RNA id: TCONS_00020086



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00020086
length 116
RNA type rRNA
GC content 0.49
exon number 1
gene id XLOC_010122
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 38021019 ~ 38021134 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TTAAactagctagctctctgcaactctcacatggtcgccaactgaagctaagcaaggctgcaCTCGATCAgttcctggatgggagaccacatggaaaagctaggttgctgttggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000179320

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00021738 lncRNA upstream 307382 37713264 ~ 37713637 (+) True XLOC_010118
TCONS_00021997 lncRNA upstream 360408 37659520 ~ 37660611 (+) True XLOC_010117
TCONS_00021996 lncRNA upstream 379156 37633447 ~ 37641863 (+) True XLOC_010116
TCONS_00020081 lncRNA upstream 417950 37582951 ~ 37603069 (+) True XLOC_010115
TCONS_00021995 lncRNA upstream 1062191 36955088 ~ 36958828 (+) True XLOC_010114
TCONS_00020095 lncRNA downstream 218911 38240045 ~ 38252100 (+) True XLOC_010127
TCONS_00021739 lncRNA downstream 710653 38731787 ~ 38733942 (+) True XLOC_010134
TCONS_00021998 lncRNA downstream 1602990 39624124 ~ 39627370 (+) True XLOC_010142
TCONS_00021999 lncRNA downstream 1606579 39627713 ~ 39628196 (+) True XLOC_010143
TCONS_00022000 lncRNA downstream 1610476 39631610 ~ 39632068 (+) True XLOC_010144
TCONS_00020085 mRNA upstream 76539 37891755 ~ 37944480 (+) True XLOC_010121
TCONS_00020084 mRNA upstream 76705 37891735 ~ 37944314 (+) False XLOC_010121
TCONS_00020083 mRNA upstream 141713 37876779 ~ 37879306 (+) True XLOC_010120
TCONS_00020079 mRNA upstream 390769 37470717 ~ 37630250 (+) False XLOC_010115
TCONS_00020078 mRNA upstream 390769 37470717 ~ 37630250 (+) False XLOC_010115
TCONS_00020087 mRNA downstream 97870 38119004 ~ 38136670 (+) True XLOC_010123
TCONS_00020088 mRNA downstream 117112 38138246 ~ 38157299 (+) True XLOC_010124
TCONS_00020089 mRNA downstream 138624 38159758 ~ 38199760 (+) False XLOC_010125
TCONS_00020090 mRNA downstream 138723 38159857 ~ 38198806 (+) False XLOC_010125
TCONS_00020091 mRNA downstream 146059 38167193 ~ 38200523 (+) False XLOC_010125
TCONS_00020082 other upstream 249419 37771483 ~ 37771600 (+) True XLOC_010119
TCONS_00020072 other upstream 1271695 36748606 ~ 36749324 (+) False XLOC_010112
TCONS_00020068 other upstream 1436234 36582486 ~ 36584785 (+) False XLOC_010109
TCONS_00020056 other upstream 2294887 35726018 ~ 35726132 (+) True XLOC_010096
TCONS_00020045 other upstream 2615132 35402061 ~ 35405887 (+) True XLOC_010091
TCONS_00020097 other downstream 274867 38296001 ~ 38299644 (+) True XLOC_010128
TCONS_00020102 other downstream 329589 38350723 ~ 38352278 (+) False XLOC_010130
TCONS_00020107 other downstream 373279 38394413 ~ 38396795 (+) True XLOC_010132
TCONS_00020117 other downstream 1125868 39147002 ~ 39158182 (+) False XLOC_010137
TCONS_00020126 other downstream 1990735 40011869 ~ 40011991 (+) True XLOC_010148