XLOC_010036
TCONS_00019959 mRNA downstream 192907 31827502 ~ 31836739 (+) False XLOC_010037
TCONS_00019960 mRNA downstream 193058 31827653 ~ 31837482 (+) False XLOC_010037
TCONS_00019951 other upstream 663313 30970501 ~ 30971157 (+) True XLOC_010029
TCONS_00019939 other upstream 1553809 30080543 ~ 30080661 (+) True XLOC_010021
TCONS_00019938 other upstream 1597777 30002752 ~ 30036693 (+) False XLOC_010020
TCONS_00019912 other upstream 2418110 29216274 ~ 29216360 (+) True XLOC_010005
TCONS_00019905 other upstream 2615332 29016936 ~ 29019138 (+) True XLOC_010002
TCONS_00019961 other downstream 194443 31829038 ~ 31836487 (+) True XLOC_010037
TCONS_00019968 other downstream 288192 31922787 ~ 31923924 (+) True XLOC_010039
TCONS_00019985 other downstream 557602 32192197 ~ 32196767 (+) True XLOC_010050
TCONS_00019992 other downstream 1038225 32672820 ~ 32672936 (+) True XLOC_010055
TCONS_00020010 other downstream 1708556 33343151 ~ 33343265 (+) True XLOC_010067